全基因组micro-RNA种子区结合序列SNP标志体系与乳腺癌发病风险的关联及相关功能研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
81172762
项目类别：
面上项目
资助金额：
68.0万
负责人：
陈可欣
依托单位：
天津医科大学
学科分类：
H3010.非传染病流行病学
结题年份：
2015
批准年份：
2011
项目状态：
已结题
起止时间：
2012-01-01 至2015-12-31

项目参与者：
郑红；张微；宋丰举；刘奔；宋方方；张丽娜；赵妍蕊；闫晔；
关键词：
易感性(susceptibility)polymorphism seed Micro-RNA种子区(Micro-RNA sequence)SNP）乳腺癌(breast 单核苷酸多态性（single region)nucleotide 靶序列(target cancer)

项目摘要

乳腺癌是危害女性健康的最常见恶性肿瘤之一，micro-RNA通过调控多种肿瘤相关基因参与乳腺癌发生发展。本课题组在国际上较早提出micro-RNA靶序列SNP的重要生物学意义及其在肿瘤病因中的潜在功能，并在国家自然基金资助下开展micro-RNA靶序列SNP与乳腺癌的关联研究，取得较大进展。鉴于micro-RNA靶序列SNP是一个重要的遗传标记体系，而现有靶序列SNP与肿瘤的关联研究规模较小，不足以代表此类SNP在肿瘤病因中的作用。本研究采用全基因组关联研究策略，选取符合一定频率标准的全部micro-RNA种子区结合序列SNP，通过大样本病例对照研究，检测这类SNP的基因型频率在乳腺癌患者和正常人群的分布差异，在全基因组水平建立micro-RNA种子区结合序列SNP与乳腺癌发病关联影响的标志体系，并通过功能研究解释其分子机制，希望对乳腺癌发病风险和乳腺癌患者预后的影响研究提供新的思路。

结项摘要

乳腺癌是危害女性健康的最常见恶性肿瘤，其病因以环境暴露为主，DNA序列变异和基因表达调控起制约作用。Micro-RNA通过调控多种肿瘤相关基因参与乳腺癌发生发展。Micro-RNA靶序列SNP是一个重要的遗传标记体系，而现有靶序列SNP与肿瘤的关联研究规模较小，不足以代表此类SNP在肿瘤病因中的作用。本研究采用全基因组关联研究策略，共计纳入2744例病例和3125例对照，运用病例对照研究方法对全基因组192个micro-RNA种子区结合序列SNP基因分型，比较病例和对照的SNP基因型分布频率的差异。本研究包括关联研究和验证研究两个阶段，在在第一阶段我们选取1349例乳腺癌病例和1572例对照，用Illumina GoldenGate基因芯片法检测192个位点病例和对照的基因型，在第二个阶段我们另外选取1395例乳腺癌病例和1553例乳腺癌对照，采用TaqMan探针技术对于关联研究中获得的乳腺癌发病相关的15个micro-RNA种子区结合序列SNP和预后相关的8个micro-RNA种子区结合序列SNP进行验证。结果显示，HPGD基因（rs8752）与乳腺癌的发病风险相关，其中A基因型能够增加患乳腺癌的风险，特别是在ER+的人群中。GREM1基因（rs10318）与乳腺癌的预后相关，T基因型患者的乳腺癌特异性生存时间和无病生存时间较短。GREM1基因（rs10318）还与乳腺癌患者ER状态有关，T基因型患者ER阴性比例高。综上，本项目通过流行病学病例对照研究找到与乳腺癌发病和预后相关的microRNA靶序列SNP位点，确定了乳腺癌发病和预后的新的分子标志物，为乳腺癌病因提供了科学线索。