リゾチーム〜α-ラクトアルブミンの折りたたみ中間体の構造と物性

溶菌酶和α-乳清蛋白折叠中间体的结构和物理性质

基本信息

  • 批准号:
    01J10878
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2001
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2001 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本年度はイヌミルクリゾチーム(Canine Milk Lysozyme : CML)のMolten Globule(MG)状態のnon-native helix構造に関する研究を行った。これまでの研究から、CMLのMG状態においてα-helixに特有な222nmの楕円率の絶対値がNative(N)状態よりも大きく、MG状態のhelix含量がN状態よりも多くなっていることが示されていた。しかしながら、どの部分がMG状態においてhelixを形成するのかは明らかにはされていなかった。本研究において、helical propensityを予測するプログラムであるAGADIRによって、N状態ではβ-sheetを形成している領域内にhelixを形成し易い領域が存在していることが見出され、その領域がMG状態においてhelixを形成している可能性が示唆された。そこで、その領域内の1残基をhelix-breakerであるプロリンに置換した変異体(Q58P)を作成することでnon-native helix構造の存在について検討を行った。その結果、変異体のMG状態における222nmの楕円率の絶対値が野生型よりも小さくなり、58番目周辺が天然状態ではβ-sheetを形成しているがMG状態においてはhelixを形成していることが示された。また、変性実験の結果より58番目周辺のhelix構造はMG状態の形成および安定性には寄与しないことが示され、58番目周辺のhelix構造は非協同的相互作用により形成されていることが示唆された。そこで、この部分に対応するペプチドモデルを作成し、この部分のMG状態のおける3次元分子構造に関する検討をNMR法を用いて行った。研究成果については現在論文執筆中である。
今年,我们对犬牛奶溶菌酶(CML)的非本地螺旋结构进行了一项研究。先前的研究表明,222 nm的椭圆度的绝对值(在α-螺旋中是独有的)大于天然(n)状态,并且Mg状态的螺旋含量大于N状态。但是,目前尚不清楚MG状态下哪些部分形成螺旋。在这项研究中,预测螺旋倾向的程序Agadir发现,在n个状态下形成β-折叠的区域中可能存在一个可能形成螺旋的区域,这表明该区域可能在mg状态下形成螺旋。因此,我们通过创建一个突变体(Q58p)来研究了非本地螺旋结构的存在,在该突变体(Q58P)中,该区域的一个残基被螺旋断裂脯氨酸取代。结果表明,在突变体的毫克状态下,椭圆率在222 nm处的绝对值小于野生型的绝对值,并且第58个周围在天然状态中形成β-片,但在毫克状态下螺旋。此外,变性实验的结果表明,在第58位周围的螺旋结构没有促进MG状态的形成和稳定性,这表明第58位周围位置周围的螺旋结构是由非合作相互作用形成的。因此,创建了与该部分相对应的肽模型,并使用NMR研究了该部分的Mg状态中的3D分子结构。他目前正在撰写有关他的研究结果的论文。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Tada M et al.: "Stabilization of protein by replacement of a fluctuating loop : structural analysis of a chimera of bovine α-lactalbumin and equine lysozyme"Biochemistry. 41・46. 13807-13813 (2002)
Tada M等人:“通过替换波动环来稳定蛋白质:牛α-乳清蛋白和马溶菌酶嵌合体的结构分析”生物化学41·46(2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kumeta H et al.: "Low-Temperature-Induced Structural Changes in Human Lysozyme Elucidated by Three-Dimensional NMR Spectroscopy"Biochemistry. 42・5. 1209-1216 (2003)
Kumeta H 等:“三维 NMR 光谱阐明的低温诱导的人体溶菌酶结构变化”生物化学 42・5(2003 年)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Mizuguchi M et al.: "Effects of a helix substitution on the folding mechanism of bovine α-lactalbumin"PROTEINS : Structure, Function, and Genetics. 49・1. 95-103 (2002)
Mizuguchi M 等人:“螺旋取代对牛 α-乳白蛋白折叠机制的影响”蛋白质:结构、功能和遗传学 95・1(2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

小橋川 敬博其他文献

細胞外プロテオスタシスにおけるレドックス制御とタンパク質凝集との関連解析
细胞外蛋白质稳态中氧化还原控制与蛋白质聚集的关系分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    佐藤 卓史;稲田 祐貴;小橋川 敬博;森岡 弘志
  • 通讯作者:
    森岡 弘志
チロシンキナーゼのリン酸化による活性化の構造メカニズム
磷酸化激活酪氨酸激酶的结构机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小橋川 敬博;天野 伸次郎;横川 真梨子; 森岡 弘志;Joseph Schressinger;稲垣 冬彦
  • 通讯作者:
    稲垣 冬彦
創薬研究のための相互作用解析パーフェクト (第1章 II-12「ファージディスプレイ法を用いた一本鎖抗体の改変」)
药物发现研究的完美相互作用分析(第1章II-12“使用噬菌体展示方法修饰单链抗体”)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山内 聡一郎;小橋川 敬博;佐藤 卓史;森岡弘志
  • 通讯作者:
    森岡弘志
トランスサイレチン単量体の動的な構造平衡状態の解析
甲状腺素运载蛋白单体的动态结构平衡状态分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    河野 慎吾;小橋川 敬博;甲斐 広文;森岡 弘志;佐藤 卓史
  • 通讯作者:
    佐藤 卓史
阻害剤耐性および選択性の分子機構の解明へ向けた阻害剤-FGFR間相互作用の物理化学的解析
抑制剂-FGFR 相互作用的理化分析,以阐明抑制剂耐药性和选择性的分子机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    林田 大輝;与座 魁斗;雨宮 舜;姫野 梨花;佐藤 卓史;福田 夏希;赤星 璃;逆瀬川 知香;森岡 弘志;小橋川 敬博
  • 通讯作者:
    小橋川 敬博

小橋川 敬博的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('小橋川 敬博', 18)}}的其他基金

構造生物学・物理化学・計算化学に基づくチロシンキナーゼ阻害剤剤選択性の解明
基于结构生物学、物理化学和计算化学阐明酪氨酸激酶抑制剂的选择性
  • 批准号:
    24K09762
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
抗がん剤耐性克服へ向けた核内受容体の活性制御機構の解明
阐明核受体活性控制机制以克服抗癌耐药性
  • 批准号:
    21K06493
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ラフトに集積するシグナル伝達タンパク質群の構造生物学的研究
筏中积累的信号蛋白的结构生物学研究
  • 批准号:
    04J08909
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

パーツ並べ変え蛋白質のX線解析による新しいバイオインフォマティクス基盤の確立
利用部分重排蛋白质的 X 射线分析建立新的生物信息学平台
  • 批准号:
    15657036
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
タンパク質フォールディングに対する天然状態類似相互作用の役割のNMRによる研究
核磁共振研究天然态相互作用对蛋白质折叠的作用
  • 批准号:
    13780529
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
卵白アルブミンに脂肪酸を添加しただけでなぜゲル化するのか-その機構と応用的側面
卵清蛋白中添加脂肪酸为什么会引起凝胶化? 机理及应用方面
  • 批准号:
    10780088
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ランダムタンパク質を表層に提示した細胞の進化工学的機能開発
细胞表面展示随机蛋白质的进化工程功能开发
  • 批准号:
    10145234
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
蛋白質非天然状態の構造とダイナミクス
蛋白质非天然状态的结构和动力学
  • 批准号:
    08272216
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了