Development of a comprehensive method for expression profiling of theplant genome with the use of histone code.

开发使用组蛋白代码进行植物基因组表达谱分析的综合方法。

• 批准号: 23657040
• 负责人: OBOKATA Junichi
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23657040/
• 关键词: シロイヌナズナ; ChIP-seq 解析; クロマチンリモデリング; ヒストンコード; H2A.Z; 遺伝子予測; 発現プロファイリング; 植物ゲノム; 転写開始点; ヌクレオソーム; 転写領域; プロモーター

In order to develop a comprehensive method for expression profiling of the plant genome with the use of histone code, we examined the genome-wide distribution profile of a histone variant H2A.Z in reference to the external stimuli and the position and strength of the transcription start sites (TSSs). Our results suggest that the plant H2A.Z could be a relatively stable marker for the transcribed regions of the plant genome.

为了开发一种使用组蛋白代码进行植物基因组表达谱分析的综合方法，我们根据外部刺激以及转录的位置和强度检查了组蛋白变体 H2A.Z 的全基因组分布谱。起始站点 (TSS)。我们的结果表明植物 H2A.Z 可能是植物基因组转录区域的相对稳定的标记。

项目成果

高等植物において遺伝子コード領域の存在は転写型ジーンサイレンシングを抑制する

基因编码区的存在抑制高等植物中的转录基因沉默

• 发表时间: 2012
• 作者: 松尾充啓;佐藤壮一郎;工藤久幸;安井孝彰;中邨真之;木村宏;山本義治;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

植物ゲノム上でのプロモーター機能領域の出現に対するATG開始コドンの役割

ATG 起始密码子在植物基因组启动子功能区出现中的作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 佐藤壮一郎;松尾充啓;工藤久幸;木村宏;中邨真之;山本義治;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

A new driving force for the functional gene transfer during endo- symbiotic evolution

内共生进化过程中功能基因转移的新驱动力

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤壮一郎;Babiychuk Elena;松尾充啓;坂本智昭;倉田哲也;Kushnir Sergei;小保方潤一;Junichi Obokata
• 通讯作者: Junichi Obokata

シロイヌナズナTFIIF変異体のゲノムワイド転写開始点解析

拟南芥 TFIIF 突变体的全基因组转录起始位点分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤壮一郎;Babiychuk Elena;松尾充啓;坂本智昭;倉田哲也;Kushnir Sergei;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

遺伝子重複領域内のATG開始コドンの保存性が転写状態の持続性に及ぼす影響について

基因复制区域内 ATG 起始密码子的保守性对转录状态持续性的影响

• 发表时间: 2011
• 作者: 佐藤壮一郎;松尾充啓;工藤久幸;木村宏;中邨真之;山本義治;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一