緑膿菌エコーシステムにおけるバイオフィルムの酵素・遺伝学的特性解析とその応用

铜绿假单胞菌回声系统中生物膜的酶学和遗传表征及其应用

基本信息

  • 批准号:
    13760067
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2001
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2001 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

バイオフィルム(BF)は、微生物の重要な生存様式(エコーシステム)であるが、その系の複雑さのために充分な解析が進んでいない。運動性を有する緑膿菌は、菌体外に多糖アルギン酸を分泌し、これをBFとして周囲から隔離された生存様式を示し、時には重篤な呼吸器疾患を発症する。さらに、BFを分解し遊離することにより、新たな部位へ移動する。BF形成に関わる緑膿菌の運動性には、ポリリン酸キナーゼ(PPK)により合成されるポリリン酸の関与が指摘されている。緑膿菌はペリプラズムにアルギン酸分解酵素(AlgL)を有するが、その遺伝子はアルギン酸合成遺伝子群と同一オペロンに存在している。AlgLの遺伝子と活性発現との相関が不明なため、AlgLの生理的意義とBF分解制御は殆ど未知である。そこで本研究では、緑膿菌BFに焦点を当て、特にPPKとAlgLが各々関わるBF形成及び分解制御機構を明らかにすることを目的とする。AlgL大量発現大腸菌(全タンパク質の約30%)を育種し、精製系を確立した。AlgLは、これまでに当研究室で構造機能相関を明らかにしているSphingomonas属細菌由来の酵素A1-IIIと有意な相同性(30%)を示した。A1-IIIの触媒残基に相当するAlgLのHis202及びTyr256を各々Ala及びPheに置換した変異体は、酵素活性を示さなかった。従って、His202及びTyr256は、AlgLの活性発現に必須であることが明らかになった。今回、同定した触媒残基の知見に基づいて、緑膿菌ゲノム上のAlgL遺伝子に変異を導入することにより、アルギン酸合成系を修飾することなく、AlgLの機能のみを欠失させた変異株の作製が可能となる。今後、本変異株を用いて、BF分解制御機構を解析する。また、運動性を制御するPPKの構造機能相関を明らかにするため、蒸気拡散法を用いたPPKの結晶化を行っている。
生物膜(BF)是微生物的重要生存模式(回声系统),但由于系统的复杂性,充分的分析尚未取得进展。具有活动能力的铜绿假单胞菌在菌体外分泌海藻酸多糖,并以此为BF与周围环境隔离生存,有时会发展成严重的呼吸道疾病。并且,通过分解并解放BF,移动到新的地点。已经指出,由多磷酸激酶(PPK)合成的多磷酸盐参与参与BF形成的铜绿假单胞菌的运动。铜绿假单胞菌的周质中具有藻酸盐降解酶(AlgL),其基因与藻酸盐合成基因存在于同一操纵子中。由于AlgL基因与活性表达之间的相关性尚不清楚,因此AlgL的生理意义和BF降解的调节在很大程度上是未知的。因此,在本研究中,我们重点关注铜绿假单胞菌 BF,旨在阐明控制 BF 形成和降解的机制,特别是涉及 PPK 和 AlgL 的机制。我们培育了表达大量AlgL(约占总蛋白30%)的大肠杆菌,并建立了纯化系统。 AlgL 与鞘氨醇单胞菌的酶 A1-III 表现出显着的同源性 (30%),其结构与功能关系已在我们的实验室得到阐明。 AlgL的His202和Tyr256(对应于A1-III的催化残基)分别被Ala和Phe取代的突变体不显示酶活性。因此,表明His202和Tyr256对于AlgL活性的表达是必需的。基于这次鉴定的催化残基的知识,通过在铜绿假单胞菌基因组中的AlgL基因中引入突变,我们创造了一种突变菌株,其中仅删除了AlgL的功能而不改变藻酸盐合成系统。生产。今后,我们将利用该突变菌株来分析控制BF降解的机制。此外,为了阐明控制其运动性的PPK的结构-功能关系,我们使用蒸气扩散法使PPK结晶。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yumiko Mishima: "Super-channel in Bacteria : Function and Structure of the Macromolecule Import System Mediated by a Pit-dependent ABC Transporter"FEMS Microbiological Letters. 204. 215-221 (2001)
三岛由美子:“细菌中的超级通道:由坑依赖性 ABC 转运蛋白介导的大分子输入系统的功能和结构”FEMS 微生物快报。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
橋本 渉: "細菌『超チャネル』の構造と高分子輸送機能"生化学. 74(7). 563-567 (2002)
Wataru Hashimoto:“细菌‘超级通道’的结构和大分子转运功能”,生物化学 74(7) (2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
橋本 渉: "細菌『超チャネル』の構造と高分子輸送機能"生化学. (印刷中). (2002)
Wataru Hashimoto:“细菌‘超级通道’的结构和大分子转运功能”生物化学(出版中)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
橋本 渉: "Sphingomonas属細菌における巨大分子(アルギン酸)利用の高次バイオシステム"バイオサイエンスとインダストリー. (印刷中). (2003)
Wataru Hashimoto:“利用鞘氨醇单胞菌属细菌中的大分子(藻酸盐)的高级生物系统”生物科学与工业(2003 年)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hye-Jin Yoon: "Crystal structure of alginate lyase A1-III complexed with trisaccharide product at 2.0 Å resolution"Journal of Molecular Biology. 307(1). 9-16 (2001)
Hye-Jin Yoon:“2.0 Å 分辨率下藻酸裂解酶 A1-III 与三糖产物复合的晶体结构”,《分子生物学杂志》307(1) (2001)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

