采用染色质免疫沉淀策略鉴定肝病关联基因rSNP的功能

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30470964
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H03.消化系统
  • 结题年份:
    2007
  • 批准年份:
    2004
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2005-01-01 至2007-12-31

项目摘要

对于常见疾病的遗传易感性,目前的疾病关联研究很多,功能位点的鉴定较少;编码区SNP功能研究较多,调控区SNP功能研究相对薄弱。我们采用连锁不平衡-关联研究的策略已确定雌激素受体α(ESR1)和CXCL10基因多态性与慢性HBV感染及其疾病进程相关,疾病关联SNP位点位于基因转录调控区。染色质免疫沉淀技术(ChIP)是近几年来发展的一种高通量的DNA-蛋白相互作用研究技术,且能在维持染色质天然结构状态下研究基因启动子区的转录活性。本研究拟采用RNA多聚酶II-ChIP和多重引物延伸-飞行时间质谱技术,扫描ESR1/CXCL10及IL-6、IL-10、TNF-α等肝病关联基因调控区SNP位点的等位特异性磷酸化RNA多聚酶II结合量,以确定影响疾病的调节性SNP(regulatory SNP, rSNP)位点及其调控通路,并为生理状态下其他基因rSNP的高通量鉴定提供思路。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
PolⅡ-ChIP-VSET-MS方法的建立及
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    世界华人消化杂志, 2005,13(20): 2431-2436
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    晏泽辉, 邓国宏, 王宇明*
  • 通讯作者:
    晏泽辉, 邓国宏, 王宇明*
SNRPN基因在HepG2细胞中的印迹状
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    世界华人消化杂志, 2005,13(21):2545-2548
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
Regulatory Polymorphisms in th
调节多态性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
乙型肝炎的宿主遗传易感性的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    世界华人消化杂志, 2005,13(8):1002-1007
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:

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其他文献

SLC10A1基因变异与HBV母婴传播易感性的相关研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中华临床感染病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张艳琼;晏泽辉;石星新;吴全新;黄鸿菲;王宇明
  • 通讯作者:
    王宇明
人胚胎骨髓间充质干细胞在大鼠体
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    西南国防医药, 2005, 15(1): 4-6
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈焱;梁平;陈耀凯;王宇明;冉
  • 通讯作者:
重庆地区乙肝病毒基因型分布及其临床意义
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    第三军医大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王宇明;但芸婕;况雪梅;邓国宏;谭文婷
  • 通讯作者:
    谭文婷
乙型肝炎病毒基因型对拉米夫定抗病毒疗效的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华肝脏病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    况雪梅;邓国宏;但芸婕;王宇明;谭文婷
  • 通讯作者:
    谭文婷
人胎肝干细胞的体外分离培养与鉴
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    世界华人消化杂志 2005,13(4): 452-455
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    毛海洲, 陈耀凯;王宇明;张磊
  • 通讯作者:
    张磊

其他文献

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王宇明的其他基金

基于TLR-IFN效应通路基因多态性优化慢性乙型肝炎抗病毒治疗适应症
  • 批准号:
    81270563
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    70.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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  • 批准号:
    30972598
  • 批准年份:
    2009
  • 资助金额:
    30.0 万元
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    面上项目
核苷类似物干预下HBV准种全长序列变异模式及其选择特性研究
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    30830090
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    2008
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    180.0 万元
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    重点项目
基因组印迹在影响HBV感染后单卵孪生子表型中作用的研究
  • 批准号:
    30671851
  • 批准年份:
    2006
  • 资助金额:
    27.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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  • 批准号:
    30370787
  • 批准年份:
    2003
  • 资助金额:
    7.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
人胚胎干细胞/肝细胞移植在实验性肝衰竭治疗中的作用
  • 批准号:
    30070347
  • 批准年份:
    2000
  • 资助金额:
    15.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
HCV 结构区准种的优化筛选及其功能性蛋白的表达
  • 批准号:
    39870694
  • 批准年份:
    1998
  • 资助金额:
    10.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
长期人胎肝细胞培养系统用于人工肝支持的方法学研究
  • 批准号:
    39370189
  • 批准年份:
    1993
  • 资助金额:
    7.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
白细胞介素-2受体阳性细胞在重型肝炎发病机制中的作用
  • 批准号:
    38970698
  • 批准年份:
    1989
  • 资助金额:
    2.3 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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  • 批准号:
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  • 项目类别:
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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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