一种新型琼胶酶AgaB的晶体结构与催化机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    20872170
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    周佳海
  • 依托单位：
    中国科学院上海有机化学研究所
  • 学科分类：
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

AgaB来源于假别单胞菌CY24，是一个结构与功能全新的琼胶酶。它的酶学性质特异，降解琼脂糖的主要终产物是新八琼糖和新十琼糖，其催化腔至少能容纳十二个糖单元，是目前所发现的催化腔最大的一种琼胶酶。另外，一维氢谱NMR分析表明：该酶通过异头碳构型翻转机理来催化水解糖苷键，与其他琼胶酶经异头碳构型保持的催化机理迥异。本项目拟以AgaB为研究对象，通过对其发酵条件、宿主菌等因素的优化，建立一个简洁、高效和廉价的产业化生产琼胶酶的工程菌株。在此基础上，本项目将测定AgaB的晶体结构以及其与产物的复合物晶体结构，并结合定点突变、酶学测定等手段阐释这一新颖琼胶酶的催化机制，为深入了解和合理开发利用此类琼胶酶奠定结构基础。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Expression, crystallization and preliminary X-ray analysis of an anomeric inverting agarase from Pseudoalteromonas sp CY24
假交替单胞菌 CY24 异头反向琼胶酶的表达、结晶和初步 X 射线分析
  • DOI：
    10.1107/s174430911004114x
  • 发表时间：
    2010-12-01
  • 期刊：
    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS
  • 影响因子：
    0.9
  • 作者：
    Ren, Aiming;Xia, Zong-Xiang;Zhou, Jiahai
  • 通讯作者：
    Zhou, Jiahai

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其他文献

三种Bcl-2家族蛋白的表达、纯化及活性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2010
  • 期刊：
    生物医学工程学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李雯雯;周佳海;李勋;石志敏;朱翠侠;王任小
  • 通讯作者：
    王任小

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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