基因通读产生的 circRNA H6S5（HIF1α-SNAPC1）与嵌合蛋白 pH6S5: 生物学功能及其在前列腺癌中的作用

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81872108
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    58.0万
  • 负责人：
    周桥
  • 依托单位：
    四川大学
  • 学科分类：
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份：
    2022
  • 批准年份：
    2018
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

We found several protein-encoding chimeric circular RNAs derived from transcriptional read-through of HIF1α and SNAPC1 genes on chomosome 14. We explored the structure and function of circRNA H6S5, one of these read-through transcripts derived by this novel mechanism, which consisted of exons 6-8 of the transcription factor HIF1α and exons 2-4 of the transcription co-activator SNAPC1. The chimeric protein pH6S5 encoded by this read-through circRNA consisted of the HIF1α PAS B domain and the SNAPc domain of SNAPC1. This project intends to investigate the functions of the chimeric circRNA H6S5 and the pH6S5 protein. Potential functions of circRNA H6S5 include transciptional activation of HIF1α and SNAPC1 by recruiting transactivators, and suppression of inhibitory microRNAs targeting HIF1α and SNAPC1 mRNA. The chimeric protein pH6S5 may promote HIF1α/ARNT heterodimerization, and facilitate SNAPC complex formation, resulting in enhanced expression of down-stream target genes regulated by HIF1α/ARNT. We will also analyze the roles of the overexpressed circRNA H6S5 and pH6S5 in prostate adenocarcinoma...Key words: gene read-through; chimeric circular RNA; chimeric protein; HIF1α; prostate adenocarcinoma
我们发现由14号染色体上HIF1α和SNAPC1两相邻基因转录通读形成的数种嵌合circRNA及其编码的嵌合蛋白。这一新机制产生的嵌合circRNA H6S5含有转录因子HIF1α的6-8号外显子和转录共激活因子SNAPC1的2-5号外显子序列，编码嵌合蛋白质pH6S5（含HIF1α PAS B和SNAPC1 SNAPc结构域）。本课题拟深入研究嵌合circRNA H6S5和嵌合蛋白pH6S5的功能。circRNA H6S5可能结合/募集转录激活蛋白，或作为ceRNA解除microRNA对HIF1α和SNAPC1基因的抑制，促进HIF1α和SNAPC1表达。预测嵌合蛋白pH6S5具有促进HIF1α/ARNT二聚体形成和促进SNAPC复合物形成的双重作用，增强HIF1α/ARNT调控的下游靶基因表达。课题亦将分析嵌合circRNA H6S5和嵌合蛋白pH6S5高表达在前列腺癌中的作用。

结项摘要

本研究发现由14号染色体上HIF1α和SNAPC1两相邻基因转录通读形成的数种嵌合circRNA及其编码的嵌合蛋白。课题主要研究这一新机制产生的嵌合circRNA H6S5，该嵌合RNA在前列腺癌中表达增加；含有转录因子HIF1α的6-8号外显子和转录共激活因子SNAPC1的2-5号外显子序列，具开放阅读框，可编码嵌合蛋白质pH6S5（含HIF1α PAS B和SNAPC1 SNAPc结构域）。课题探索了嵌合circRNA H6S5和嵌合蛋白pH6S5的功能；实验显示circRNA H6S5可作为分子海绵/内源竞争性RNA（ceRNA）解除miR-4743-3p等microRNAs 对HIF1α和SNAPC1基因的转录后负调控作用，增加HIF1α和SNAPC1基因表达水平；circRNA H6S5 /pH6S5可促进HIF1α/ARNT二聚体形成，结合/募集转录激活蛋白至靶基因（包括ZEB1）启动子区，增强HIF1α/ARNT调控的下游靶基因表达。嵌合circRNA H6S5的表达增加前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力。上述研究结果显示前列腺癌中基因转录通读形成的嵌合circRNA作为ceRNA，其编码蛋白质作为癌基因转录调控分子，增强前列腺癌细胞增殖和侵袭能力的新机制，具有潜在临床应用价值。

项目成果

期刊论文数量（17）
专著数量（2）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（3）
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富马酸水合酶缺陷型肾细胞癌的综合分子表征
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  • 发表时间：
    2021-03-15
  • 期刊：
    CLINICAL CANCER RESEARCH
  • 影响因子：
    11.5
  • 作者：
    Sun, Guangxi;Zhang, Xingming;Zeng, Hao
  • 通讯作者：
    Zeng, Hao
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  • DOI：
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  • 发表时间：
    2019
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  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Hanbing Xie;Ling Nie;Mengni Zhang;Zhengzheng Su;Xueqin Chen;Miao Xu;Jing Gong;Ni Chen;Qiao Zhou
  • 通讯作者：
    Qiao Zhou
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  • DOI：
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  • 发表时间：
    2022-06-01
  • 期刊：
    AMERICAN JOURNAL OF SURGICAL PATHOLOGY
  • 影响因子：
    5.6
  • 作者：
    Zheng, Linmao;Gong, Jing;Yu, Tianping;Zou, Yan;Zhang, Mengni;Nie, Ling;Chen, Xueqin;Yue, Qiang;Liu, Yanhui;Mao, Qing;Zhou, Qiao;Chen, Ni
  • 通讯作者：
    Chen, Ni
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    周桥
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  • DOI：
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  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
    中华病理学杂志
  • 影响因子：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    陈铌

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  • 通讯作者：
    周桥

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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