磁気微粒子を用いた自動遺伝子解析システムの開発

利用磁性粒子的自动基因分析系统的开发

基本信息

批准号：
12019216
负责人：
養王田正文
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12019216/
关键词：
磁気微粒子磁気分離オートメーション電気泳動遺伝子診断

项目摘要

磁気微粒子を用いたDNAの分離精製機能を有する遺伝子組換え用ワークステーションはすでに市販されており,遺伝子組換えの様々な操作の自動化が可能である.しかし,電気泳動によるDNAの分離・精製を行うことができないため遺伝子解析や遺伝子組換えの全自動化は不可能であった.そこで,アガロースゲルによるDNAの分離・精製の自動化を実現するためにシステムの改造を行った.具体的には,電気泳動装置,CCDカメラを用いたゲル撮影装置,自動サンプル注入装置及びゲル回収装置の開発とそれらに伴うソフトの開発を行った.作製した装置(SX-8G plus)は,コンピューター上からのコマンドにより装置内を3次元的に自由に移動できる8連のノズルを有し,デスクトップには,マイクロタイタープレート,チップラック,試薬コンテナーの他に,自動開閉蓋式サーマルサイクラー,試薬をストックするための冷却ブロック,アガロースゲル電気泳動槽が配置されている.また,電気泳動用電源,ゲルの染色と脱色を自動で行うためのポンプ,ゲルを撮影するためのトランスイルミネーターとCCDカメラも本体に組み込まれている.SX-8G plusは,これまで困難とされていたアガロースゲル電気泳動,遺伝子断片の検出とゲルからの切り出しの自動化を可能とした.一般的に,XYZロボットはアガロースゲルのウエルの位置を合わせるのに十分な精度を有している.ロボットによるサンプルのアガロースゲルへのローディングが困難なのは,使用するチップやゲルの位置などの精度が低いためである.SX-8G plusでは,特別な二重になったコームを使用することで,チップやゲルの精度の低さによるローディングの失敗を防いでいる.ゲルの写真はCCDカメラで撮影されコンピューターに取りこまれる.目的のDNA断片をディスプレイ上でカーソルを用いて指定することにより,自動的に切り出すことが可能である.ゲルの切り出しはノズルにゲルカッターを装着しておこない,切り出したゲルはマイクロタイタープレートなの任意の位置に排出される.現在,この装置の性能評価を行っている.

具有利用磁性粒子分离和纯化DNA功能的基因重组工作站已经商业化，并且可以实现基因重组的各种操作的自动化，因此，基因分析和基因重组的完全自动化是不可能的。因此，我们修改了系统以使用琼脂糖凝胶自动分离和纯化DNA。具体来说，我们修改系统以使用琼脂糖凝胶自动分离和纯化DNA。具体来说，我们安装了电泳装置、凝胶成像装置，使用凝胶成像装置。我们开发了CCD相机、自动进样装置和凝胶成像装置。我们创建的装置（SX-8G）。 plus）有八个喷嘴，可以通过计算机的命令在设备内自由移动，桌面包括微量滴定板、芯片架、试剂容器、自动开/关热循环器盖、试剂储存器。主体中还内置有用于扫描的冷却块、琼脂糖凝胶电泳槽、用于电泳的电源、用于对凝胶自动染色和脱色的泵、透照器和用于拍摄凝胶的CCD相机。 .SX-8G Plus使得琼脂糖凝胶电泳、基因片段检测以及从凝胶上切割自动化成为可能，而这在以前被认为是困难的。机器人将样本加载到琼脂糖凝胶上的困难在于准确性。使用的尖端和凝胶的位置较低。SX-8G Plus采用特殊的双梳梳，防止因芯片和凝胶不准确而导致上样失败。用CCD相机拍摄凝胶照片并导入计算机。将显示屏上的目的光标移动到DNA片段上通过使用指定，可以自动切割凝胶。通过在喷嘴上安装凝胶切割器来切割凝胶，并将切割出的凝胶排出到微量滴定板中的任意位置。目前，我们正在评估该设备的性能。