水チャネルの選択性とその制御機構の解明

水通道选择性及其控制机制的阐明

基本信息

项目摘要

昨年度、AQP4の二次元結晶二枚が細胞外ループで相互作用してできた特殊な二次元結晶について、電子回折図形と電子顕微鏡像を同じ結晶から続いて撮影して、それを基に電子線結晶構造解析を行う手法を開発した。これについては今年度論文発表を行った。また、この構造解析法を用いて、AQP4の原子モデルを3.2Å分解能で決定し、そこから、生体中で観察できるAQP4の脂質二重層内での格子形成のメカニズムを明らかにした。この相互作用にはアルギニンとチロシンの側鎖同士の水素結合が関与しており、この相互作用はN末付近にあるアルギニンにより阻害されると考えられる。実際、天然には23番目のメチオニンよりN末側がないサブタイプがあることが知られており、このタイプのAQP4を発現すると、大きな格子を形成することが知られている。これにより、二つのサブタイプを共存されることにより、天然に局在しているAQP4の格子の大きさがコントロールされているという機構が明らかになった。また、結晶中での細胞外のループ同士の相互作用が明らかになったので、その天然での役割についても研究を継続している。AQP0については細胞外同士の相互作用が細胞接着に利用されているという知見が得られており、このような性質が水チャネル、アクアポーリンのもう一つの機能として広く利用されている可能性もある。これ以外にAQP1の分子動力学シミュレーションから、水の効率的な透過に重要と考えられる残基がいくつか特定できたので、それらの部位の変異体を、昆虫由来のSf9細胞とバキュロウイルスを用いて発現する系を確立した。今後、この発現した蛋白質を用いて機能測定を行い、効率的な水透過の詳細な分子機構を明らかにしたいと思う。最後にAQP3に関しは、Sf9細胞を用いて1L培養液から数mgの蛋白質を定常的に得られるようになったので、電子線結晶構造解析の進展が期待される。
去年,我们开发了一种使用电子衍射模式和电子显微镜图像分析电子束晶体结构的方法,该图像是通过与两个AQP4二维晶体相互作用的特殊二维晶体的图像。今年的论文发表了。使用这种结构分析方法,以3.2Å分辨率确定了AQP4的原子模型,从中,可以在活生物体中观察到AQP4脂质双层中晶格形成的机理。这种相互作用涉及精氨酸和酪氨酸的侧链之间的氢键,并且认为这种相互作用被位于N末端附近的精氨酸抑制。实际上,众所周知,有一种自然不是N末端的亚型,而不是第23甲硫氨酸,并且在表达这种类型的AQP4时,已知它会形成一个大的晶格。这揭示了一种机制,即自然局部AQP4晶格的大小通过共存两个亚型来控制。此外,由于已经揭示了晶体中细胞外回路之间的相互作用,因此研究也继续在其自然作用上发挥作用。关于AQP0,已经发现细胞外相互作用用于细胞粘附,并且该特性可能被广泛用作水通道Aquaporin的另一个功能。除此之外,我们还确定了几个残基,这些残基被认为对AQP1的分子动力学模拟有效渗透至关重要,并且我们建立了一个系统,其中使用昆虫衍生的SF9细胞和杆状病毒表达这些位点的突变体。将来,我们希望使用这种表达的蛋白质进行功能测量,以阐明有效的水渗透的详细分子机制。最后,关于AQP3,可以使用SF9细胞从1L培养基中不断获得几毫克的蛋白质,并且可以预期会发生电子束晶体结构分析的进步。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Peter Agre: "Aquaporin water channels -from atomic structure to clinical medicine"J.Physiol.. 542. 3-16 (2002)
Peter Agre:“水通道蛋白水通道——从原子结构到临床医学”J.Physiol.. 542. 3-16 (2002)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Atsunori Oshima: "Roles of Met-34, Cys-64, and Arg-75 in the Assmbly of Human Connexin 26"J.Biol.Chem.. 278(3). 1807-1816 (2003)
Atsunori Oshima:“Met-34、Cys-64 和 Arg-75 在人类连接蛋白 26 组装中的作用”J.Biol.Chem.. 278(3)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Yoshinori Fujiyoshi: "Structure and function of water channels"Curr.Opin.Struct.Biol.. 12(4). 509-515 (2002)
藤吉义德:“水通道的结构和功能”Curr.Opin.Struct.Biol.. 12(4)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Improved specimen preparation for cryo-electron microscopy using a symmetric carbon sandwich technique
  • DOI:
    10.1016/j.jsb.2004.01.012
  • 发表时间:
    2004-06-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Gyobu, N;Tani, K;Fujiyoshi, Y
  • 通讯作者:
    Fujiyoshi, Y
Nobuhiko Gyobu: "Improved specimen preparation for cryo-electron microscopy using a symmetric carbon sandwich technique"Journal of Structural Biology. 印刷中. (2004)
Nobuhiko Gyobu:“使用对称碳夹层技术改进冷冻电子显微镜的样品制备”《结构生物学杂志》(2004 年)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

