鱼类特有基因Gig1和Gig2在干扰素抗病毒反应中的功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31272690
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    85.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1907.水产生物免疫学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Curcian carp Carassius autuas Gig1 and Gig2 (grass carp reovirus-induced gene 1 and 2) are recently identified as two novel genes that are significantly induced in viral-infected cells and found exclusively in fish genomes. Based on previous studies on gene expression, Gig1 and Gig2 seem to be two representatives of host interferon stimulated genes (ISGs), one being an early phase ISG and the other being a late phase ISG; however, the detailed mechanism underlying both gene expression by virus infection and the exact physiological roles of both genes responsible for interferon antiviral responses remain to be investigated. In this project, first, the 5' flanking sequences of both genes will be cloned to compare their induction pathways triggered by virus infection, thus clarifying how both genes are transcriptionally iniated during interferon antiviral responses. Second, the dynmics of subcellular localization of both gene-encoding proteins will be studied in order to reveal where both genes function in viral-infected fish cells, respectively. Considering that ISGs might act as antiviral effectors to shut down virus resplication or important factors to influence the production of IFN,finally, we will try to clarify whether both genes might directly inhibit virus propagation or participate in regulation of IFN expression or act both.If this poject is supported, the data will be made to clarify how, where and what Gig1 and Gig2 function, and importanly, to aid in understanding of fish own interferon-mediated antiviral mechanims triggered by fish-specific genes.
鲫Gig1和Gig2是两个最近鉴定的、在病毒感染的细胞中大量表达的新基因,目前仅在鱼类基因组中发现有同源基因存在。前期研究表明Gig1和Gig2可能代表干扰素诱导的早期基因和晚期基因。然而,其中的表达调控机制以及这两个基因的生理功能都不曾进行过深入研究。本项目首先将分离鉴定Gig1和Gig2基因的侧翼调控序列,比较研究病毒诱导Gig1和Gig2的表达调控,揭示Gig1和Gig2在病毒感染的细胞中如何被启动表达。进而研究Gig1和Gig2基因编码蛋白在病毒感染细胞中的动态定位规律,揭示它们在干扰素抗病毒反应中发挥功能的场所。最后从抗病毒作用和调控干扰素反应信号通路两个方面对Gig1和Gig2的可能功能进行探索研究。本项目的研究结果不仅将阐明Gig1和Gig2在干扰素抗病毒免疫反应中的功能角色以及作用机理,而且有助于理解鱼类具有自身特点的干扰素抗病毒反应机制。

结项摘要

鲫Gig1和Gig2是我们实验室在2004年从用紫外线灭活GCRV感染的鲫培养细胞中发现的受病毒诱导表达的新基因。本项目的研究结果显示:鱼类Gig1和Gig2基因不仅受病毒诱导表达,而且受poly(I:C)等干扰素诱导剂诱导表达。这两个基因被诱导表达的分子机制是:细胞先通过RLR介导的信号通路诱导宿主细胞产生干扰素,干扰素再通过Jak-Stat信号通路诱导Gig1和Gig2基因的表达。启动子分析支持Gig1和Gig2是通过RLR-IFN途径被诱导表达的结论。亚细胞定位分析揭示Gig1和Gig2是两个定位在细胞质中的蛋白,即使在病毒感染时也定位在细胞质中。过量表达Gig1和Gig2促进细胞存活、抑制GCRV和SVCV等病毒在细胞中的复制。这些结果表明鱼类Gig1和Gig2是两个由干扰素诱导表达的抗病毒蛋白,在细胞质中发挥抗病毒功能。进一步的分子机制研究揭示鱼类Gig1可能通过正调控RLR和TLR途径中的重要信号分子和某些抗病毒蛋白的表达发挥抗病毒作用。最后,研究发现Gig1和Gig2在鱼类具有多拷贝的同源基因,Gig1特异存在于硬骨鱼类基因组中,而Gig2广泛存在于低等脊椎动物包括从无颌动物(如七鳃鳗)到两栖类的物种基因组中,而在羊膜脊椎动物中丢失。Gig1和Gig2的同源基因组成了两个新的基因家族,命名为Gig1基因家族和Gig2基因家族。进化和表达特征分析揭示这基因家族的不同基因拷贝发生了功能歧化。本项目的研究结果有助于理解鱼类具有自身特点的干扰素抗病毒反应机制。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Expression regulation of zebrafish interferon regulatory factor 9 by promoter analysis
启动子分析对斑马鱼干扰素调节因子9的表达调控
  • DOI:
    10.1016/j.dci.2013.07.017
  • 发表时间:
    2013-12-01
  • 期刊:
    DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Shi, Jun;Zhang, Yi-Bing;Gui, Jian-Fang
  • 通讯作者:
    Gui, Jian-Fang
Gig1, a novel antiviral effector involved in fish interferon response
Gig1,一种参与鱼类干扰素反应的新型抗病毒效应物
  • DOI:
    10.1016/j.virol.2013.10.029
  • 发表时间:
    2014-01-05
  • 期刊:
    VIROLOGY
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Sun, Fan;Zhang, Yi-Bing;Gui, Jian-Fang
  • 通讯作者:
    Gui, Jian-Fang
Zebrafish IRF1 Regulates IFN Antiviral Response through Binding to IFN phi 1 and IFN phi 3 Promoters Downstream of MyD88 Signaling
斑马鱼 IRF1 通过与 MyD88 信号下游的 IFN phi 1 和 IFN phi 3 启动子结合来调节 IFN 抗病毒反应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    The Journal of Immunology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang Qi-Min;Li Zhi;Zhang Qi-Ya;Gui Jian-Fang
  • 通讯作者:
    Gui Jian-Fang
Lineage-Specific Expansion of IFIT Gene Family: An Insight into Coevolution with IFN Gene Family
IFIT 基因家族的谱系特异性扩展:与 IFN 基因家族共同进化的见解
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0066859
  • 发表时间:
    2013-06-20
  • 期刊:
    PLOS ONE
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Liu, Ying;Zhang, Yi-Bing;Gui, Jian-Fang
  • 通讯作者:
    Gui, Jian-Fang
Zebrafish IRF1, IRF3, and IRF7 Differentially Regulate IFN Phi 1 and IFN Phi 3 Expression through Assembly of Homo- or Heteroprotein Complexes
斑马鱼 IRF1、IRF3 和 IRF7 通过同源或异源蛋白复合物的组装差异调节 IFN Phi 1 和 IFN Phi 3 表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Immunology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zhang, Jun;Xiong, Ya-Wei;Wu, Min;Gui, Jian-Fang
  • 通讯作者:
    Gui, Jian-Fang

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其他文献

双链RNA病毒诱导的牙鲆胚胎细胞
  • DOI:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
鱼类干扰素反应及分子调控
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张义兵
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    桂建芳
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘 颖
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵哲;张奇亚,;石军;桂建芳;史燕;朱兴平;张义兵
  • 通讯作者:
    张义兵

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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