Genomic profiling and drug screening among organoids derived from ovarian cancer patients

卵巢癌患者类器官的基因组分析和药物筛选

基本信息

批准号：
21H03074
负责人：
織田克利
金额：
$ 11.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

【目的】2021年度は（１）婦人科がんにおいて、オルガノイド培養株を樹立し、ゲノムプロファイリングや薬剤感受性試験を行う、（２）本学独自のがん遺伝子パネル検査Todai OncoPanelの性能評価、（３）TOPの婦人科がんにおける有用性の検証を行うことを研究目的とした。【方法】（１）婦人科がんの手術摘出検体においてオルガノイド培養系を行い、長期培養が可能であった子宮頚部小細胞癌において、全エクソンシークエンス解析、RNA-Sequenceを行った。（２）卵巣がんなどの各種固形がん23例について、DNAとRNAのTwin panelであるTodai OncoPanel(TOP)の解析結果（従来版TOP1と改良版TOP2）、全エクソンシークエンス結果と比較し、遺伝子変異頻度（TMB: Tumor Mutational Burden）の評価精度を検証した。（３）TOP1先進医療B実施200例について、婦人科がん症例の変異プロファイルを検討した。【成績】（１）子宮頸癌、子宮体癌、卵巣癌の各検体においてオルガノイドの短期的な培養系を確立した。このうち子宮頚部小細胞癌症例において、オルガノイドを用いたゲノム解析が可能であり、薬剤感受性の準備を進めた。（２）TMBの評価において、TOP2において全エクソンシークエンス結果とより相関が高い結果が得られ、論文投稿準備に進んだ。（３）TOP1先進医療B実施61例につき、卵巣癌、子宮体癌、子宮頸癌のそれぞれについて組織型とGenotypeの関連性をまとめ、学会で報告を行った。【結論】オルガノイド培養系を樹立し、マルチオミクス解析データと薬剤感受性の統合に向けた準備を進めた。TOP2における性能の向上を確認するとともに、婦人科がんにおけるTOPの有用性を明らかとした。

[目的]在2021财年，我们将（1）建立妇科癌症类器官培养系并进行基因组分析和药物敏感性测试，（2）评估我校独特的癌症基因面板测试Todai OncoPanel的性能，（3））该研究的目的是验证 TOP 在妇科癌症中的有用性。 [方法]（1）对手术切除的妇科肿瘤标本进行类器官培养系统，对可长期培养的宫颈小细胞癌进行全外显子序列分析和RNA序列分析。 (2) 比较了DNA和RNA双胞胎panel（TOP）（传统版TOP1和改进版TOP2）的分析结果以及23例卵巢癌等各种实体癌的所有外显子测序结果，我们验证了基因突变频率（TMB：肿瘤突变负担）的评估准确性。 (3)对200例TOP1高级医疗B病例进行妇科癌症病例突变谱检测。 [结果]（1）建立了宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌各标本的类器官短期培养体系。使用类器官进行基因组分析可以用于宫颈小细胞癌病例，并做好准备以确定药物敏感性。（2）TMB评估中，在TOP2中得到了与所有外显子序列结果相关性较高的结果，我们着手准备论文投稿。（3）总结了61例TOP1先进医疗B病例的卵巢癌、子宫内膜癌、宫颈癌组织类型与基因型的关系，并在学术会议上报告。 [结论]我们建立了类器官培养体系，为整合多组学分析数据和药敏做好了准备。我们确认了 TOP2 的性能改进，并阐明了 TOP 在妇科癌症中的有用性。

项目成果

期刊论文数量（26）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

卵巣癌におけるゲノム医療とHRD検査の位置づけ

基因组医学和 HRD 检测在卵巢癌中的定位

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
織田　克利
通讯作者：
織田　克利

Development of an automated system for diagnosing endometrial cancer using deep learning technology in hysteroscopy

开发利用宫腔镜深度学习技术诊断子宫内膜癌的自动化系统

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yu Takahashi1; Kenbun Sone1; Yusuke Toyohara1; Yuichiro Miyamoto1; Michihiro Tanikawa1; Mayuyo Mori1; Tetsushi Tsuruga1; Osamu Hiraike1; Katsutoshi Oda1; Masanori Maruyama2; Yutaka Osuga1; Tomoyuki Fujii1
通讯作者：
Tomoyuki Fujii1

The SMC5/6 complex recruits the PAF1 complex to facilitate DNA double‐strand break repair in Arabidopsis

拟南芥中的 SMC5/6 复合物招募 PAF1 复合物以促进 DNA 双链断裂修复

DOI：
10.15252/embj.2022112756
发表时间：
2023-02-23
期刊：
The EMBO Journal
影响因子：
0
作者：
Cunliang Li;Yuyu Guo;Lili Wang;Shunping Yan
通讯作者：
Shunping Yan

Effect of primary prophylaxis with pegfilgrastim in endometrial cancer patients treated with doxorubicin and cisplatin

聚乙二醇非格司亭一级预防对接受阿霉素和顺铂治疗的子宫内膜癌患者的影响

DOI：
10.1016/j.tjog.2022.02.013
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tojima Yuri;Taguchi Ayumi;Mori Mayuyo;Nara Katsuhiko;Miyamoto Yuichiro;Tanikawa Michihiro;Sone Kenbun;Tsuruga Tetsushi;Yamamoto Takehito;Oda Katsutoshi;Suzuki Hiroshi;Osuga Yutaka
通讯作者：
Osuga Yutaka

がんゲノム医療（プレシジョンメディシン）

癌症基因组医学（精准医学）