NbRFP1调控燕麦矮缩病毒 RepA诱导HR的分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871929
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1401.植物病理学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Ubiquitination and proteasomal degradation plays important roles in plant defense, including the hypersensitive response (HR). ODV RepA protein has been identified to trigger a HR-typed cell death. A previous yeast two-hybrid (Y2H) screen of a tobacco cDNA library using RepA as the bait revealed that a RING FINGER-like protein named as NbRFP1 interacts with RepA. Here, the interaction between them will be further confirmed by the bimolecular fluorescence complementation (BiFC) and co-immunoprecipitation assays (Co-IP) in N. benthamiana cells. Further, the truncated mutants of NbRFP1 gene will be constructs to determine the domains involved in interactions with RepA and RepA-induced HR. Additional, the effects of RepA on the expression and subcellular localization of NbRFP1 will be identified. On the other hand, in vitro ubiquitination assays will be carried out to reveal that NbRFP1 is a functional E3 ubiquitin ligase. In addition, stabilization of NbRFP1 following inoculation with 35S-RepA will be determined in cell-free degradation, whereas the levels of ubiquitinated NbRFP1 be assessed. The effects of loss of NbRFP1 gene function or overexpression of NbRFP1 on RepA-induced HR will be investigated in these transgenic N. benthamiana plants. To determine the ubiquitinated substrate of NbRFP1, the partners that interact with NbRFP1 will be screened, following the analysis of gene functions involving in RepA-induced HR. The research works mentioned above will expanding our understanding of the molecular basis of E3 ubiquitin ligase involved in ODV RepA-induced HR and plant defense.
前期研究发现ODV RepA是一个HR反应的效应子,并且和潜在的E3泛素连接酶NbRFP1在体外互作。在此基础上,本项目拟利用Y2H、BiFC及Co-IP等进一步验证NbRFP1和RepA的互作并鉴定其互作结构域;利用qRT-PCR、western blot、激光共聚焦观察等分析RepA表达对NbRFP1蛋白水平和亚细胞定位等的影响;通过体外泛素化反应确认NbRFP1的E3泛素连接酶活性,并解析NbRFP1和RepA交互作用中RepA是否能抑制NbRFP1的自身泛素化进而阻止其被植物体内26S-蛋白酶体降解,从而提高NbRFP1的蛋白稳定性;构建NbRFP1过表达或抑制的转基因植株等,明确NbRFP1的表达变化是否影响ODV RepA诱导HR;筛选NbRFP1调控的下游互作分子并解析其对ODV RepA诱导HR的影响。项目的实施对于揭示ODV RepA诱导HR的分子机制有重要意义。

结项摘要

前期研究发现ODV RepA是一个激发HR反应的效应子,并且和潜在的E3泛素连接酶NbRFP1在体外互作。在此基础上,本项目利用Y2H、BiFC及Co-IP等进一步证实NbRFP1和RepA互作,并明确NbRFP1的RING结构域对于NbRFP1与RepA互作是必须的;利用western blot、激光共聚焦观察等明确RepA和NbRFP1共表达对于二者的蛋白表达水平及其亚细胞定位没有显著影响,进一步通过沉默植物内源的RPN14发现26S蛋白酶体降解系统并未参与NbRFP1蛋白的降解过程,而体内降解实验也证实NbRFP1蛋白在植物体内具有较好的稳定性;为了探讨NbRFP1和RepA互作的生物学意义,利用基因沉默和植物遗传转化抑制或者过表达NbRFP1,证实NbRFP1对RepA诱导HR有调控作用,而通过构建NbRFP1的缺失突变体确认其RING结构域是参与调控RepA诱导HR的关键元件;通过基因表达谱测序并结合免疫沉淀NbRFP1蛋白进行质谱检测,筛选NbRFP1调控的下游蛋白,揭示NbRFP1-RPM1-NbHSP90模块可能参与调控RepA诱导HR,而过氧化氢酶等也可能是NbRFP1作用的靶标蛋白。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development of Dot-ELISA and Colloidal Gold Immunochromatographic Strip for Rapid and Super-Sensitive Detection of Plum Pox Virus in Apricot Trees.
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  • DOI:
    10.3390/v15010169
  • 发表时间:
    2023-01-05
  • 期刊:
    Viruses
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Guo M;Qi D;Dong J;Dong S;Yang X;Qian Y;Zhou X;Wu J
  • 通讯作者:
    Wu J
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  • DOI:
    10.3390/ijms24010412
  • 发表时间:
    2022-12-27
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2020-09
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Suwei Sun;Ya Hu;Guangzhuang Jiang;Yimin Tian;Ming Ding;Cui Yu;Xueping Zhou;Yajuan Qian
  • 通讯作者:
    Yajuan Qian

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
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          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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