Principles of promoter acquisition mechanism in symbiogenesis

共生中启动子获取机制的原理

• 批准号: 20017015
• 负责人: OBOKATA Junichi
• 金额: $ 10.24万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20017015/
• 关键词: シンビオジェネシス; プロモーター獲得; クロマチンリモデリング; エピゲノム; H2A.Z; H3K4me3; 植物ゲノム; ChIP-on-chip解析; ChIP-on-chip; 遺伝子移動; プロモーター; コアプロモーター; 転写開始点; クリプティックプロモーター; 転写開始複合体; クロマチン免疫沈降

In endosymbiotic evolution, genes of the endosymbionts are gradually transferred to the host nucleus whereby they obtained new promoters to become functional host genes. We analyzed the molecular process of this promoter acquisition, using promoter trap lines of Arabidopsis as a model system. As a result, we found that the promoter acquisition occurs in three types ; namely de novo origination type, trapping preexisting promoter type, and the combination type of the former two. Further analyses of these subtypes revealed that the de novo origination of new promoters is closely related with chromatin remodeling that occurs at the insertion sites of the coding sequences.

在内共生进化中，内共生体的基因逐渐转移到宿主细胞核中，从而获得新的启动子，成为功能性宿主基因。我们使用拟南芥启动子捕获系作为模型系统，分析了该启动子获取的分子过程。结果，我们发现启动子获取分为三种类型；即从头起始型、捕获预先存在的启动子型、以及前两者的组合型。对这些亚型的进一步分析表明，新启动子的从头起源与编码序列插入位点发生的染色质重塑密切相关。

项目成果

シロイヌナズナ葉緑体ゲノム由来の核DNA (nupDNA)のプロモーター獲得について

关于拟南芥叶绿体基因组来源的核 DNA (nupDNA) 的启动子获取

• 发表时间: 2009
• 作者: 山本義治;松尾充啓;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

『盗葉緑体』によって光合成を行う嚢舌目ウミウシの検索

寻找利用“盗叶绿体”进行光合作用的 Cysticulata 海蛞蝓

• 发表时间: 2008
• 作者: 山本義治;種村尚典;遊佐陽一;平野弥生;平野義昭;本村泰三;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

Three novel subunits of Arabidopsis chloroplastic NAD(P)H dehydrogenase identified by bioinformatic and reverse genetic approaches.

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03680.x
• 发表时间: 2009
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: Atsushi Takabayashi;Noriko Ishikawa;T. Obayashi;S. Ishida;J. Obokata;T. Endo;F. Sato

Computational biology : ne wresearch

计算生物学：新研究

• 发表时间: 2009
• 作者: Russe AS 編 Yamamoto YY;Obokata J.(分担執筆)
• 通讯作者: Obokata J.(分担執筆)

ol IIの転写開始位置の決定に関わるコード領域の役割

编码区在决定ol II转录起始位置中的作用

• 发表时间: 2009
• 作者: 工藤久幸;山本義治;中邨真之;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一