コドン選択

密码子选择

基本信息

批准号：
03222105
负责人：
池村淑道
金额：
$ 15.55万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1989
资助国家：
日本
起止时间：
1989 至 1991
项目状态：
已结题

项目摘要

コドン選択を決めている要因を網羅的に解析し、コドン選択の持つ生物学的意味の総合的理解を目指した。コドン3文字目が極端にGCに富むヒト遺伝子類が熱安定性の高いTバンドや末端Rバンドに集中する傾向を見い出した。ヒト染色体では染色体ごとにTバンド領域の大きさが異なるが、この染色体ごとの性質と、コドン選択とが関連することが示された。GC含量の大きく変化する領域での構造解析を行った(池村)。温血動物でポリユビキチン遺伝子はGCに富む領域に、モノユビキチン遺伝子はATに富む領域に位置すると推定され、異なったコドン選択性を有する。遺伝子発現機構との関係を解析した(三田)。コドン選択性と蛋白質合成効率の関係を明らかにした。放線菌へ低使用頻度コドンを持つ遺伝子を導入すると、蛋白合成率が低いことが示され、その際のUUA解読もRNAの働きが明らかになった(熊谷)。コドン3文字目によるAT/GC使用の相殺調節を解析し、種の特異性を超えた塩基配列に関する共通法則を求めた(和田)。方向性のある変異圧によりコドン選択に偏りが生じ不使用コドンができ,tRNAも使用されずunassigned codonを生じ、tRNAの変化で他のアミノ酸に捕獲される。強いAT圧が働いたマイコプラズマでのコドン、アンチコドンの系統を追った変化をたどり、UGAのTrpコドンへの変化の道筋を明らかにした(武藤)。HIVとHBVウィルスでの塩基置換パタ-ンの解析から複製酵素のエラ-生成時の性質の差を明らかにし、AT/GC圧を量的に推定する方法を開発した(五條堀)。方向性のある変異圧とDNA複製機構との関連につき、大腸菌mutT遺伝子産物を用いた酵素学的解析を行った。AーTからCーGへのトランスバ-ジョンがヌクレオチドプ-ルに含まれる微量の変異原性誘導体に起因し、mutT蛋白質はこれを分解する酵素であるとの結果を得た(真木)。

我们全面分析了确定密码子选择的因素，并旨在全面了解密码子选择的生物学含义。我们发现，在第三个密码子处具有极高GC的人类基因的人类基因的趋势，将其集中在T频段和末端R波段中，这是高度可热的。尽管人类染色体中每个染色体的T波段区域的大小都不同，但已显示这种特异性特异性性质和密码子选择相关。在GC含量变化很大的地区进行了结构分析（Ikemura）。在温血动物中，假定聚泛素基因位于富含GC的区域，并且发现单纤维蛋白基因位于具有不同的密码子选择性的富富区域。分析了与基因表达机制的关系（MITA）。阐明了密码子选择性与蛋白质合成效率之间的关系。当将低使用密码子的基因引入放线菌中时，蛋白质的合成较低，并且此时在UUA解密中也揭示了RNA的功能（Kumagaya）。我们使用第三个密码子分析了AT/GC的偏移调整，并找到了有关超过物种特异性（WADA）的核苷酸序列的普通法。定向突变压力偏置密码子选择并创建未使用的密码子，从而导致未分配的密码子，该密码子未在tRNA中使用，导致未分配的密码子，由于tRNA的变化，其他氨基酸捕获。在支原体中施加了强烈的压力上的密码子和反密码子谱系之后的变化，揭示了向UGA中TRP密码子变化的途径（Muto）。我们已经开发了一种通过分析HIV和HBV病毒（Gojohori）中的基本掩物模式来定量估计/GC压力的方法。使用大肠杆菌基因产物进行酶促分析，以连接方向突变压力和DNA复制机制。从A-T到C-G的横向归因于核苷酸池中包含的痕量诱变衍生物，而MUTT蛋白是一种降解（Maki）的酶。