バクテリア環状ゲノム構造の構築原理の解明

阐明细菌环状基因组结构的构建原理

基本信息

  • 批准号:
    15013257
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.97万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2003 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、進化の過程で最適化されてきた原核細胞の環状染色体の構築に関わる原理を見いだし、その細胞長の1000倍もの長さを持ちながらバクテリア細胞内に納められている核様体の仕組みを解き明かすことを目的とした。バクテリアの核様体形成に関わる要因として、染色体の全体構造そのもの、あるいは細胞増殖の様式、さらに局所的な染色体配列等がどのように影響するか明らかにすることを試みた。1)バクテリア・セントロメア様領域の位置効果染色体の複製起点(oriC)の近傍に、私達が見いだした染色体分配のシス機能領域(migS)は位置する。このシス領域を染色体の別の位置に移して染色体分配への影響を調べる。2)細胞周期による核様体の形態変化生細胞での核様体の形態を観察し、細胞周期によるその形態の変化を明らかにし細胞活動との関連を見る。特に、マルチフォーク複製期には複雑な形態の変化を認めており、複製と核様体形態の関係を明らかにする。これらの結果、1)染色体分配のシス領域、migS,による染色体の移動を生細胞内で可視化するシステムを導入した。2)migSを染色体終点領域に移すと、この部分が両極移動し、一方、複製起点領域は細胞中央部に留まったままになっていることを生細胞内の連続的観察から示すことができた。3)細胞内の核様体のサブドメイン構造に一致して、複製起点領域が位置していることを示し、migS欠失株ではこのサブドメイン構造が見られなくなり、複製起点領域の分離に遅れがあることを明らかにした。4)染色体の終点領域と複製起点の逆位変異株を作成し、終点領域側の逆位の点が、dif配列に近いと逆位の頻度が下がることを明らかにした。これは終点領域にならかの染色体ドメインの境界があることを示唆している。以上の成果を得た。
这项研究的目的是发现在进化过程中优化的原核细胞中循环染色体涉及的原理,并揭示了细菌细胞中包含的核苷的机制,其长度是细胞长度的1000倍。我们试图阐明染色体本身的总体结构,细胞增殖模式和局部染色体序列如何影响细菌形成的因素。 1)我们发现的染色体分布的细菌丝粒样区域的位置效应位于染色体分布的复制(ORIC)附近。该顺式区域被转移到染色体上的另一个位置,以检查其对染色体分布的影响。 2)由于细胞周期而引起的核苷的形态变化观察到活细胞中核苷的形态,揭示了由于细胞周期而导致其形态的变化,并看到与细胞活性的关系。特别是,在多堡复制阶段观察到复杂的形态变化,揭示了复制与核形态之间的关系。结果,1)引入了一个系统来可视化活细胞内染色体分布的顺式迁移。 2)活细胞内的连续观察表明,MIGS被转移到染色体末端区域,而该部分移动了两个杆,而复制区域的起源仍留在细胞的中心。 3)这表明复制区域的起源与细胞内核苷的亚域结构一致,并揭示了在MIGS缺失菌株中没有看到该亚域结构,表明复制区域起源的分离延迟。 4)创建了端点区域的倒突变体和染色体复制的起源,并揭示了当端点区域侧的倒点接近差异时,倒置位置的频率会降低。这表明端点区域具有染色体结构域的边界。我取得了上述结果。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

仁木 宏典其他文献

規則性ナノ空孔材料を含んだ多孔質成形体の開発とバイオプロセス応用
含有有序纳米多孔材料的多孔成型体的开发和生物工艺应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    赤澤 優;阿部 貴志;仁木 宏典;馬場 知哉;松浦 俊一,池田 拓史,山本 勝俊;松浦 俊一,長瀬 多加子,角田 達朗
  • 通讯作者:
    松浦 俊一,長瀬 多加子,角田 達朗
遺伝子の水平伝播とアミノ酸組成変化に基づく南極細菌の種固有な低温適応戦略の解明
基于水平基因转移和氨基酸组成变化阐明南极细菌物种特异性低温适应策略
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    赤澤 優;阿部 貴志;仁木 宏典;馬場 知哉
  • 通讯作者:
    馬場 知哉
大腸菌球状変異体rodZ 欠損株の抑圧変異株の解析から見た球状から桿状への形態変化の機構
大肠杆菌球状突变体rodZ缺失株抑制突变体分析从球形到杆状的形态变化机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    塩見 大輔;仁木 宏典
  • 通讯作者:
    仁木 宏典
Ribosomal stress and the p53 network : Impaired ribosome biogenesis due to ribosomal protein deficiency leads to p53 induction in zebrafish
核糖体应激和 p53 网络:核糖体蛋白缺乏导致核糖体生物合成受损,导致斑马鱼 p53 诱导
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    塩見 大輔;仁木 宏典;樋口芳樹;N.Kenmochi
  • 通讯作者:
    N.Kenmochi
BVS3Dマッピングによるナノ細孔中のアルカリ金属イオンの分布と拡散経路の推定
通过 BVS3D 映射估算纳米孔中碱金属离子的分布和扩散路径
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    赤澤 優;阿部 貴志;仁木 宏典;馬場 知哉;松浦 俊一,池田 拓史,山本 勝俊;松浦 俊一,長瀬 多加子,角田 達朗;池田拓史,塚本悠介,中岡琢磨,山本勝俊;池田拓史
  • 通讯作者:
    池田拓史

