DNA计算中的核酸序列设计研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30670540
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    27.0万
  • 负责人：
    许进
  • 依托单位：
    北京大学
  • 学科分类：
    C1005.生物成像、电子与探针
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

无论用于基因工程或生物计算等的研究，编码设计不仅是首当其冲的问题，而且是最关键最核心的问题。然而，核酸序列编码问题是一个困难而复杂的问题，它受到诸如相似性问题、自由能问题、解链温度问题等因素的制约影响; 在DNA计算中, 还与解空间大小、解的检测等问题的解决密切相关。本项目拟主要研究DNA计算的编码理论、方法与算法。提出了将编码分为基本型和综合型两种。目前DNA计算中的编码主要是对基本型编码的研究。但如何将编码问题与解空间大小、解的检测等问题(即综合型编码)联系起来仍未展开，而这些问题正是DNA计算中最为核心和关键的问题。基于此，本项目拟重点研究下列问题：①:建立较为完整的编码理论体系；②:给出具体的编码方法，并给出具体的编码软件；③:将②中的结果应用于解决以一些困难的NP-完全问题为主的实际问题，如图的顶点着色问题、密码破译的DNA计算机模型。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（47）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（3）
专利数量（0）
A DNA computer model for solving vertex coloring problem
解决顶点着色问题的DNA计算机模型
  • DOI：
    10.1007/s11434-006-2145-6
  • 发表时间：
    2006-10
  • 期刊：
    科学通报(英文版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Zhou Kang;Qiang Xiaoli;Fang Gang;Xu Jin
  • 通讯作者：
    Xu Jin
一种图顶点着色DNA计算机模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    科学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    许进;方刚;周康;强小利
  • 通讯作者：
    强小利
求解TSP算法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机工程与应用
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周康;同小军;强小利;许进
  • 通讯作者：
    许进
基于闭环DNA的边着色问题DNA算法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    华中科技大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    许进;王延峰;周康;刘文斌
  • 通讯作者：
    刘文斌
边连通度问题的三维DNA图结构解法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    系统工程与电子技术
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张社民;方刚;许进
  • 通讯作者：
    许进

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其他文献

极大平面图的结构与着色理论(3)纯树着色与唯一4-色极大平面图猜想
  • DOI：
    10.11999/jeit160409
  • 发表时间：
    2016-05
  • 期刊：
    电子与信息学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    许进
  • 通讯作者：
    许进
On purely tree-colorable planar graphs
在纯树可着色平面图上
  • DOI：
    10.1016/j.ipl.2016.03.011
  • 发表时间：
    2016-08
  • 期刊：
    Information Processing Letters
  • 影响因子：
    0.5
  • 作者：
    许进;李泽鹏;朱恩强
  • 通讯作者：
    朱恩强
极大平面图的结构与着色理论 (2)多米诺构形与扩缩运算
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    电子与信息学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    许进
  • 通讯作者：
    许进
STAT3反义寡聚核苷酸对人脑胶质瘤细胞系U251细胞侵袭和凋亡的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中华神经医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    万政强;陈晨;许进;郭俊
  • 通讯作者：
    郭俊
MiR-137对人脑胶质瘤细胞株U87细胞增殖和凋亡影响的体外研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中华神经医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    万政强;伏林山;许进;孙关
  • 通讯作者：
    孙关

其他文献

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许进的其他基金

探针计算机模型及实现研究
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  • 项目类别：
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    面上项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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