ウシ肝cDNAマイクロアレイの評価と妊娠ウシ肝の特異発現遺伝子の検索

牛肝cDNA微阵列评价及妊娠牛肝差异表达基因的寻找

基本信息

批准号：
16658105
负责人：
橋爪一善
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Iwate University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

ウシ肝臓由来cDNAクローンを基に作製したウシ肝cDNAマイクロアレイの有効性を未知クローンの配列、機能、発現動態の解析、検証することから、ウシ肝の生理状態の把握および疾病診断に適用できる汎用的なアレイの開発を目的として、より広範な遺伝子情報を集積した約10,000オリゴ情報からなるアレイを作製した。発現遺伝子動態の解析には体細胞クローンウシと通常の方法で作出したウシ肝臓を用いた。体細胞クローンウシでは病理および組織学的に変異を示す肝臓が認められるが、著しい病理変異を示さない肝臓であっても数%の遺伝子の発現変動を認め、cDNAアレイに含む数多くの遺伝子情報は、現在のところ機能が十分明確でなくとも肝臓の機能診断に有効な情報であることが示唆された。また、機能および遺伝子の全配列が不明であったcDNAクローンからその発現動態およびin silico解析により、2種の新規遺伝子であるプロラクチン関連タンパク質(PRP)遺伝子を同定し、PRP-VIIIおよび-IXと命名するとともに、in situ hybridizationにより主たる発現細胞が胎盤の二核細胞であることを証明した。加えて、これまで開発してきたウシ肝cDNAマイクロアレイおよび子宮・胎盤cDNAマイクロアレイ上の共通する遺伝子の検証およびin silico解析することから、約10,000オリゴを配置したウシオリゴアレイを作製した。このオリゴアレイは約2,620個の肝由来クローン情報および約1,730個の子宮・胎盤由来クローンを軸として、Gene Bank Database情報を基に抽出した約5,600遺伝子の60塩基配列からなる個別遺伝子情報を集積したものである。尚、本アレイの作製は、これまでアレイ開発で連携してきた農業生物資源研究所のグループとの共同成果である。

通用 - 可用来掌握肝脏的月经状态的普通液，并分析牛肝cDNA微层的有效性，这是基于牛肝脏衍生的cDNA克隆制成的，以理解和验证肝脏的月经状态并将其应用于肝脏的诊断。为了分析表达基因动力学，使用了以正常方式产生的细胞固定克隆粉丝和肝脏。概要细胞克隆肝脏的肝脏表明病理和组织突变，但即使在肝脏中没有显着的病理突变，也识别了几个基因的基因表达波动，并且识别出许多基因的基因波动，并且cDNA阵列中包含许多遗传信息目前，即使该功能还不够清晰，它也建议它有效肝功能诊断。另外，从cDNA克隆中，该功能和基因是未知的，而在硅氧基上分析中，两个新基因，催乳素相关的蛋白（PRP）基因以及PRP-VIII和-ix原位杂交证明了主要表达细胞是胎盘的两个核细胞。此外，通过在Cadden cdna cDNA微层上的公共基因的验证和铂cDNA Microway创建了一个大约10,000个寡核的USHIO RIGO阵列，该基因已在迄今已开发并在Silico进行了分析。这种寡素体基于约2,620个肝脏的克隆，大约1,730个子宫和胎盘衍生的克隆，积累了由约5,600个基因组成的单个基因信息，该基因约为5,600个基因，基于基因库数据库信息。该阵列的生产是与一组农业生物资源研究所的合作，该研究所通过阵列开发与之联系在一起。

项目成果

期刊论文数量（14）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Developmental aberration of liver gene expression in bovine fetuses derived from somatic cell nuclear transplantation.

体细胞核移植牛胎儿肝脏基因表达的发育异常。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Clon.Stem Cells 8(In press)
影响因子：
0
作者：
Hearth CB;Ishiwata H;Shiojima S;Kadowaki T;Katsuma S;Ushizawa K;Imai K;Takahashi T;Hirasawa A;Takahashi S;Izaike Y;Tsujimoto G;Hashizume K
通讯作者：
Hashizume K

Cloning of the bovine antiapoptotic regulator, BCL2-related protein A1, and its expression in trophoblastic binucleate cells of bovine placenta.

牛抗凋亡调节因子 BCL2 相关蛋白 A1 的克隆及其在牛胎盘滋养层双核细胞中的表达。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Biol Reprod 74
影响因子：
0
作者：
Ushizawa K ;et. al.
通讯作者：
et. al.

Gene expression profiles of bovine trophoblastic cell line (BT-1) analyzed by a custom cDNA microarray.

DOI：
10.1262/jrd.16072
发表时间：
2005-04
期刊：
The Journal of reproduction and development
影响因子：
0
作者：
K. Ushizawa;Toru Takahashi;K. Kaneyama;T. Tokunaga;Y. Tsunoda;K. Hashizume
通讯作者：
K. Ushizawa;Toru Takahashi;K. Kaneyama;T. Tokunaga;Y. Tsunoda;K. Hashizume

Bovine trophoblast cell culture systems. In Method in Molecular Medicine, Vol.121 Placenta and Trophoblast : Methods and Protocols, Vol.1

牛滋养层细胞培养系统。