光滑分子动力学理论及其在多尺度分析中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    10672088
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    张雄
  • 依托单位：
    清华大学
  • 学科分类：
    A0813.计算固体力学
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

分子动力学方法是纳米力学计算模拟的重要手段，但其巨大的计算量限制了能够应用的空间和时间尺度。将分子动力学与连续介质力学相结合的多尺度计算方法是目前解决该问题的主要手段之一。本项目拟将物质点有限元法思想引入分子动力学中，引入背景网格，建立光滑分子动力学方法，将原子运动方程转化到背景网格节点上求解，从而达到增大临界时间步长、扩展能够分析的时间尺度的目的；拟将光滑分子动力学与分子动力学相耦合，将光滑分子动力学与物质点有限元法相耦合，建立不同尺度下的多尺度计算方法；拟以光滑分子动力学为纽带，建立从分子动力学到连续介质力学的贯通无缝连接多尺度方法。这些方法的研究，将大幅度扩展多尺度分析的空间尺度和时间尺度。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（2）
专利数量（0）
A membrane-spring model for carbon nanotubes with the van der Waals interaction between non-bonded atoms
具有非键合原子之间范德华相互作用的碳纳米管膜弹簧模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Smoothed Molecular Dynamics for Large Step Time Integration
用于大步长时间积分的平滑分子动力学
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
并行化光滑分子动力学方法及其与分子动力学的耦合
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    王汉奎，张雄，刘岩，并行化光滑分子动力学方法及其与分子动力学的耦合，计算物理. 25(6). 718-724，2008.（EI收录）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Adaptive smoothed molecular dynamics for multiscale modeling
用于多尺度建模的自适应平滑分子动力学
  • DOI：
    10.1016/j.commatsci.2009.02.023
  • 发表时间：
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  • 作者：
  • 通讯作者：

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其他文献

碱金属盐对萘系减水剂吸附-分散性能的影响
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    段文娟
miR-124-3p通过负调控Caveolin-1表达降低N2a/APPswe细胞内Tau蛋白磷酸化水平
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  • 发表时间：
    2015
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    李昱
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  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    张衍涛
BL Lac天体多波段高能辐射特性研究
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张雄;熊定荣;茶永娟;陈永云
  • 通讯作者：
    陈永云

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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