大規模全ゲノム関連解析によるアトピー性喘息疾患遺伝子の探索

通过大规模全基因组关联分析寻找特应性哮喘疾病基因

• 批准号: 18018003
• 负责人: 野口 恵美子
• 金额: $ 5.44万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018003/
• 关键词: 喘息; 全ゲノム関連解析

本研究では一塩基置換多型(SNP)よる喘息全ゲノム関連解析の結果から陽性となったSNP(一次解析)をさらに家系およびケースコントロールのサンプルを用いて関連解析(二次解析、三次解析)を行うことにより疾患感受性遺伝子を探索することを目的とする。本年度は気管支喘息のSNPの全ゲノム解析により気管支喘息発症と関連するSNPとして同定されたPEX19-1073C/A(rs2820421)の機能解析実験およびin silico analysisを行った。疾患との関連が認められたrs2820421は50kbにまたがる大きな連鎖不平衡ブロックの中にありこのブロック内には4遺伝子が存在する。SNP発現解析ソフトウェアであるmRNA by SNPソフトウェアによるin silico analysisではrs2820421はWDR42R およびPEX19遺伝子の発現を調節しているという結果が示唆された。ルシフェラーゼアッセイによる転写解析ではrs2820421のCアレルの転写活性はAアレルと比較して有意に高く、さらにゲルシフトアッセイでは、Aアレルを含むオリゴヌクレオチドはCアレルを含むものよりも結合能が高いことが観察された。以上の結果から、rs2820421領域になんらかの転写因子が結合し、下流の遺伝子発現を調節することにより喘息の疾患感受性に関わっている可能性が示唆された(Fujimotoら、論文投稿中)。

在本研究中，使用家族和病例对照样本进一步分析了使用单核苷酸多态性（SNP）进行的哮喘全基因组关联分析中的阳性SNP（一级分析）（二级分析、三级分析）。就是寻找疾病易感基因。今年，我们对PEX19-1073C/A（rs2820421）进行了功能分析实验和计算机分析，通过对与支气管哮喘相关的SNP进行全基因组分析，将其鉴定为与支气管哮喘发病相关的SNP。已发现与该疾病相关的rs2820421位于一个跨越50kb的大型连锁不平衡块中，该块包含四个基因。通过 SNP 软件（一种 SNP 表达分析软件）使用 mRNA 进行的计算机分析表明，rs2820421 调节 WDR42R 和 PEX19 基因的表达。使用荧光素酶测定的转录分析表明，rs2820421的C等位基因的转录活性显着高于A等位基因的转录活性，并且凝胶位移测定表明含有A等位基因的寡核苷酸比含有C等位基因的寡核苷酸具有更高的结合能力。完毕。上述结果表明，某些转录因子与rs2820421区域结合，可能通过调节下游基因表达参与哮喘疾病易感性（Fujimoto等人，论文进行中）。

项目成果

アレルギー疾患の遺伝子配列解析研究の進歩と現状

过敏性疾病基因序列分析研究进展及现状

• 发表时间: 2007
• 作者: Toriba;Akira;間陽子;Khee-Gan Lee;野口恵美子
• 通讯作者: 野口恵美子

アレルギー疾患の遺伝要因

过敏性疾病的遗传因素

• 发表时间: 2007
• 期刊: 日本小児アレルギー学会雑誌 21
• 作者: Harinantenaina;L. ; Takahara;Y. ; Nishizawa;T. ; Kohchi;C. ; Soma;G.-I. ; Asakawa;Y;矢野興一;野口恵美子
• 通讯作者: 野口恵美子

網羅的遺伝子発現解析による喘息関連遺伝子の同定

通过综合基因表达分析鉴定哮喘相关基因

• 发表时间: 2007
• 作者: 青木健、野口恵美子;ら
• 通讯作者: ら

喘息の薬理遺伝学

哮喘的药物遗传学

• 发表时间: 2007
• 期刊: International Review of Asthma 9
• 作者: Hirano;T.;et al.;野口恵美子
• 通讯作者: 野口恵美子

全ゲノム関連解析による気管支喘息疾患感受性遺伝子の同定

通过全基因组关联分析鉴定支气管哮喘疾病易感基因

• 发表时间: 2007
• 作者: 藤本正弥、野口恵美子;ら
• 通讯作者: ら