バイオインフォマティックスとプロテオミクスを駆使した新規薬物輸送担体の同定戦略

利用生物信息学和蛋白质组学识别新型药物转运载体的策略

• 批准号: 20659021
• 负责人: 大槻 純男
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20659021/
• 关键词: プロテオミクス; インフォマティックス; トランスポーター; 膜タンパク質; 薬学; 定量的プロテオミクス; 細胞膜

本課題は、バイオインフォマティックスによるタンパク質構造、局在情報および質量分析装置を用いたプロテオミクスによるタンパク質の特性情報を用いることによって、従来とは異なる方法論を用いて新規薬物輸送担体を同定することを目的とする。本年度は、昨年度絞り込んだ候補タンパク質について発現ベクターを構築し、ほ乳類細胞に導入することによって安定発現細胞を構築した。さらに、30化合物についてLC-MS/MSの定量系を構築した。樹立した安定発現培養細胞及び化合物ライブラリを用いて候補分子に輸送される化合物の探索をおこなった結果、取り込まれる化合物の同定に成功した。取り込み実験によって、細胞内に取り込まれる化合物及び細胞から排出される可能性のある化合物を同定した。一つの化合物についてL体及びD体を用いて輸送解析を行ったところ、立体選択的に輸送されることが明らかとなった。また、この化合物の輸送に関する阻害効果を複数の化合物について検討し、複数の阻害剤を同定した。今後は、in vivoにおける機能及び局在解析を行うことによって、薬物動態にかかわる新たなトランスポーターとその機能が明らかになることが期待される。

该对象是使用蛋白质结构，通过质谱仪通过蛋白质组学来鉴定与常规方法不同的方法，该方法与常规方法不同，该方法与常规方法不同。今年，为去年缩小并引入哺乳动物细胞以构建稳定表达细胞的候选蛋白构建了表达载体。此外，为30种化合物构建了LC-MS/MS的定量系统。使用已建立的稳定表​​达培养细胞和化合物库将要运输到候选分子的化合物进行搜索，并成功鉴定了化合物。摄取实验鉴定出在细胞中摄入的化合物以及可以从细胞中排出的化合物。使用L和D形式对一种化合物进行了运输分析，并揭示了它是立体选择性运输的。此外，研究了多种化合物的该化合物对转运的抑制作用，并鉴定出多种抑制剂。将来，可以通过在体内进行功能和定位分析来揭示参与药代动力学及其功能的新转运蛋白。

项目成果

VALIDATION OF HUMANIZED LIVER OF CHIMERIC MICE AS A MODEL OF HUMAN LIVER BASED ON TRANSPORTER AND P450 ENZYME PROTEIN EXPRESSIONS BY QUANTITATIVE TARGETED ABSOLUTE PROTEOMICS

通过定量靶向绝对蛋白质组学验证基于转运蛋白和 P450 酶蛋白表达的嵌合小鼠人源化肝脏作为人类肝脏模型

• 发表时间: 2009
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男;川上裕貴
• 通讯作者: 川上裕貴

バイオインフォマティクス及びプロテオミクスを利用した新規トランスポーターの候補分子の探索

利用生物信息学和蛋白质组学寻找新的转运蛋白候选分子

• 发表时间: 2008
• 作者: 田中晃一;Chang Hui Li;加々美綾乃;渡邊嘉典;相澤三四郎
• 通讯作者: 相澤三四郎

バイオインフォマティクスとプロテオミクスを利用した新規トランスポーターの候補分子の探索

利用生物信息学和蛋白质组学寻找新型转运蛋白候选分子

• 发表时间: 2008
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男;川上裕貴;相澤三四郎
• 通讯作者: 相澤三四郎

New approach to drug design by quantitative membrane proteomics

通过定量膜蛋白质组学进行药物设计的新方法

• 发表时间: 2009
• 作者: Sakuno T;Tada K;Watanabe Y.;S. Ohtsuki
• 通讯作者: S. Ohtsuki

標的プロテオミクスによる膜タシパク質研究の新たな展開

利用靶向蛋白质组学研究膜蛋白的新进展

• 发表时间: 2008
• 作者: Yoshio Hayashi;Thomas. Regnier;Shigenobu Nishiguchi;他9人;Yukie Ando;Tera M;Yashiroda Y;Ohishi T;Migita T;Kobayashi Y;Mashima T;Mashima T;Seimiya H;Mashima T;Mashima T;McCabe N;Yeung BH;Migita T;Mashima T;右田敏郎;岡部幸子;清宮啓之;右田敏郎;右田敏郎;右田敏郎;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;岡部幸子;清宮啓之;岡部幸子;岡部幸子;馬島哲夫;大槻純男;大槻純男;川上裕貴;相澤三四郎;大槻純男
• 通讯作者: 大槻純男