肺癌オルガノイドライブラリーを用いた肺癌シグナル経路異常の解明
使用肺癌类器官库阐明肺癌信号通路的异常
基本信息
- 批准号:21H02765
- 负责人:
- 金额:$ 10.07万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究の目的は、肺癌細胞における癌細胞特異的なシグナル依存性を明らかにするとともに、その分子メカニズムを明らかにすることである。そのために我々は肺癌患者由来のオルガノイドを用いた実験系の確立を行った。具体的には、患者由来肺癌オルガノイドの効率的培養条件の検討を行った。また、肺癌細胞の特徴を知る上で非癌肺細胞のコントロールが必要であると考え、患者由来の肺胞細胞あるいは気道上皮細胞からのオルガノイド樹立も行った。ここでも培養条件の検討を繰り返し行った。その結果、非癌肺細胞および肺癌細胞由来のオルガノイドの培養条件の効率化をすすめることができた。これら改善した培養条件により、様々な特徴をもつ肺癌オルガノイド樹立に成功した。樹立した肺癌オルガノイドに対しては、それぞれのオルガノイドが有する分子異常(遺伝子変異、遺伝子発現異常)を明らかにするため各種網羅的分子プロファイリングを行った。具体的には、全エクソーム解析やRNAシークエンスなどを行った。さらに、肺癌細胞の分子異常とシグナル依存性の関係を明らかにするため、ニッチ依存性解析(オルガノイド培養のなかでの増殖因子(ニッチ因子)を添加あるいは除去したうえでオルガノイドの増殖能を評価する実験系)やCRISPR/Cas9ノックアウトライブラリーを用いた研究を進めている。その中で、ある分子異常を有する特定のサブグループのラインで、肺癌細胞特異的なシグナル依存性を明らかにした。
本研究的目的是阐明肺癌细胞中癌细胞特异性信号依赖性并阐明其分子机制。为此,我们利用来自肺癌患者的类器官建立了一个实验系统。具体来说,我们研究了源自患者的肺癌类器官的有效培养条件。我们还从患者来源的肺泡细胞或气道上皮细胞中建立了类器官,认为有必要控制非癌性肺细胞以了解肺癌细胞的特征。在这里,我们反复检查培养条件。因此,我们能够提高源自非癌性肺细胞和肺癌细胞的类器官的培养条件的效率。利用这些改进的培养条件,我们成功地建立了具有各种特征的肺癌类器官。对已建立的肺癌类器官进行各种类型的综合分子分析,以阐明每种类器官所具有的分子异常(基因突变、基因表达异常)。具体来说,我们进行了全外显子组分析和 RNA 测序。此外,为了阐明肺癌细胞的分子异常与信号依赖性之间的关系,我们进行了利基依赖性分析(在类器官培养物中添加或去除生长因子(利基因子)后评价类器官的生长能力)。使用实验系统进行研究)和 CRISPR/Cas9 敲除文库。其中,我们阐明了具有某种分子异常的特定亚组系中的肺癌细胞特异性信号依赖性。
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genotype-phenotype mapping of a patient-derived lung cancer organoid biobank identifies NKX2-1-defined Wnt dependency in lung adenocarcinoma
- DOI:10.1016/j.celrep.2023.112212
- 发表时间:2023-03-06
- 期刊:
- 影响因子:8.8
- 作者:Ebisudani, Toshiki;Hamamoto, Junko;Sato, Toshiro
- 通讯作者:Sato, Toshiro
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