RNA新大陸における栄養応答の探索的研究

RNA 新世界营养反应的探索性研究

• 批准号: 21658049
• 负责人: 加藤 久典
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21658049/
• 关键词: マイクロRNA; 栄養; 絶食; 低タンパク質食; DNAマイクロアレイ; 非コードRNA; 選択的スプライシング; マイクロアレイ; 遺伝子発現

6週齢Wistar系雄ラットを3日間予備飼育後、対照群、絶食群、5%タンパク質食群(各n=6)の3群にわけて14日間飼育した。対照群ラットの食餌はAIN93G、絶食群はAIN93Gで13日間飼育した後に24時間絶食、5%タンパク質食群は5%カゼイン食で14日間飼育した。肝臓より取得したRNAをプールし、GeneChip miRNA Arrays (Affymetrix)にてmiRNAの存在量を解析した。ターゲットの検索にはTarget ScanおよびmicroRNA.orgを用いた。絶食で発現上昇したmRNAとして、rno-miR-151, rno-let-7e, rno-let-7f, rno-miR-103, rno-miR-107, rno-miR-126, rno-miR-143が、低タンパク質食で発現上昇したものとしてrno-miR-376b-3p発現低下したものとしてrno-miR-22が見出された。これらのうち、多くの脂質代謝や細胞外マトリクス関連遺伝子を標的とするlet7fとmiR-107についてリアルタイムPCRも行ったところ、再現性が確認できた。rno-miR-376b-3p発現低下したものとしてrno-miR-22が見出された。これらのうち、多くの脂質代謝や細胞外マトリクス関連遺伝子を標的とするlet7fとmiR-107についてリアルタイムPCRも行ったところ、何れも絶食で発現が増加しており、再現性が確認できた。

6周龄Wistar雄性大鼠初步圈养3天，然后分为3组：对照组、禁食组、5%蛋白饮食组，每组6只，圈养14天。对照组大鼠饲喂AIN93G，禁食组饲喂AIN93G 13天后禁食24小时，5%蛋白饮食组饲喂5%酪蛋白饮食14天。收集从肝脏获得的 RNA，并使用 GeneChip miRNA 阵列 (Affymetrix) 分析 miRNA 的丰度。 Target Scan 和 microRNA.org 用于搜索目标。禁食期间表达增加的mRNA包括rno-miR-151、rno-let-7e、rno-let-7f、rno-miR-103、rno-miR-107、rno-miR-126、发现 rno-miR-143 的表达增加，rno-miR-22 发现 rno-miR-376b-3p 的表达减少。其中，我们对针对许多脂质代谢和细胞外基质相关基因的let7f和miR-107进行了实时PCR，并证实了重现性。发现 rno-miR-22 降低了 rno-miR-376b-3p 的表达。其中，我们对针对许多脂质代谢和细胞外基质相关基因的let7f和miR-107进行了实时PCR，发现它们的表达随着禁食而增加，证实了可重复性。

项目成果

栄養状態の変化に応答するmiRNAの網羅的解析

全面分析响应营养状况变化的 miRNA

• 发表时间: 2011
• 作者: 高橋薫;張治磊;加藤久典
• 通讯作者: 加藤久典