黄瓜miRNA的预测、鉴定及其在性别分化中的功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31070256
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    29.0万
  • 负责人：
    李广林
  • 依托单位：
    陕西师范大学
  • 学科分类：
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31
  • 项目参与者：
    陈浩； 刘君； 崔鸿文； 宋婕； 王振晔； 梁永宏；
  • 关键词：
    miRNA黄瓜性别分化

项目摘要

许多植物的miRNA与花发育的调控有关，并且在玉米中发现miRNA与玉米单性花的性别决定有关。而黄瓜作为研究植物性别分化的一种模式植物，目前国内外对于miRNA是否调控黄瓜性别分化的问题还没有答案。本项目我们首先使用黄瓜基因组数据，利用生物信息学手段从DNA序列和RNA结构上预测黄瓜中的候选miRNA，之后利用Northern和定量PCR等技术对这些候选的miRNA在转录水平进行验证和表达差异分析，从而在黄瓜中进行miRNA的系统性鉴定和性别分化相关miRNA的筛选；然后对我们新发现的miRNA进行靶标预测和验证，并整合GO和KEGG等功能基因组学数据分析其调控作用；再后利用比较基因组学，分析miRNA的进化与功能保守性，最终提出黄瓜miRNA在性别分化中的功能。该项目的科学意义在于：黄瓜miRNA的系统性识别和验证，为今后深入研究黄瓜miRNA在性别分化中的功能，打下了良好的基础。

结项摘要

许多植物miRNA 与花发育的调控有关，并且在玉米中发现 miRNA 与玉米单性花的性别决定有关。而黄瓜作为研究植物性别分化的一种模式植物，目前国内外对于 miRNA是否调控黄瓜性别分化的问题还没有答案。本项目我们首先使用黄瓜基因组数据，利用生物信息学手段从 DNA 序列和 RNA 结构上得到252条黄瓜miRNA；之后利用RNA-seq和定量PCR 等技术对这些候选miRNA 在转录水平进行验证和表达差异分析，并得到32条与黄瓜性别分化相关的 miRNA； 靶标分析结果表明，这些miRNA的靶标广泛参与黄瓜的花发育过程；黄瓜miRNA的进化分析结果表明，miRNA的进化主要受到净化选择作用。黄瓜性别分化相关miRNA的鉴定，为今后深入研究黄瓜 miRNA 在性别分化中的功能和进化打下了良好的基础。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
植物MicroRNA功能的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    西北植物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭韬;李广林;魏强;梁永宏
  • 通讯作者：
    梁永宏
植物miRNA的进化
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    魏强;梁永宏;李广林
  • 通讯作者：
    李广林

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  • 期刊：
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  • 通讯作者：
    李广林

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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