橋本 渉其他文献

遺伝子から見た応用微生物学
从遗传学角度看应用微生物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    橋本 渉
  • 通讯作者:
    橋本 渉
大豆上で納豆菌の細胞極に生じる巨大な洞穴の発見とその形成に関わる遺伝子の同定
发现大豆上纳豆芽孢杆菌细胞极处形成的巨型洞穴并鉴定了参与其形成的基因
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    長瀬 鮎美;杉浦 春香;南部 優子;髙瀬 隆一;橋本 渉
  • 通讯作者:
    橋本 渉
遺伝子から見た応用微生物学
从遗传学角度看应用微生物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    橋本 渉
  • 通讯作者:
    橋本 渉
食事非依存的環境における腸内細菌叢の動態シミュレーション
模拟饮食独立环境中的肠道菌群动态
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梶川 幹太;佐藤 賢宏;髙瀬 隆一;渡辺 大輔;橋本 渉
  • 通讯作者:
    橋本 渉
子宮内無菌仮説の例外としてのB群連鎖球菌による宿主細胞外多糖の資化
B 族链球菌对宿主细胞外多糖的同化是子宫内不育假说的一个例外
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    佐藤 賢宏;老木 紗予子;髙瀬 隆一;渡辺 大輔;橋本 渉
  • 通讯作者:
    橋本 渉

橋本 渉的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('橋本 渉', 18)}}的其他基金

映像のフレームレート制御による視線誘導に関する研究
基于视频帧率控制的眼动引导研究
  • 批准号:
    22K12140
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
動物細胞外粘液物質を介した腸内優占菌と宿主との相利共生機構の解明
通过动物细胞外粘液物质阐明肠道优势菌与宿主的互利共生机制
  • 批准号:
    21H02156
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
空気注入型没入映像装置に関する研究
充气沉浸式视频装置的研究
  • 批准号:
    17700128
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
高分子物質の結合と分解に関わるタンパク質・酵素の機能を規定する動的高次構造の解析
分析动态高阶结构,定义参与聚合物结合和分解的蛋白质和酶的功能
  • 批准号:
    15780053
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
可動型没入映像投影装置に関する研究
可移动沉浸式视频投影装置的研究
  • 批准号:
    15700113
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
難治性細菌感染症における細菌の増殖、潜伏及び感染持続機構の解析と新規治療法の確立
分析顽固性细菌感染中的细菌生长、潜伏和感染持续机制并建立新的治疗方法
  • 批准号:
    13226049
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)

相似海外基金

緑膿菌における病原性、抗菌薬抵抗性のトレードオフ機構の解明
阐明铜绿假单胞菌致病性和抗菌素耐药性之间的权衡机制
  • 批准号:
    22K08613
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Studies on involvement of microbial food chain in biomagnification of organic pollutants accumlating on the surface of nanoplastics
微生物食物链参与纳米塑料表面有机污染物生物放大的研究
  • 批准号:
    19K12368
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Effect of new antimicrobial photodynamic therapy system on biofilm inhibition
新型抗菌光动力治疗系统对生物膜抑制的影响
  • 批准号:
    19K10140
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
2成分制御系を中心としたバイオフィルム形成菌における抗菌薬抵抗性メカニズムの解明
以双组分调控系统为中心阐明生物膜形成细菌的抗菌耐药机制
  • 批准号:
    18K09535
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Elucidation of effectiveness and mechanism of new water-soluble glycolipids in bacterial pneumonia control
阐明新型水溶性糖脂控制细菌性肺炎的有效性和机制
  • 批准号:
    18H02657
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了