仁木 宏典的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('仁木 宏典', 18)}}的其他基金

染色体DNA凝縮の物理化学的メカニズムの解明に向けた遺伝生化学的研究
遗传生化研究旨在阐明染色体DNA凝聚的理化机制
  • 批准号:
    23K27216
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Biochemical and Genetical Approaches to Elucidate Physio-Chemical Mechanism for Condensation of Bacterial Chromosomal DNA
阐明细菌染色体 DNA 缩合的物理化学机制的生化和遗传学方法
  • 批准号:
    23H02525
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
バクテリア細胞内で周期移動する新規運動性タンパク質SopAの時空間解析
细菌细胞内周期性运动的新型运动蛋白 SopA 的时空分析
  • 批准号:
    17049027
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
バクテリア核様体の動的形態変化を司る因子と機能領域の時空間解析
控制细菌核动态形态变化的因素和功能区域的时空分析
  • 批准号:
    17050024
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
バクテリア環状ゲノム構造の構築原理の解明
阐明细菌环状基因组结构的构建原理
  • 批准号:
    16013247
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
染色体改変変異株によるバクテリア環状ゲノム構造の構築原理の解明
利用染色体修饰突变体阐明细菌环状基因组结构的构建原理
  • 批准号:
    14014251
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
バクテリア多様なparAB分配遺伝子の基本分子機構の研究
parAB分布基因在多种细菌中的基本分子机制研究
  • 批准号:
    13206076
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
バクテリアのparAB分配遺伝子の多様性と分配の基本分子機構の研究
细菌parAB分配基因多样性及分配基本分子机制研究
  • 批准号:
    12206072
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
染色体分配に関与するMukBタンパクのモーター蛋白としての機能の研究
MukB蛋白作为运动蛋白参与染色体分离的功能研究
  • 批准号:
    07780576
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
大腸菌染色体分配に関与するMukB蛋白が認識する大腸菌染色体領域の解明
阐明参与大肠杆菌染色体分离的 MukB 蛋白识别的大肠杆菌染色体区域
  • 批准号:
    05854076
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似国自然基金

改良MitoQ用于常染色体隐性共济失调2型的治疗作用及机制研究
  • 批准号:
    82301667
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
染色体结构维持基因4(SMC4)在肺动脉高压肺血管重构中的作用和机制研究
  • 批准号:
    82360015
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    32 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
转录因子Runx1促进常染色体显性多囊肾病进展的机制研究
  • 批准号:
    82371869
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    51 万元
  • 项目类别:
    面上项目
海龙科鱼类性染色体演化及其对雄性繁殖系统多样化的调控机制研究
  • 批准号:
    42376126
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    51 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于染色体外DNA识别驱动细胞癌变的关键因子
  • 批准号:
    32370598
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Study on the difference in chromatin domain between germ and somatic cells
生殖细胞和体细胞染色质结构域差异的研究
  • 批准号:
    18K19304
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Establishment of molecular epidemiological method using resistance gene accumulation sequence of drug-resistant bacteria in multiple countries
利用多国耐药菌耐药基因积累序列建立分子流行病学方法
  • 批准号:
    18K10045
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Germ cell-intrinsic function of sex chromosome in oogenesis
生殖细胞-性染色体在卵子发生中的内在功能
  • 批准号:
    16K14740
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
A small non-coding RNA containing SINE/B1 motif functions in meiotic metaphase germ cells during spermatogenesis
含有 SINE/B1 基序的小非编码 RNA 在精子发生过程中在减数分裂中期生殖细胞中发挥作用
  • 批准号:
    26650129
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
バクテリア細胞内で周期移動する新規運動性タンパク質SopAの時空間解析
细菌细胞内周期性运动的新型运动蛋白 SopA 的时空分析
  • 批准号:
    17049027
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 3.97万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了