光岡 薫其他文献

はやぶさ2とキュレーション体制&その後
Hayabusa2 和策展系统及其他
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    今井 洋;加藤 貴之;Christoph Gerle;武藤 悦子;光岡 薫;栗栖 源嗣;難波 啓一;昆 隆英;S. Matsuyama;圦本尚義
  • 通讯作者:
    圦本尚義
小さな膜タンパク質KcsAのクライオ電子顕微鏡法による構造解析の取り組み
使用冷冻电子显微镜分析小膜蛋白 KcsA 的结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高﨑 寛子;清水 啓史;梶村 直子;光岡 薫;安永 卓生
  • 通讯作者:
    安永 卓生
クライオ電子顕微鏡の共同利用施設利用と解析例
冷冻电子显微镜共用设施使用及分析实例
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Koki Takano;Kohei Yamasue;Toshiaki Kato;Toshiaki Kato and Yasuo Cho;Yusuke Nomura;光岡 薫
  • 通讯作者:
    光岡 薫
Front-end circuits for MPPCs for the KOTO CsI calorimeter upgrade
用于 KOTO CsI 热量计升级的 MPPC 前端电路
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山本 遼介;中桐 侑平;久冨 理;今井 洋;Chihong Song;村田 和義;光岡 薫;若林 憲一;石川 尚;稲葉 一男;昆 隆英;Nobuhiro Hara
  • 通讯作者:
    Nobuhiro Hara
Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築
用于冷冻电镜分析的脂质转运ABC蛋白生产和制备平台的构建
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小段 篤史;光岡 薫;木村 泰久;木岡 紀幸;植田 和光
  • 通讯作者:
    植田 和光

光岡 薫的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('光岡 薫', 18)}}的其他基金

単粒子解析による高分解能構造解析技術の開発
开发利用单粒子分析的高分辨率结构分析技术
  • 批准号:
    18054035
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
膜蛋白質局在化機構を利用した結晶化法の開発
利用膜蛋白定位机制开发结晶方法
  • 批准号:
    12878123
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
膜蛋白質の原子レベルでの構造解析用システムの開発
开发原子水平膜蛋白结构分析系统
  • 批准号:
    10780410
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

Study of dynamic three-dimensional structure of pathogenic bacterial pili and its host cell adhesion mechanism by X-ray structure and cryo-EM
X射线结构和冷冻电镜研究病原菌菌毛动态三维结构及其宿主细胞粘附机制
  • 批准号:
    23K04944
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Structural basis for the induction of dormancy in Mycobacterium tuberculosis
结核分枝杆菌休眠诱导的结构基础
  • 批准号:
    23H02417
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation of biosynthetic mechanism of diazo group-containing amino acid and the application to novel amino acid production system
含重氮氨基酸生物合成机制的阐明及其在新型氨基酸生产系统中的应用
  • 批准号:
    22KJ1046
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Mechanistic study of quaternary structure changes of a LysR- type transcriptional regulator
LysR型转录调节因子四级结构变化的机制研究
  • 批准号:
    22H02563
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Observation of atomic charges in organic microcrystals by synchrotron and electron beam sources
通过同步加速器和电子束源观察有机微晶中的原子电荷
  • 批准号:
    22K14557
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 33.92万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了