Principles of chromatin operations ensuring the repair of genomic DNA damage caused by environmental stresses

确保修复环境压力引起的基因组 DNA 损伤的染色质操作原理

基本信息

批准号：
21H03598
负责人：
菅澤薫
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

１．損傷部位にリクルートされるヒストン修飾酵素の解析：　ヒストン脱アセチル化酵素HDAC1/2及びその活性化因子であるMTA（metastasis-associatd）ファミリータンパク質がDNA損傷部位にリクルートされるメカニズムを解明するため、これらの因子をサブユニットとして含む転写コリプレッサー複合体に着目した解析を行った。その結果、特にクロマチンリモデリング活性を持つATPaseサブユニットの発現抑制によってXPC及びMTAの損傷部位へのリクルートが減弱するだけでなく、当該サブユニット自身が損傷部位にリクルートされることを見出した。２．クロマチンとの相互作用を介したXPCの局在・動態制御機構の解析：　LacO-LacRシステムを用いて、HDACのテザリングによりXPCがLacOアレイにリクルートされることを前年度までに示したが、この時XPCはLacOアレイを含むクロマチン領域で結合と解離を繰り返しており、その結合親和性はDNA損傷部位と比較しても決して低くないことがわかった。さらに、ヒストンメチル化酵素EHMT1が、HDACと同様にXPCをLacOアレイにリクルートできることを示すとともに、EHMT1の発現抑制によるXPCの損傷部位へのリクルートの減弱が、XPCタンパク質中央部の天然変性領域に依存することが示された。３．XPCのゲノムワイドな局在制御と損傷修復効率の相関：　前年度に引き続き、XPC及びヒストン修飾を標的とするクロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-seq）解析のためのサンプル調製及びデータ取得を行った。

1.招募到受损位点的组蛋白修饰酶的分析：为了阐明组蛋白脱乙酰酶 HDAC1/2 及其激活剂 MTA（转移相关）家族蛋白招募到 DNA 受损位点的机制，我们对这些酶进行了分析。重点关注转录辅阻遏物复合体，其中包含以下因子作为亚基。结果，我们发现抑制具有染色质重塑活性的 ATPase 亚基的表达不仅会减弱 XPC 和 MTA 向受损位点的募集，而且亚基本身也会被募集到受损位点。 2.通过与染色质相互作用分析XPC的定位和动力学控制机制：利用LacO-LacR系统，我们在前一年证明XPC通过HDAC束缚被招募到LacO阵列中，发现XPC在染色质中反复结合和解离。含有LacO阵列的区域，其结合亲和力不低于DNA损伤位点。此外，我们发现组蛋白甲基转移酶 EHMT1 与 HDAC 一样，可以将 XPC 招募到 LacO 阵列，并且抑制 EHMT1 表达会减弱 XPC 向受损位点的招募，这取决于 XPC 中心区域的自然变性区域结果表明。 3. XPC全基因组定位控制与损伤修复效率之间的相关性：继去年之后，我们针对XPC和组蛋白修饰进行了染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）分析的样品制备和数据采集。

项目成果

期刊论文数量（19）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ヒストン修飾を介したヌクレオチド除去修復の損傷認識促進機構

组蛋白修饰介导的核苷酸切除修复损伤识别促进机制

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
日下部将之;前田拓海;各務恵理菜;綿田瑞希;菅澤薫
通讯作者：
菅澤薫

ヌクレオチド除去修復におけるDNA損傷認識を制御するクロマチン構造変換因子複合体

染色质结构转换因子复合物在核苷酸切除修复过程中控制 DNA 损伤识别

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
槌田千輝;日下部将之;各務恵理菜;栗原文佳;草尾佳那子;前田拓海;横井雅幸;酒井恒;菅澤薫
通讯作者：
菅澤薫

神戸大学バイオシグナル総合研究センター・菅澤研究室ホームページ

神户大学生物信号研究中心/菅泽实验室主页

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

ヌクレオチド除去修復の損傷認識を補助するクロマチン構造変換機構の解明

阐明支持核苷酸切除修复中损伤识别的染色质结构转换机制

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
前田拓海;日下部将之;菅澤　薫
通讯作者：
菅澤　薫

ヌクレオチド除去修復における紫外線誘発DNA損傷の効率的な認識に寄与するヒストン修飾

组蛋白修饰有助于有效识别核苷酸切除修复中紫外线诱导的 DNA 损伤

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
日下部将之;前田拓海;各務恵理菜;綿田瑞希;酒井恒;横井雅幸;菅澤薫
通讯作者：
菅澤薫

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通讯作者：
安田武嗣