Molekulare und strukturelle Ursachen metabolischer Diversität vermittelt durch prenylierende Enzyme

异戊二烯化酶介导的代谢多样性的分子和结构原因

• 批准号: 5453092
• 负责人: Privatdozent Dr. Wolfgang Brandt
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung Natur- und Wirkstoffchemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5453092?language=en
• 关键词: Molekulare; und; strukturelle; Ursachen; metabolischer

Es sollen für prenylierende Enzyme detaillierte Einblicke in evolutionäre Zusammenhänge zwischen Aminosäuresequenzen, 3D-Strukturen der Proteine, sowie den resultierenden diversen Metaboliten gewonnen werden. Es werden die Bindestellen von Diphosphaten von allen Proteinen mit bekannter Röntgenstruktur analysiert, charakterisiert und klassifiziert. Korrelationen dieser Motive zu entsprechenden Bindungen in prenylierenden Enzymen sollen zu Einblicken in evolutionäre Zusammenhänge führen. Sequenzen prenylierender Enzyme und im zweiten Schritt auch evolutionär entfernter Proteine sollen phylogenetisch analysiert werden. Die Modellierung einer großen Zahl von prenylierenden Enzymen mit hoher sequenzieller Ähnlichkeit zu vorhandenen experimentellen Strukturen wird angestrebt. Die Isolierung und Sequenzierung aromatischer Prenyltransferasen aus höheren Pilzen soll zu weiteren Strukturen und dem Verständnis der diversen Substratspezifität führen. In silico Screening nach Liganden für ausgewählte neue aromatische Prenyltransferasen sollen zur Identifizierung von bisher nicht bekannten Substraten beitragen. Quantenmechanische Berechnungen zu spezifischen Katalysemechanismen sind geplant.

艾伦蛋白质与二磷酸盐的结合Röntgenstruktur 分析、特征和分类。韦尔登的索伦系统发育分析。计算机筛选可用于新芳香异戊二烯转移酶的配体鉴定，并可识别底物。特殊催化机制和齿轮。