猪流行性腹泻病毒nsp7拮抗IFN-β产生及其信号转导的分子机制

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基本信息

  • 批准号:
    31672569
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1802.兽医病毒学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) is an important porcine enteropathogenic coronavirus which causes lethal watery diarrhea in piglets and results in high economic losses. Previous studies have demonstrated that PEDV infection inhibits interferon (IFN) production to promote its proliferation. In our preliminary experiments, we found that the nsp7, a nonstructural protein encoded by PEDV, inhibits RIG-I-mediated IFN-β production and IFN-β-induced expression of IFN-stimulated gene (ISGs), indicating that PEDV nsp7 can antagonize both IFN-β production pathway and IFN-β signaling transduction pathway. However, the mechanism(s) utilized by nsp7 to do so remain elusive. Based on these preliminary findings, here we plan to identify the targets of nsp7, by investigating interaction between the components of RIG-I signal pathway and nsp7, and by analyzing the role of nsp7 to the phosphorylation and nuclear translocation of molecules of JAK-STAT signal pathway and the assembly of STAT1/STAT2/IRF9 complex. Furthermore, we will identify the possible function domain(s) or key amino acid site(s) of nsp7 responsible for its IFN inhibitory property. By using the infectious clone and reverse-genetic system of PEDV, recombinant PEDV with mutants in the possible function domain(s) or key amino acid site(s) of nsp7 will be constructed to analyze the immune regulation function of nsp7 under virus infection condition.
猪流行性腹泻病毒(PEDV)是危害当前养猪业的重要肠道冠状病毒。PEDV感染后可通过抑制干扰素(IFN)产生促进自身增殖并致病。我们的前期研究发现,PEDV编码的非结构蛋白nsp7既能拮抗RIG-I介导的IFN-β产生,又能抑制IFN-β诱导的干扰素刺激基因(ISGs)的表达,提示nsp7可同时靶向IFN-β产生和信号转导这两个紧密联系的过程,但其作用机制尚不清楚。本项目拟进一步探讨nsp7与RIG-I信号通路中各种信号分子的相互作用,分析nsp7对JAK-STAT信号通路中信号分子的磷酸化、核转运以及STAT1/STAT2/IRF9复合物形成的影响,确定nsp7的作用靶点;同时,挖掘nsp7拮抗IFN-β产生及其信号转导的功能域或关键氨基酸位点,并借助感染性克隆与反向遗传操作系统从病毒水平进一步分析这些氨基酸位点在PEDV拮抗IFN-β中的作用,更深入地揭示nsp7的免疫抑制功能。

