用纳米金探针检测卵巢癌线粒体DNA突变的研究

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基本信息

  • 批准号:
    30900350
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2808.纳米医学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31
  • 项目参与者:
    孙亚楠; 陈丽玉; 吕文清; 魏凯; 张秀明; 张召武; 王霜; 赖友群; 马燕燕;
  • 关键词:

项目摘要

卵巢癌是女性生殖器中最常见的恶性肿瘤之一,死亡率居妇科恶性肿瘤的第一位,缺乏有效的早期检测手段。线粒体DNA的高突变率以及在癌细胞中的高拷贝数使其成为肿瘤非侵入性诊断的有效分子标记。本项目的目标是建立一种检测卵巢癌线粒体DNA突变的新方法,简化DNA突变的检测过程,使检测灵敏度和准确性大大提高。项目以几种不同来源的标本(卵巢癌组织、血液、腹腔液、卵巢癌细胞系)为研究对象,在卵巢癌突变热点集中的16S、12SrRNA基因、Cytb基因和D-loop区域针对不同类型的线粒体DNA突变设计寡核苷酸探针,用纳米金-寡核苷酸探针可以同时检测线粒体DNA多个突变。并探索纳米金粒径大小、核酸探针序列、密度和长度、反应温度、反应体系盐浓度和pH值、靶DNA等因素对纳米金探针检测线粒体DNA突变效率的影响,为卵巢癌的早期诊断、治疗以及预后的判断提供一个简单、快速的新工具,具有良好的临床应用前景。

结项摘要

本研究用纳米金比色法和石墨烯-DNA水凝胶电极巧妙地检测了卵巢癌线粒体DNA突变,简化了DNA突变的检测过程。项目在卵巢癌突变热点集中的16S、12SrRNA基因、Cytb基因和D-loop区域针对不同类型的线粒体DNA突变设计寡核苷酸探针。我们还意外发现还原石墨烯能够大大增强聚合酶链式反应(PCR)的特异性,经过多轮PCR扩增(最高达到8轮)后仍然可以得到目的产物;还原石墨烯降低了PCR的退火温度,使PCR反应低至25 ˚C时依然能够退火,得到单一的目的产物;对PCR扩增产物进行序列测定,结果显示石墨烯参与的PCR反应产物序列与标准序列没有差异。Zeta电位、紫外-可见光谱及圆二色光谱分析表明石墨烯与DNA聚合酶、DNA模板间的相互作用,以及石墨烯良好的导热性是PCR反应特异性增强的主要原因。用纳米金-寡核苷酸探针可以分辨线粒体DNA的单碱基突变,灵敏度为3.3 nM。该方法虽然简便易行,但灵敏度还不够高。因此我们又用氧化石墨烯-DNA水凝胶构建了一种新型电化学生物传感器,探索了温度、反应体系盐浓度和pH值等因素对传感器的影响。用扫描电镜、原子力显微镜、X射线衍射等方法对氧化石墨烯-DNA水凝胶进行了表征。用探针DNA修饰该电极后,采用电化学阻抗谱(EIS)成功地检测了卵巢癌线粒体DNA的单碱基突变,最低检测限达到1.0 × 10-20 M 。探针DNA与不同浓度(C)互补序列杂交前后的阻抗变化(ΔR)显示ΔR与-logC间具有良好的线性关系。探针序列与单碱基错配序列以及非互补序列杂交前后的阻抗变化值远低于其与互补序列杂交前后的阻抗变化值,证实该电极对DNA突变检测具有良好的选择性。本方法不需要对探针或待测样品进行任何化学或荧光标记,检测灵敏度和准确性大大提高,具有良好的临床应用前景。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A highly selective electrochemical biosensor for Hg2+ using hemin as a redox indicator
使用氯化血红素作为氧化还原指示剂的 Hg2 高选择性电化学生物传感器
  • DOI:
    10.1016/j.electacta.2011.01.061
  • 发表时间:
    2011-03-30
  • 期刊:
    ELECTROCHIMICA ACTA
  • 影响因子:
    6.6
  • 作者:
    Lai, Youqun;Ma, Yanyan;Zhang, Qiqing
  • 通讯作者:
    Zhang, Qiqing
Graphene Enhances the Specificity of the Polymerase Chain Reaction
石墨烯增强聚合酶链式反应的特异性
  • DOI:
    10.1002/smll.201200139
  • 发表时间:
    2012-07-09
  • 期刊:
    SMALL
  • 影响因子:
    13.3
  • 作者:
    Jia, Jing;Sun, Liping;Weng, Jian
  • 通讯作者:
    Weng, Jian
Conjugating folic acid to gold nanoparticles through glutathione for targeting and detecting cancer cells
通过谷胱甘肽将叶酸与金纳米粒子结合,用于靶向和检测癌细胞
  • DOI:
    10.1016/j.bmc.2010.06.045
  • 发表时间:
    2010-08-01
  • 期刊:
    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Zhang, Zhaowu;Jia, Jing;Sun, Liping
  • 通讯作者:
    Sun, Liping
Interaction of gold nanoparticles with Pfu DNA polymerase and effect on polymerase chain reaction
金纳米颗粒与 Pfu DNA 聚合酶的相互作用及其对聚合酶链式反应的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
    Iet Nanobiotechnology
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Sun, L. -P.;Wang, S.;Zhang, Z. -W.;Ma, Y. -Y.;Lai, Y. -Q.;Weng, J.;Zhang, Q. -Q.
  • 通讯作者:
    Zhang, Q. -Q.

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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