ネコ免疫不全ウイルスの分子クロ-ニングと遺伝子解析

猫免疫缺陷病毒的分子克隆及遗传分析

基本信息

批准号：
02660308
负责人：
速水正憲
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1990
资助国家：
日本
起止时间：
1990 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-02660308/
关键词：
ネコネコ免疫不全ウイルス FIV

项目摘要

日本の野外ネコから、ネコ免疫不全ウイルス(FIV)を2株(FIVーTM1,FIVーTM2)分離した。これらの株から、Hirt法によりウイルスDNAを調整し、サザンブロット法による解析を行ったところ、米国において報告されたFIVーPetaluma株とは、異なる制限酵素切断パタ-ンを示した。今回我々は、FIVーTM2株よりプロウイルスDNAのクロ-ニングを行い、全塩基配列を決定し、その塩基配列から推定されるgag、pol env及びその他の領域についてFIVーPetaluma株との比較を行った。その結果、FIVーTM2株は、制限酵素地図上では、FIVーTM株とほとんど差異が認められず、FIVーPetaluma株とは大きく異なっていることが見い出された。またgag,pol領域では、FIVーPetaluma株を約90%の高いアミノ酸相同性を示したがenv領域では、80%の相同性であり、FIVにもenv領域の多様性が存在することが示された。セントラル領域については、vifと考えられるORFとその他に短いORFが存在した。env領域の3側にも短いORFが見い出されており、そのN末端には、HIV/SIVのrevと相同性を示す塩基性アミノ酸が存在していた。これら短いORFはFIVーPetaluma株にも共通にみられ、調節蛋白質として機能している可能性に関して、現在詳しく検討している。

从日本的室外猫中分离出两种猫免疫缺陷病毒（FIV）（FIV-TM1，FIV-TM2）菌株。使用HIRT方法从这些菌株中调节病毒DNA，并通过Southern印迹分析，并与美国报道的FIV-Petaluma菌株显示出不同的限制酶裂解模式。在本文中，我们从FIV-TM2菌株中克隆前病毒DNA，确定了整个碱基序列，并比较了从碱基序列推导的GAG，POL ENV和其他区域与FIV-Petaluma菌株。结果，发现FIV-TM菌株在限制酶图上几乎没有差异，并且与FIV-Petaluma菌株有显着差异。此外，在GAG和POL区域中，FIV-Petaluma菌株显示出约90％高的氨基酸同源性，但是在ENV区域，ENV区域是80％的同源性，并且表明FIV的ENV地区也有多样性。对于中部地区，有ORF被认为是VIF和其他短距离。在ENV区域的三个侧面也发现了一个短的ORF，N末端是一种基本氨基酸，与HIV/SIV Rev表现出同源性。这些短ORF通常在FIV-Petaluma菌株中看到，目前正在详细研究它们作为调节蛋白的可能性。