改造基因组以提高微生物生长速度的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31270146
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    88.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0105.微生物学新技术与新方法
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Industrial fermentation processes require rapid growth of microorganisms to save fermentation cost and to reduce the possibility of contamination. This project aims to accelerate microbial growth via manipulating the microbial genome. A eucaryotic cell usually has a number of chromosomes which each contains multiple origins of replication, this significantly speed up the genomic DNA replication. In contrast, a prokaryotic cell normally has only one chromosome containing only one replication origin, it is expected that DNA replication can be accelerated if more DNA replication origins are introduced or if the genome is divided into two. Enhanced DNA replication should result in faster cell growth. E. coli will be used as a prokaryote to test this hypothesis. On one hand, multiple origins of replication will be inserted into the genome of E. coli, on the other hand, the genome will be divided into two smaller ones.Studies will be conducted regarding how these genome manipulations will affect cell growth. The understanding of cell growth on a genomic basis will significantly benefit the fermentation industries.
许多工业微生物发酵过程需要快速的微生物生长以节省发酵成本以及减少染菌的几率。因此,在分子水平上加快微生物生长速度一直是人们关心的重要问题。通常真核生物细胞有多条染色体DNA,并含有多个复制起始点,这大大加快了其基因组DNA的复制速度,而原核生物细胞只有一个染色体,仅含有一个复制起始点,如果增加DNA的复制起始点或者将基因组一分为二,是否能加速复制速度,从而提高原核微生物的生长速度?为此,本课题拟在原核生物中,以大肠杆菌为例,方案一为整合多个复制起始点至其基因组,以研究是否可以提高基因组DNA的复制速度,从而加快大肠杆菌生长速度;方案二为将基因组分为两个小基因组,以研究是否可以加快大肠杆菌的生长速度。本课题对了解原核生物基因组复制机制的研究也具有重要的理论意义,也将有益于微生物工业发酵产业。

结项摘要

本项目构建了一个可以快速生长的,并且能够进行多分裂(而不是二等分的)的大肠杆菌系统,在这个系统中转入生物塑料PHB的生产质粒PBHR68,探究其在PHA生产方面的作用。我们发现,无论是在LB培养基还是矿物培养基中,突变型大肠杆菌E. coli JM109∆minCD(pBHR68)的PHB含量都比野生型E. coli JM109(pBHR68)的高,多分裂的方式提高了突变型大肠杆菌生产PHB的能力。为了更清晰的研究分裂基因ftsZ,mreB和 ftsQLWN基因对于E. coli JM109∆minCD生产PHB的影响,我们分别进行了单独表达这六个基因的实验,结果发现这几个基因都可以促进突变型大肠杆菌生产PHB。在过表达ftsZ的E. coli JM109∆minCD菌株中,细菌的形态要明显长于对照组,较长的突变型大肠杆菌体内能够积累更多的PHB颗粒。过表达mreB,则由于扩大了整个生产菌株的体积,使得其装载PHB的能力也有所提高。分裂基因ftsQLWN加快了细菌分裂的速度和细菌的长度,减少了小细胞结构的产生,提高了代谢产物的产量。最后,突变型大肠杆菌E. coli JM109∆minCD在过表达ftsZ,mreB和 ftsQLWN六个基因的情况下,其积累PHB的能力得到显著提高,PHB的含量几乎是野生型的一倍。利用这个系统可以高效的生产PHB等生物产品,显著提高了大肠杆菌的生产能力,减低生产制造的成本

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Engineering the growth pattern and cell morphology for enhanced PHB production by Escherichia coli
设计生长模式和细胞形态以增强大肠杆菌的 PHB 产量
  • DOI:
    10.1007/s00253-016-7715-1
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Wu; Hong;Chen; Jinchun;Chen; Guo-Qiang
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang
Novel T7-like expression systems used for Halomonas
用于盐单胞菌的新型 T7 样表达系统
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Li; Teng;Wu; Qiong;Ouyang; Qi;Chen; Guo-Qiang
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang
Enhance General Circular DNA Construction Efficiency by CircumventingLong-Standing Contradictions among Ligation/Assembly and Transformation Steps
通过规避连接/组装和转化步骤之间长期存在的矛盾,提高通用环状 DNA 构建效率
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Microbial Cell Factories
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Fu Xiaozhi;Chen Jinchun;Wu Qiong;Chen Guo-Qiang
  • 通讯作者:
    Chen Guo-Qiang
CRISPRi engineering E-coli for morphology diversification
CRISPRi 改造大肠杆菌以实现形态多样化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Lv; Li;Jiang; Xiao-Ran;Wu; Hong;Chen; Guo-Qiang
  • 通讯作者:
    Guo-Qiang
Enhanced production of polyhydroxybutyrate by multiple dividing E. coli
通过多重分裂大肠杆菌提高聚羟基丁酸酯的产量
  • DOI:
    10.1186/s12934-016-0531-6
  • 发表时间:
    2016-07-27
  • 期刊:
    Microbial Cell Factories
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Wu H;Fan Z;Jiang X;Chen J;Chen GQ
  • 通讯作者:
    Chen GQ

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天然纤维织物转移印花研究进展
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    陈国强

其他文献

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陈国强的其他基金

下一代工业生物技术:理论与实践
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  • 批准年份:
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相似国自然基金

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  • 批准号:
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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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