血球細胞分化における転写伸張制御因子の同定

血细胞分化中转录延伸调节因子的鉴定

• 批准号: 22659182
• 负责人: 田村 智彦
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22659182/
• 关键词: 細胞・組織; 遺伝子; 発現制御

転写因子IRF8の発現は慢性骨髄性白血病(CML)患者で著減し、IRF8欠損マウスはCML様病態を呈する。本研究者はこれまでIRF8がミエロイド系細胞の分化・増殖を制御することを明らかにし、直接の標的遺伝子や標的DNA配列を同定してきた。しかしMφ系で最も代表的な遺伝子M-CSF受容体(Csf1r)については、IRF8はあくまで間接的に、新たに合成される未知のIRF8誘導蛋白(IMAFと名付ける)を介して、しかも転写開始以降の作用点も持ってこれを誘導する可能性が考えられた。そこで本研究ではこのIMAFの同定を試みることで、将来的に今まであまり重要視されてこなかった、細胞分化における転写開始以外による遺伝子発現制御機構を理解することを目指した。まず、クロマチン免疫沈降法(ChIP)によって、IRF8がCsf1r遺伝子を強く誘導する際には実際、直接Csf1r遺伝子には結合しないこと、そして転写開始に伴って生じるH3K4me3はIRF8導入前から生じており導入後も数倍しか増強しないのに対し、転写伸長に伴って生じるH3K36me3は25倍も増強することを見出した。IMAF遺伝子候補の最初の条件を(1)IRF8と相同性の高いIRF4もCsf1rを誘導することを利用して計5通りの系でマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析を行ない、すべての系でIRF8,4いずれによっても早期に誘導されること、(2)ChIP-シーケンスでIRF8がその5'領域に結合するものであること、とした。そして次にIMAF候補遺伝子の導入とノックダウンを行なった。その結果IMAFとして、RNA結合ドメインを持つがこれまで機能が明らかでなかった分子と、Csf1rの発現を増強することが知られている既知の転写抑制因子の二つを同定することができた。現在その二分子の、Csf1r発現誘導における作用点の解析に進んでいる。

慢性髓样白血病（CML）患者和IRF8缺陷型小鼠的转录因子IRF8的表达显着降低。研究人员先前揭示了IRF8调节髓样细胞的分化和增殖，并鉴定了直接靶基因和靶DNA序列。但是，关于Mφ系统中最具代表性的基因的M-CSF受体（CSF1R），人们认为IRF8可以通过新合成的未知IRF8诱导蛋白（命名为IMAF）间接诱导它，并且在转录后也具有一个作用。因此，通过尝试识别IMAF，我们旨在了解细胞分化中基因表达调节的机制，而不是转录启动，这在将来并不重要。首先，我们发现，当IRF8强烈诱导CSF1R基因时，它实际上并未直接与CSF1R基因结合，并且在转录启动时发生的H3K4ME3发生在IRF8引入之前，并且仅在引入后数次增加，而在引入后仅增加了H3K36ME3，而H3K36ME3则在转录eRongecription eLongection extranciprative e eftercription eRongancation the Remangations the the 25 pessection。 IMAF基因候选者的第一个条件是（1）使用五个系统中的微阵列进行全面的基因表达分析，利用IRF4，通过诱导CSF1R与IRF8高度同源，在所有系统中，它被确定在所有系统中由IRF8或（2）IRF8构成的IRF8结合到5'chip chip ins chip ins chip ins of 5''''in IRF8或4诱导。接下来，引入IMAF候选基因并将其击倒。结果，两个IMAF能够鉴定具有RNA结合结构域的分子，但以前没有功能，并且已知的转录阻遏物已知可增强CSF1R表达。我们目前正在继续分析这两个分子的CSF1R表达的作用点。

项目成果

Regulation of immunity and oncogenesis by the IRF transcription factor family

• DOI: 10.1007/s00262-009-0804-6
• 发表时间: 2010-04-01
• 期刊: CANCER IMMUNOLOGY IMMUNOTHERAPY
• 影响因子: 5.8
• 作者: Savitsky, David;Tamura, Tomohiko;Taniguchi, Tadatsugu
• 通讯作者: Taniguchi, Tadatsugu

治らない炎症が引き起こす疾患の分子機構

无法治愈的炎症引起的疾病的分子机制

• 发表时间: 2010
• 期刊: 細胞工学
• 作者: 市野素英;堀田千絵;田村智彦
• 通讯作者: 田村智彦

A shared role of transcription factors IRF4 and IRF8 in myeloid cell development

转录因子 IRF4 和 IRF8 在骨髓细胞发育中的共同作用

• 发表时间: 2009
• 作者: 加藤隆幸;ら
• 通讯作者: ら

Contribution of IRF5 in B cells to the development of murine SLE-like disease through its transcriptional control of the IgG2a locus

• DOI: 10.1073/pnas.1005599107
• 发表时间: 2010-06-01
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Savitsky, David A.;Yanai, Hideyuki;Honda, Kenya
• 通讯作者: Honda, Kenya