シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明

阐明共生发生的启动子获取原理

基本信息

批准号：
17018017
负责人：
小保方潤一
金额：
$ 3.78万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

シンビオジェネシスとは細胞内共生者が宿主内でオルガネラ化する過程の総称であり、共生者ゲノムにコードされていた遺伝子群の宿主核への移動が生じる。この遺伝子移動は、遺伝子配列の宿主核へ転移と、それに引き続くプロモーターの獲得、という二つのステップを含んでいる。本研究では、植物核ゲノムをモデルに、ゲノム中に転移・挿入された新規構造遺伝子がプロモーターを獲得するメカニズムを、次の4つのアプローチから解析した。(1)植物ゲノム上の転写開始位置シグナルに関する解析TATA-boxやInrなどのコンセンサス配列を持たない植物プロモーターを詳細に解析し、植物ゲノム上の転写開始点の出現位置を比較的よく予測できるアルゴリズムを開発した。(2)植物のコアプロモーターに関する情報学的解析シロイヌナズナやイネのゲノム上で実際に機能している転写開始点やプロモーターの周辺領域について、包括的なモチーフの検索・抽出と種間比較を行い、塩基配列上で上記領域を特徴づける保存モチーフ群をカタログ化された。(3)遺伝子トラップ植物系統を用いた新生プロモーターの解析プロモーターのないマーカー遺伝子をシロイヌナズナの核にランダムに挿入し、野生型の転写単位とは無関係に挿入マーカーが発現した植物系統をT2,T3世代で同定し、新生プロモーターの候補を多数収集した。(4)クリプティックプロモーター活性化機構の解析プロモーターの新生に必要なシス因子を実験的に検討するため、種々のキメラ遺伝子群を設計作製し、シロイヌナズナに導入した。形質転換植物は順調に生育しており、その種子世代を用いて、次年度以降、実際の解析を行う。

Symbio Genesis是细胞中有机体进入宿主的过程的一般术语，也是基因组的宿主核的运动，该过程已被共生基因组编码。这种遗传运动包括两个步骤：基因序列中宿主核的转移，以及启动子之后的启动子的采集。在这项研究中，我们从以下四种方法中分析了一种已转移并插入基因组的新结构基因的机制，该基因已被转移并插入基因组中。（1）在植物基因组上的转录起始位置上没有共识序列（例如tata-box and inr）的肛门糖化，详细详细介绍了算法，可以很好地预测转录起点的外观位置植物基因组是开发的。（2）对植物的核心启动子的信息分析，铜和水稻基因组，转录起点和启动子周围的区域进行了全面的搜索，提取和对物种的比较。已分类。（3）使用遗传陷阱系统的新启动子的分析启动子被随机插入Shiroi Nunazuna的核，并且插入的标记物表达与野生型转移单元无关的植物系统是T2，T3生成。安装，并收集了许多新的发起人。（4）为了实验检查神秘启动子激活机制的新诞生所需的CIS因子，设计和创建了各种嵌合基因基团，并引入了Sirinnazuna。转化的植物正在平稳生长，实际分析将在下一个财政年度使用种子世代进行。