転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能

基本转录因子 TFIID 亚基 (TAF) 在转录调控中的分子功能

基本信息

批准号：
20052024
负责人：
古久保哲朗
金额：
$ 4.61万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20052024/
关键词：
転写調節機構転写因子基本転写因子転写制御出芽酵母 TFIID TAF TBP

项目摘要

コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、TATAボックス結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴因子(TAF1-14)から構成される巨大なタンパク質複合体であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。一方、5種類のサブユニット(TAF5,6,9,10,12)をTFIIDと共有するSAGAはヒストンをアセチル化するとともにTBPのTATA配列への結合を補助する働きを有する。コアプロモーター中にTATA配列を含むストレス誘導性遺伝子ならびにTATA配列を含まないハウスキーピング遺伝子はそれぞれ主にSAGA, TFIIDによって転写されると考えられているが、その詳細については不明な点が多い。今回我々は、TFIIDとSAGAの機能分担について新たな知見を得るべくChIP on chip解析を行った。具体的にはTFIIDの全サブユニット(TAF1-14, TBP)、SAGA(GCN5)、基本転写因子群(TFIIB(SUA7), TFIIE(TFA2), TFIIF(TFG1), TFIIH(TFB3)), NC2(BUR6, NCB2),RNAポリメラーゼII(RPB1)のC末端にエピトープタグを付加し、野生株及びtaf1変異株において、これらの因子がゲノム上(第III, IV, V染色体)のどの領域に結合するかを詳細に調べた。その結果、(1)TFIIBとNC2の機能連関、(2)TFIIDとSAGAのリボソーム遺伝子(RPG)プロモーターへの共結合、(3)RPGプロモーター上におけるtaf1変異による転写異常の分子機序、(4)TAF2の結合特異性、(5)コアプロモーターごとにTFIIDの高次構造が異なる可能性、等々複数の興味深い知見が得られた。

识别核心启动子结构的基本转录因子TFIID是由TATA盒结合蛋白（TBP）和14种与TBP相关的因子（TAF1-14）组成的巨大蛋白质复合物（TAF1-14），并且在转化从转录调节剂中获得的信号中的核心作用在提高或降低的转录水平中发挥了作用。另一方面，与TFIID共享五个亚基（TAF5、6、9、10、12）的Saga作用于乙酰酸组蛋白，并有助于将TBP与TATA序列结合。人们认为，核心启动子中包含TATA序列的应激基因和不包含TATA序列的管家基因主要由Saga和TfiID转录，但有关这些基因的细节许多未知细节。这次，我们进行了芯片分析的芯片，以获得对TFIID和SAGA功能划分的新见解。具体而言，将表位标签添加到所有TFIID亚基（TAF1-14，TBP），SAGA（GCN5），基本转录因子组（TFIIB（SUA7），TFIIE（TFIIE（TFA2），TFA2），TFIIF（TFG1），TFG1（TFG1），TFIIH（TFIIH（TFB3），NC2（TFB3），NC2（NC2）（NC2）（NC2）（tfaib（tfa2））， II（RPB1）以及在野生和TAF1突变体中，我们详细研究了这些因素的基因组（染色体III，IV和V）的哪个区域。结果，获得了几个有趣的发现，包括（1）TFIIB和NC2之间的功能连接，（2）TFIID和SAGA与核糖体基因（RPG）启动子的共同结合，（3）TAF1突变对RPG促进剂的特殊性和（4）的（4）（4）启动子的分子机械（4）（3） TFIID的高阶结构在每个核心启动子方面都不同，依此类推。