耐辐射球菌中DNA修复蛋白互作网络研究

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基本信息

  • 批准号：
    30830006
  • 项目类别：
    重点项目
  • 资助金额：
    180.0万
  • 负责人：
    华跃进
  • 依托单位：
    浙江大学
  • 学科分类：
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2012-12-31

项目摘要

耐辐射球菌是迄今地球上最抗辐射的生物之一，其高效、精确的DNA修复机制为世人瞩目。近年来，我们在该菌中鉴定了重要的DNA修复"开关"基因pprI等一系列重要的功能基因。本研究将用酵母双杂交筛选，免疫共沉淀、随机亲和层析等技术分离和研究该菌中DNA修复相关蛋白（PprI, RecA, SSB, RecQ, Nth等）之间的物理与生物学的相互作用，进而利用生物信息学、基因敲除技术、生物化学等方法研究其相关功能，建立DNA修复过程中的蛋白互作网络，为发现与研究未知蛋白的功能提供一条可能的道路，为阐明耐辐射球菌的DNA修复机制奠定实验和理论基础。本研究对在分子水平上深入研究DNA修复机制具有重要的理论意义，同时在医学、生物、环境、农业和军事科学等的应用具广阔前景。

结项摘要

耐辐射球菌是能够忍受强烈电离辐射和强氧化剂等极端环境的微生物，其高效、精确的DNA修复机制为世人瞩目。本研究采用酵母双杂交筛选、随机亲和层析等技术手段筛选和研究了该菌中DNA修复相关蛋白（PprI, DdrB, SSB,RecA, RecF, SSB, RecJ, RecQ等）之间的物理与生物学的相互作用，进而利用生物信息学、基因突变技术、生物化学等方法研究了相关功能，建立了DNA修复过程中的以PprI等为关键核心的蛋白互作网络。以上研究结果为阐明耐辐射球菌的DNA修复机制和环境适应机制奠定了实验和理论基础，对在分子水平上深入研究DNA修复机制具有重要的理论意义。

项目成果

期刊论文数量（31）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
DNA binding is essential for PprI function in response to radiation damage in Deinococcus radiodurans
DNA 结合对于耐辐射奇球菌响应辐射损伤的 PprI 功能至关重要
  • DOI：
    10.1016/j.dnarep.2011.10.013
  • 发表时间：
    2012-02-01
  • 期刊：
    DNA REPAIR
  • 影响因子：
    3.8
  • 作者：
    Lu, Huiming;Chen, Huan;Hua, Yuejin
  • 通讯作者：
    Hua, Yuejin
Global effect of an RNA polymerase beta-subunit mutation on gene expression in the radiation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans
RNA聚合酶β亚基突变对耐辐射细菌耐辐射球菌基因表达的整体影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Science China Life Sciences
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Hua Xiaoting;Wang Hu;Wang Chao;Tian Bing;Hua Yuejin
  • 通讯作者：
    Hua Yuejin
Pleiotropic effects of RecQ in Deinococcus radiodurans
RecQ 对耐辐射奇球菌的多效性作用
  • DOI：
    10.1016/j.ygeno.2009.08.001
  • 发表时间：
    2009-11-01
  • 期刊：
    GENOMICS
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Chen, Huan;Huang, Lifen;Hua, Yuejin
  • 通讯作者：
    Hua, Yuejin
Both OB Folds of Single-Stranded DNA-Binding Protein Are Essential for Its ssDNA Binding Activity in Deinococcus radiodurans
单链 DNA 结合蛋白的两个 OB 折叠对其在耐辐射球菌中的 ssDNA 结合活性至关重要
  • DOI：
    10.2174/092986610792231438
  • 发表时间：
    2010-01-01
  • 期刊：
    PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS
  • 影响因子：
    1.6
  • 作者：
    Hua, Xiaoting;Wang, Chao;Hua, Yuejin
  • 通讯作者：
    Hua, Yuejin
Functional analysis of gamma-carotene ketolase involved in the carotenoid biosynthesis of Deinococcus radiodurans
耐辐射球菌类胡萝卜素生物合成中γ-胡萝卜素酮酶的功能分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Fems Microbiology Letters
  • 影响因子：
    2.1
  • 作者：
    Sun Zongtao;Shen Shaochuan;Tian Bing;Wang Hu;Xu Zhenjian;Wang Liangyan;Hua Yuejin
  • 通讯作者：
    Hua Yuejin

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其他文献

Cu~(2+)解除Cd~(2+)对耐辐射奇球菌的生长抑制作用
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  • 通讯作者：
    卢振兰
耐辐射奇球菌光敏色素基因缺失突变株的构建及其功能研究
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    田兵
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  • 发表时间：
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  • 作者：
    黎婷婷;王梁燕;王云光;华跃进
  • 通讯作者：
    华跃进
耐辐射球菌抗氧化系统中的一个新成员dr1127
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 通讯作者：
    华跃进
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    罗宇霞;陆慧智;王梁燕;华跃进
  • 通讯作者：
    华跃进

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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