改变微生物分裂方式以提高其生长速度的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870859
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Most bacteria are grown via binary fission. To accelerate bacterial growth rates, this study aims to reprogram the bacterial growth pattern by regulating the expressions of fission ring (Z-ring) localization related min gene family, Z-ring formation related ftsZ gene family, increase number of origin of replication Ori for bacterial genome and splitting the genome into several smaller ones. It is expected that the microbial binary growth pattern be changed to multiple fission pattern so that the bacteria could be grown much faster than the binary fission ones. If a partial success is achieved, halophilic Halomonas bluephagenesis, a platform for the “Next generation industrial biotechnology”, will be reconstructed to grow in a multiple fission pattern similar to the so-constructed E. coli. Faster grown bacteria would be very important for increasing the competitiveness of biomanufacturing, especially for the bioplastic PHA.
大部分细菌都是采用二等分裂的方式进行生长的。为了提高细菌的生长速度,本项目拟对大肠杆菌进行分裂方式的重编程,包括对分裂环定位相关基因min系列、分裂环合成相关基因ftsz系列、增加基因组复制起始点Ori和基因组拆分相关基因等进行表达调控,以实现大肠杆菌从二等分裂变成多分裂,加速其生长速度。在大肠杆菌取得成果多基础上,将对工业意义更大的嗜盐微生物Halomonas bluephagenesis进行相似的CRISPR/Cas9基因组重编程,以实现H. bluephagenesis的多分裂快速生长,从而实现未来生物制造过程的加速,特别是生物塑料PHA的快速生物合成。

结项摘要

本项目立足于盐单胞菌Halomonas bluephagenesis TD01,研究使其能够更快分裂的方式,以达到提升其作为生产菌株时的细胞干重水平和胞内产物聚羟基脂肪酸酯(PHA)产量的目的。针对这一目的,本项目开展了多种尝试。主要包括拆分细菌的基因组、过表达RNA聚合酶、过表达细菌分裂相关基因和敲除细菌外膜这四种方式。其中过表达RNA聚合酶可以对细菌的分裂速度有一定的提升效果,而适时的过表达分裂相关基因minCD和敲除细菌外膜合成的基因lpxL和lpxM虽然不能直接提升细菌的分裂速度,但可以提高细菌生长的干重水平和生产的PHA的含量。在科学意义上,本项目扩展了拆分细菌基因组的技术在非模式生物盐单胞菌中的适用性,发掘了提升细胞分裂速度的新方法,为增加细菌染色体调控的认识和细菌分裂速度的研究起到了一定的促进作用。此外,也开拓了提升生产菌株生产能力的实际方法,对于其他菌株的改造有一定的参考价值。

项目成果

期刊论文数量(27)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Hyperproduction of 3- hydroxypropionate by Halomonas bluephagenesis
蓝色盐单胞菌过量产生 3-羟基丙酸
  • DOI:
    10.1038/s41467-021-21632-3
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Nature Communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Jiang Xiao-Ran;Yan Xu;Yu Lin-Ping;Liu Xin-Yi;Chen Guo-Qiang
  • 通讯作者:
    Chen Guo-Qiang
Engineered Halomonas spp. for production of L-Lysine and cadaverine
工程化盐单胞菌属 (Halomonas spp.)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Bioresource Technology
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Cuihuan Zhao;Taoran Zheng;Yinghao Feng;Xuan Wang;Lizhan Zhang;Qitiao Hu;Jinchun Chen;Fuqing Wu;Guo-Qiang Chen
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang Chen
Construction of a sustainable 3-hydroxybutyrate-producing probiotic Escherichia coli for treatment of colitis
构建可持续的产 3-羟基丁酸益生菌大肠杆菌用于治疗结肠炎
  • DOI:
    10.1038/s41423-021-00760-2
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Cellular & Molecular Immunology
  • 影响因子:
    24.1
  • 作者:
    Xu Yan;Xin-Yi Liu;Dian Zhang;Yu-Dian Zhang;Zi-Hua Li;Xu Liu;Fuqing Wu;Guo-Qiang Chen
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang Chen
Engineering biosynthesis of polyhydroxyalkanoates (PHA) for diversity and cost reduction
聚羟基脂肪酸酯(PHA)的工程生物合成以实现多样性和降低成本
  • DOI:
    10.1016/j.ymben.2019.07.004
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Yang Zheng;Jin-Chun Chen;Yi-Ming Ma;Guo-Qiang Chen
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang Chen
Engineering an oleic acid-induced system for Halomonas, E. coli and Pseudomonas
设计针对盐单胞菌、大肠杆菌和假单胞菌的油酸诱导系统
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Yueyuan Ma;Xiangrui Zheng;Yina Lin;Lizhan Zhang;Yiping Yuan;Huan Wang;James Winterburn;Fuqing Wu;Qiong Wu;Jian-Wen Ye;Guo-Qiang Chen
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang Chen

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相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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