结项摘要

猪流行性腹泻(PED)是危害养猪业的重要疫病,主要引起新生仔猪的腹泻、脱水或死亡。干扰素(IFN)反应是宿主抗病毒感染的重要防御机制,但病毒往往进化出各种策略拮抗宿主IFN的抗病毒作用。nsp7是冠状病毒复制酶复合体的重要组成,在病毒复制和免疫调节中发挥重要作用。本项目针对PEDV nsp7调控IFN的分子机制进行了深入的研究。分析了多种猪源细胞系对PEDV的易感性,发现猪回肠上皮细胞IPI-2I对PEDV有一定的易感性;通过克隆,获得一株对PEDV高度易感的细胞克隆株IPI-FX。构建了PEDV变异毒株AJ1102的感染性克隆,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术建立了一种简便、快速构建PEDV重组病毒的新方法,相对于传统方法,该方法具有靶点选择宽泛、特异性强、操作简单、效率高和实验周期短等优点,可以在一周内获得重组病毒。对全球409株PEDV全基因组序列分析发现现有的PEDV可分为GI-a、GI-b、GII-a、GII-b、GII-c 5个亚群,GII-c亚群病毒是由病毒重组进化而来。利用双荧光素酶系统检测证实nsp7拮抗仙台病毒(SeV)诱导的IFN-β产生以及转录因子IRF3和NF-κB激活,进一步分析发现PEDV nsp7靶向RLR信号通路中的模式识别受体RIG-I拮抗IFN-β产生。对PEDV nsp7拮抗I型IFN信号转导的机制研究发现,PEDV nsp7与STAT1/STAT2存在相互作用,阻碍核转运蛋白KPNA1对STAT1的识别,从而抑制ISGF3复合物(STAT1/STAT2/IRF9)入核,导致I型IFN信号转导受阻。本项目还发现PEDV nsp7以二聚体的形式存在,其与nsp8存在相互作用,但其拮抗I型IFN信号转导与nsp8无关。另外,全面鉴定了PEDV的另外一种具有拮抗I型IFN的蛋白酶(3C-like蛋白酶)活性的关键氨基酸位点。上述研究结果不仅从分子水平上阐明了PEDV蛋白酶调控宿主抗病毒天然免疫的机制,而且为PEDV新型疫苗开发和药物设计奠定了基础。项目执行期内先后在FASEB Journal、Transboundary and Emerging Diseases、Veterinary Microbiology等杂志发表研究论文5篇,申报国家发明专利5项,培养博士研究生5名、硕士研究生2名。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
The nucleocapsid proteins of mouse hepatitis virus and severe acute respiratory syndrome coronavirus share the same IFN-β antagonizing mechanism: attenuation of PACT-mediated RIG-I/ MDA5 activation.
小鼠肝炎病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒的核衣壳蛋白具有相同的 IFN-β 拮抗机制:减弱 PACT 介导的 RIG-I/MDA5 激活
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.17912
  • 发表时间:
    2017-07-25
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ding Z;Fang L;Yuan S;Zhao L;Wang X;Long S;Wang M;Wang D;Foda MF;Xiao S
  • 通讯作者:
    Xiao S
Evolutionary and genotypic analyses of global porcine epidemic diarrhea virus strains
全球猪流行性腹泻病毒株的进化和基因型分析
  • DOI:
    10.1111/tbed.12991
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    TRANSBOUNDARY AND EMERGING DISEASES
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Guo,Jiahui;Fang,Liurong;Xiao,Shaobo
  • 通讯作者:
    Xiao,Shaobo
Identification of novel proteolytically inactive mutations in coronavirus 3C-like protease using a combined approach
使用组合方法鉴定冠状病毒 3C 样蛋白酶中的新型蛋白水解无活性突变
  • DOI:
    10.1096/fj.201901624rr
  • 发表时间:
    2019-12-01
  • 期刊:
    FASEB JOURNAL
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Zhou, Junwei;Fang, Liurong;Xiao, Shaobo
  • 通讯作者:
    Xiao, Shaobo
Susceptibility of porcine IPI-2I intestinal epithelial cells to infection with swine enteric coronaviruses
猪IPI-2I肠上皮细胞对猪肠道冠状病毒感染的敏感性
  • DOI:
    10.1016/j.vetmic.2019.04.014
  • 发表时间:
    2019-06-01
  • 期刊:
    VETERINARY MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Wang, Xunlei;Fang, Liurong;Xiao, Ishaobo
  • 通讯作者:
    Xiao, Ishaobo
Rapid manipulation of the porcine epidemic diarrhea virus genome by CRISPR/Cas9 technology
利用CRISPR/Cas9技术快速操作猪流行性腹泻病毒基因组
  • DOI:
    10.1016/j.jviromet.2019.113772
  • 发表时间:
    2020-02-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Peng, Qi;Fang, Liurong;Xiao, Shaobo
  • 通讯作者:
    Xiao, Shaobo

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其他文献

修饰的ORF5基因增强猪繁殖与呼吸
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    --
  • 作者:
    谢立兰;安康;陈力;孙紫德;方六荣
  • 通讯作者:
    方六荣

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方六荣的其他基金

猪δ冠状病毒激活钙离子通道SOCE的分子机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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