Integration of Uncertainty Quantification with SCIRun Bioelectric Field Simulation Pipeline

不确定性量化与 SCIRun 生物电场模拟流程的集成

基本信息

  • 批准号:
    10406132
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 22.35万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2021-09-17 至 2022-06-30
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Project Summary This project harnesses mature and modern techniques for uncertainty quantification (UQ) from the computational science and mathematics communities and incorporates them into the established biomedical simulation software framework SCIRun. Just as bioelectric simulation models have become increasingly accurate at representing physical processes and geometry, so also has it become increasingly important to understand the uncertainty stemming from ignorance about precise values of model parameters. To our knowledge, success of this project represents one of the first developments of folding in modern UQ techniques into widely used, freely available software pipelines for simulation of bioelectric fields in heart and brain applications. Successful incorporation of established and proven UQ tools into SCIRun will substantially increase the utility of simulation based biomedical predictions in medical practice. Although there is a need in the research community for such tools, the number and nature of users makes commercial development very unlikely. There are no commercial tools specifically for bioelectric field modeling and while some industry uses these tools, their high intellectual cost and limited market keep them well below the threshold for commercial software.
项目摘要 该项目利用不确定性量化(UQ)的成熟和现代技术 计算科学和数学社区,并将其纳入 已建立的生物医学模拟软件框架Scirun。就像生物电模拟一样 模型在表示物理过程和几何形状方面变得越来越准确,因此 了解无知引起的不确定性也越来越重要 关于模型参数的精确值。据我们所知,该项目的成功代表 现代UQ技术中折叠式折叠的最初发展之一,可自由使用 用于模拟心脏和大脑应用中生物电场的软件管道。成功的 将已建立和已验证的UQ工具纳入Scirun将大大提高公用事业 医学实践中基于模拟的生物医学预测。虽然需要 研究社区的此类工具,用户的数量和性质使商业 发展非常不可能。没有专门用于生物电场建模的商业工具 尽管某些行业使用这些工具,但它们的高知识成本和有限的市场使它们保持 远低于商业软件的阈值。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
On the Computation of Recurrence Coefficients for Univariate Orthogonal Polynomials
  • DOI:
    10.1007/s10915-021-01586-w
  • 发表时间:
    2021-09-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Liu, Zexin;Narayan, Akil
  • 通讯作者:
    Narayan, Akil
共 1 条
  • 1
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  • 发表时间:
    2022
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Maryam Toloubidokhti;Nilesh Kumar;Zhiyuan Li;P. Gyawali;B. Zenger;W. Good;Rob S. MacLeod;Linwei Wang
    Maryam Toloubidokhti;Nilesh Kumar;Zhiyuan Li;P. Gyawali;B. Zenger;W. Good;Rob S. MacLeod;Linwei Wang
  • 通讯作者:
    Linwei Wang
    Linwei Wang
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  • 发表时间:
    2023
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Jake A. Bergquist;Matthias Lange;B. Zenger;Benjamin A. Orkild;Eric Paccione;Eugene Kwan;B. Hunt;Jiawei Dong;Rob S. MacLeod;Akil Narayan;Ravi Ranjan
    Jake A. Bergquist;Matthias Lange;B. Zenger;Benjamin A. Orkild;Eric Paccione;Eugene Kwan;B. Hunt;Jiawei Dong;Rob S. MacLeod;Akil Narayan;Ravi Ranjan
  • 通讯作者:
    Ravi Ranjan
    Ravi Ranjan
The Role of Beta-1 Receptors in the Response to Myocardial Ischemia
Beta-1 受体在心肌缺血反应中的作用
  • DOI:
    10.22489/cinc.2022.216
    10.22489/cinc.2022.216
  • 发表时间:
    2022
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Lindsay C. Rupp;B. Zenger;Jake A. Bergquist;Anna Busatto;Rob S. MacLeod
    Lindsay C. Rupp;B. Zenger;Jake A. Bergquist;Anna Busatto;Rob S. MacLeod
  • 通讯作者:
    Rob S. MacLeod
    Rob S. MacLeod
ASSESSMENT OF THE LEFT ATRIAL SUBSTRATE IN LONE ATRIAL FIBRILLATION: IMPLICATIONS FOR STAGING OF ATRIAL FIBRILLATION
  • DOI:
    10.1016/s0735-1097(10)60781-4
    10.1016/s0735-1097(10)60781-4
  • 发表时间:
    2010-03-09
    2010-03-09
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Nathan Burgon;Troy J. Badger;Nazem W. Akoum;Gaston Vergara;Lori McMullan;Yaw A. Adjei-Poku;Thomas S. Haslam;Jeremy Fotheringham;Eugene G. Kholmovski;Rob S. MacLeod;Nassir F. Marrouche
    Nathan Burgon;Troy J. Badger;Nazem W. Akoum;Gaston Vergara;Lori McMullan;Yaw A. Adjei-Poku;Thomas S. Haslam;Jeremy Fotheringham;Eugene G. Kholmovski;Rob S. MacLeod;Nassir F. Marrouche
  • 通讯作者:
    Nassir F. Marrouche
    Nassir F. Marrouche
Novel Metric for Evaluating Ischemic Stress in Electrograms Using a Data-Driven Approach
  • DOI:
    10.1016/j.jelectrocard.2019.11.010
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  • 发表时间:
    2019-11-01
    2019-11-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Wilson W. Good;Burak Erem;Jaume Coll-Font;Dana H. Brooks;Rob S. MacLeod
    Wilson W. Good;Burak Erem;Jaume Coll-Font;Dana H. Brooks;Rob S. MacLeod
  • 通讯作者:
    Rob S. MacLeod
    Rob S. MacLeod
共 21 条
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    2019
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    $ 22.35万
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    10262927
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  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 22.35万
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  • 资助金额:
    $ 22.35万
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  • 项目类别:
Image Based Modeling, Simulation, and Visualization Summer Course for Biomedical
基于图像的建模、仿真和可视化生物医学暑期课程
  • 批准号:
    8727083
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  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
  • 项目类别:
Image Based Modeling, Simulation, and Visualization Summer Course for Biomedical
基于图像的建模、仿真和可视化生物医学暑期课程
  • 批准号:
    8551344
    8551344
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
  • 项目类别:
Image Based Modeling, Simulation, and Visualization Summer Course for Biomedical
基于图像的建模、仿真和可视化生物医学暑期课程
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    9339697
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  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
  • 项目类别:
Image Based Modeling, Simulation, and Visualization Summer Course for Biomedical
基于图像的建模、仿真和可视化生物医学暑期课程
  • 批准号:
    9132283
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  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
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    8363711
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    2011
  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
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    8363712
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  • 资助金额:
    $ 22.35万
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    10709400
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  • 资助金额:
    $ 22.35万
    $ 22.35万
  • 项目类别: