ロタウイルスの遺伝学的多様性と種間伝播に関する研究
轮状病毒遗传多样性及种间传播研究
基本信息
- 批准号:08F08463
- 负责人:
- 金额:$ 1.28万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究の目的は、ヒト由来のA群ロタウイルスで非定型的性状を有するもの、および動物ロタウイルスについて遺伝子解析を行い、動物とヒトの間におけるロタウイルスの感染・伝播の様態を明らかにすることである。今年度は次の3つの研究成果を得た。(1)昨年度から解析を行っていたウシ由来B群ロタウイルスについて、9種類の遺伝子分節のクローニングと遺伝子配列の決定を行なった。系統解析の結果、ウシB群ロタウイルスはヒト、マウス、ヒツジのB群ロタウイルスとは異なる系統に属し、B群では動物間の伝播は稀であることが示唆された。(2)ヒトロタウイルスの世界的な新興型として認識されるG12型ウイルスの由来について探るため、動物で唯一G12型が検出されているブタのG12型A群ロタウイルスRU172株について、その全遺伝子配列を決定し解析した。その結果、一部の遺伝子分節はあるヒトロタウイルス株に非常に近いものの、他の遺伝子分節はブタロタウイルスの配列と高い一致率を示した。この知見から、ブタおよびヒトのG12型ロタウイルスは、ブタとヒトのロタウイルスの遺伝子再集合体であった可能性、またはブタとヒトのG12ロタウイルスが同じ共通の祖先ウイルスに由来し、別個に分子進化したことが示唆された。(3)ヤギA群ロタウイルスについて初めて全遺伝子配列を決定し(G034株)、既知のヒト・動物ロタウイルスと系統解析を行った。その結果、ヤギロタウイルスの一部の遺伝子分節はG6, G8, G12などの非定型的ロタウイルスの遺伝子分節と高い一致率を示した。このことからヒトの非定型的ロタウイルスの形成にヤギロタウイルスの伝播、遺伝子再集合が関与したことが示唆された。
本研究的目的是对具有非典型特征的人源A组轮状病毒和动物轮状病毒进行基因分析,阐明轮状病毒在动物和人类之间的感染和传播模式。今年,我们取得了以下三项研究成果。 (1)我们克隆了牛B组轮状病毒的9个基因片段并确定了基因序列,我们从去年就开始分析该病毒。系统发育分析表明,牛 B 组轮状病毒与人、小鼠和绵羊 B 组轮状病毒属于不同的谱系,并且 B 组动物之间的传播很少见。 (2)为了研究G12病毒的起源,G12病毒被认为是全球范围内新兴的人类轮状病毒,我们研究了猪G12 A组轮状病毒RU172株的整个基因,这是在动物中检测到的唯一G12型。确定并分析了序列。结果表明,虽然一些基因片段与某些人类轮状病毒株非常接近,但其他基因片段与猪轮状病毒序列表现出高度的一致性。这一发现提出了猪和人 G12 轮状病毒是猪和人轮状病毒的基因重配体的可能性,或者猪和人 G12 轮状病毒源自相同的共同祖先病毒并且是不同的。 (3)首次测定了山羊A组轮状病毒(G034株)全基因序列,并与已知人和动物轮状病毒进行系统发育分析。结果,山羊轮状病毒的一些基因片段与G6、G8和G12等非典型轮状病毒的基因片段表现出高度的一致性。这表明山羊轮状病毒的传播和基因重配参与了非典型人轮状病毒的形成。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Full genomic analysis and possible origin of a porcine G12 rotavirus strain RU172
- DOI:10.1007/s11262-010-0454-y
- 发表时间:2010-06-01
- 期刊:
- 影响因子:1.6
- 作者:Ghosh, S.;Kobayashi, N.;Naik, T. N.
- 通讯作者:Naik, T. N.
Human group A rotavirus P[8] Hun9-like and rare OP354-like strains are circulating among diarrhoeic children in Eastern India
- DOI:10.1007/s00705-008-0187-6
- 发表时间:2008-09
- 期刊:
- 影响因子:2.7
- 作者:S. Samajdar;S. Ghosh;D. Dutta;M. Chawla-Sarkar;N. Kobayashi;T. Naik
- 通讯作者:S. Samajdar;S. Ghosh;D. Dutta;M. Chawla-Sarkar;N. Kobayashi;T. Naik
Molecular characterization of full-length genomic segment 2 of a bovine picobirnavirus strain : evidence for high genetic diversity with genogroup I picobirnaviruses
牛小核糖核酸病毒株全长基因组片段 2 的分子特征:基因组 I 小核糖核酸病毒具有高遗传多样性的证据
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ghosh S;et al.
- 通讯作者:et al.
Molecular characterization of full-length gene segment 2 of a bovine genogroup I picobirnavirus strain
牛基因组 I 小核糖核酸病毒株全长基因片段 2 的分子特征
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ghosh S;小林宣道;長嶋茂雄;Naik TN.
- 通讯作者:Naik TN.
Molecular characterization of VP1, VP2, VP4, VP6, NSP1 and NSP2 genes of bovine group B rotaviruses : Identification of novel VP4 genotype
牛 B 组轮状病毒 VP1、VP2、VP4、VP6、NSP1 和 NSP2 基因的分子特征:新 VP4 基因型的鉴定
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ghosh S;et al
- 通讯作者:et al
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- 影响因子:0
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- 影响因子:0
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$ 1.28万 - 项目类别:
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