蛋白質を基とした複核金属配位空間の機能化設計

基于蛋白质的双核金属配位空间的功能设计

基本信息

  • 批准号:
    17036037
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.9万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ニッケル含有加水分解酵素ウレアーゼの活性部位を柔軟性配位空間とし、複核金属配位空間(2つの金属イオンが協同的に働く反応場)を分子設計した。金属置換法および配位空間周辺アミノ酸置換法による構造制御により、金属複核酵素の機能発現における活性部位構造因子の解明および新規機能を有する人工金属複核酵素開発のための基礎的知見を得ることを目指し、「ホモ複核金属配位空間による酸化機能発現」および「ヘテロ複核金属配位空間の構築」を行った。本研究課題の結果、ウレアーゼの活性中心金属イオンをニッケルから鉄、銅、マンガンに置換したホモ複核金属置換ウレアーゼが酸化活性(ペルオキシダーゼ、カタラーゼ、オキシゲナーゼ)を持つことを見いだした。反応活性は、マンガン、鉄、銅イオンの順で高くなった。また、配位アミノ酸によって、酸化活性化状態が制御されていることも明らかにした。鉄置換体では、酸素性配位アミノ酸残基(Glu)が多いほど活性が向上し、銅置換体では、芳香族窒素性配位アミノ酸残基(His)が多いほど活性向上することがわかった。これらの研究成果により、金属酵素の活性部位の構造変異によって酵素機能が変換されるという新しい知見が得られた。さらに、本研究課題において、複核金属配位空間における2つの金属イオンが異なるヘテロ複核金属配位空間の構築にも成功した。ニッケル・鉄ヘテロ複核金属酵素として知られているヒドロゲナーゼと類似構造を活性部位に持つウレアーゼを調製した。ニッケル・鉄ヘテロ複核ウレアーゼの活性部位における2つの金属イオンは、硫黄によって架橋している。この研究成果によって、生体金属のみならず、様々な金属イオンを金属酵素内の柔軟性配位空間に取り込んだ応用性の高い新機能性人工金属酵素の開発に必要な新規手法を提唱することができた。
含镍水解酶尿布的活性位点用作柔性配位空间,分子设计用于设计二核金属配位空间(两个金属离子一起工作的反应场)。通过使用金属取代方法和协调空间的氨基酸取代法控制结构,我们旨在阐明金属二核酸酶功能表达中的主动位点结构因子,并获得具有新功能的人造金属二核酸酶开发的基本知识,并旨在“通过同型金属协调空间”和“构造” HELYODINCERICENCERICE offors of of NOMET功能,并“表达氧化功能”。由于这个研究主题,我们发现均核金属取代的尿素,其中活性的尿素中央金属离子被铁,铜和锰的镍代替,具有氧化活性(过氧化物酶,过氧化氢酶,氧合酶)。反应活性在锰,铁和铜离子的顺序上增加。还揭示了氧化激活状态由配位氨基酸控制。发现存在氧气协调的氨基酸残基(GLU)越多,氧气协调的氨基酸残基(GLU)越多,并且较芳香的氮协调氨基酸残基(他)越芳族氨基酸残基(他)的活动越多。这些发现提供了新的发现,即酶功能可以通过金属酶的活性位点中的结构突变转化。此外,在这个研究主题中,我们还成功地构建了一个异地核金属协调空间,在该空间中,双核金属协调空间中的两个金属离子不同。在活性位点与称为镍铁核金属化酶的氢化酶中具有相似结构的尿素。镍铁核尿酶的活性位点的两个金属离子通过硫交联。这项研究结果使我们能够提出一种开发高度适用的新功能人造金属酶所需的新方法,不仅将生物金属,而且还融合了各种金属离子,还将各种金属离子纳入金属酶内的柔性协调空间。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Preparation and Characterization of Ca^<2+>-free Methanol Dehydrogenase from Hyphomicrobium denitrificans A3151
来自脱氮丝微菌A3151的无Ca^2甲醇脱氢酶的制备和表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M.Nojiri;D.Hira;K.Yamaguchi;T.Okajima;K.Tanizawa;S.Suzuki
  • 通讯作者:
    S.Suzuki
Structural Reorganization of Copper Binding Site Involving Thr^<15> of Mavicyanin from Cucurbita pepo medullosa (Zucchini) upon Reduction
还原后涉及来自西葫芦 (Zucchini) 的 Mavicyanin Thr^<15> 的铜结合位点的结构重组
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Y.Xie;T.Inoue;Y.Miyamoto;H.Matsumura;K.Kataoka;K.Yamaguchi;M.Nojiri;S.Suzuki;Y.Kai
  • 通讯作者:
    Y.Kai
Cu(I) and Cu(II) Complexes Containing Nitrite and Tridentate Aromatic Amine Ligand as Models for Substrate-Binding Type 2 Cu Site of Nitrite Reductases
含有亚硝酸盐和三齿芳香胺配体的 Cu(I) 和 Cu(II) 配合物作为亚硝酸盐还原酶底物结合 2 型 Cu 位点的模型
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    H.Yokoyama;K.Yamaguchi;M.Sugimoto;S.Suzuki
  • 通讯作者:
    S.Suzuki
Roles of Trp144 and Tyr203 in copper-containing nitrite reductase from Achromobacter cycloslastes IAM1013
Trp144 和 Tyr203 在无色杆菌 IAM1013 含铜亚硝酸还原酶中的作用
The Intramolecular Electron Transfer between the Type 1 Cu and the Type 2 Cu Centers in a Mutant of Hyphomicrobium Nitrite Reductases
丝菌亚硝酸还原酶突变体中 1 型 Cu 和 2 型 Cu 中心之间的分子内电子转移
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Suzuki;T.Maetani;K.Yamaguchi;K.Kobayashi;S.Tagawa
  • 通讯作者:
    S.Tagawa
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

