Study on the mechanism of docking of small molecules to proteins by generalized-ensemble algorithms
广义集成算法研究小分子与蛋白质对接机制
基本信息
- 批准号：25247071
- 负责人：
- 金额：$ 27.96万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
- 财政年份：2013
- 资助国家：日本
- 起止时间：2013-04-01 至 2018-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
项目成果
期刊论文数量（144）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Prediction of ligand binding affinity by the combination of replica-exchange method and double-decoupling method
复制交换法和双解偶联法相结合预测配体结合亲和力
- DOI：10.1021/ct500539u
- 发表时间：2014
- 期刊：
- 影响因子：5.5
- 作者：Y. Okamoto;H. Kokubo;and T. Tanaka
- 通讯作者：and T. Tanaka
Prediction of Protein-Ligand Binding Structures by Replica-Exchange Umbrella Sampling Simulations: Application to Kinase Systems
- DOI：10.1021/ct4004383
- 发表时间：2013-10-01
- 期刊：
- 影响因子：5.5
- 作者：Kokubo, Hironori;Tanaka, Toshimasa;Okamoto, Yuko
- 通讯作者：Okamoto, Yuko
Two-Dimensional Replica-Exchange Method for Predicting Protein-Ligand Binding Structures
- DOI：10.1002/jcc.23427
- 发表时间：2013-11-15
- 期刊：
- 影响因子：3
- 作者：Kokubo, Hironori;Tanaka, Toshimasa;Okamoto, Yuko
- 通讯作者：Okamoto, Yuko
Generalized-ensemble algorithms: enhanced conformational sampling methods
广义集成算法：增强的构象采样方法
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：菅原正;鈴木健太郎;小林俊輝，松木賢一郎，生田力三，三木茂人，山下太郎，寺井弘高，山本俊，小芦雅斗，向井哲哉，井元信之;牛腸ヒロミ・佐々井啓・平田耕造・藤田雅夫・布施谷節子・増子富美・石原久代・長山芳子編 雙田珠己(共著);Yuko OKAMOTO
- 通讯作者：Yuko OKAMOTO
Efficient sampling methods for complex systems
复杂系统的高效采样方法
- DOI：
- 发表时间：2015
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Martinez C. C.;K. Shiokawa;Y. Miyoshi;M. Ozaki;I. Schofield and M. Connors;Yuko OKAMOTO
- 通讯作者：Yuko OKAMOTO
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