山口 和也其他文献

ヒドラジンを利用したアゾベンゼンへの選択的脱水素芳香環形成反応
肼选择性脱氢芳环生成偶氮苯反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    林 威辰;谷田部 孝文;山口 和也
  • 通讯作者:
    山口 和也
CeO2担持Niナノ粒子触媒を用いたアクセプターレス脱水素芳香環形成反応
CeO2负载Ni纳米粒子催化剂的无受体脱氢芳环形成反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    松山 剛大;谷田部 孝文;矢部 智宏;山口 和也
  • 通讯作者:
    山口 和也
担持Niナノ粒子触媒を用いたベンジル位脱水素シリル化反応
使用负载型镍纳米粒子催化剂的苄基位脱氢硅烷化反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    虞 晴;谷田部 孝文;松山 剛大;古森 将也;矢部 智弘;山口 和也
  • 通讯作者:
    山口 和也
N-ヒドロキシフタルイミドおよび担持Pd複合触媒によるアミドのα酸素化反応
N-羟基邻苯二甲酰亚胺和负载Pd复合催化剂的酰胺α-氧化反应
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    谷田部 孝文;八村 信輝;若林 空良;竹井 大輔;山口 和也
  • 通讯作者:
    山口 和也
担持Ni-Pd二元金属触媒によるチオールのC-S結合切断を経る選択的スルフィド合成
使用负载型 Ni-Pd 双金属催化剂通过硫醇的 C-S 键断裂选择性合成硫化物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三田村 侃樹;谷田部 孝文;山本 喜大;矢部 智宏;水野 哲孝;山口 和也
  • 通讯作者:
    山口 和也

山口 和也的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('山口 和也', 18)}}的其他基金

Creation of ordered multinuclear active site structures from mononuclear metalates and development of highly difficult reactions using small molecules
从单核金属盐创建有序多核活性位点结构并使用小分子开发高难度反应
  • 批准号:
    22H04971
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
New Strategy for Green Synthesis and Conversion of Nitrogen-Containing Compounds Using Function Integrated Heterogeneous Catalysts
功能集成多相催化剂绿色合成与转化含氮化合物的新策略
  • 批准号:
    22H00270
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
ソフトマテリアル場における生体金属モデル錯体の挙動 触媒機能に対する反応場の影響
生物金属模型复合体在软材料领域的行为:反应场对催化功能的影响
  • 批准号:
    23550075
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
固体表面の精密設計による高機能選択酸化触媒の開発
通过固体表面的精确设计开发高性能选择氧化催化剂
  • 批准号:
    17034012
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ファインケミカルズ合成を指向した実用的不均一触媒反応系の開発
精细化工合成实用多相催化反应体系的开发
  • 批准号:
    16760620
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ヘテロポリ化合物と遷移金属の複合錯体を用いた環境調和型酸化反応系の開発
使用杂多化合物和过渡金属的络合物开发环境友好的氧化反应体系
  • 批准号:
    14750623
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
グリーンケミストリーを指向した環境調和型触媒反応系の開発
开发面向绿色化学的环境友好型催化反应体系
  • 批准号:
    00J01663
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
加水分解反応を触媒するニッケル複核錯体の創製
催化水解反应的镍双核配合物的制备
  • 批准号:
    08740520
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ニッケル含有酵素であるウレアーゼの構造と機能
含镍酶脲酶的结构和功能
  • 批准号:
    06740506
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

芳香環配位カプセルの空間修飾による超選択的テルペン環化反応
芳香环配位胶囊空间修饰的超选择性萜烯环化反应
  • 批准号:
    23K13760
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Low loss transport of slow neutrons with precision phase space manipulation
通过精确相空间操纵实现慢中子的低损耗传输
  • 批准号:
    23H03659
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Chemistry of Synergistic Interface Space for Trace Detection/Separation/Conversion of Toxic and Harmful Substances
有毒有害物质痕量检测/分离/转化的协同界面空间化学
  • 批准号:
    22H05005
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
中山間水田地帯の農地管理力と収益力が評価できる空間的地目・作目配置評価モデル
评价丘陵山地稻田耕地经营能力和效益的空间土地类型/作物布局评价模型
  • 批准号:
    22K05897
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
触媒ドメインの協奏的融合による高効率物質変換システムの実現
通过催化域的协同融合实现高效材料转化系统
  • 批准号:
    22K05128
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.9万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了