lincRNA通过影响神经元相关基因的染色质结构调控胶质细胞向神经元的转分化

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91319309
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    300.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1204.组织器官发育及体外构建
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

During injury of the central nervous system (CNS), glial scar formation occurs in accompany with neuronal cell death and functional deterioration. Glial scars, on one hand serve to limit the spreading of inflammatory cells after injury, and on the other hand form a physical barrier to prevent regeneration of nerve fibers and inhibit repair of the nervous system. We believe that being able to reduce glial scar formation and at the same time enhance neurogenesis will greatly facilitate repair and functional recovery of the injured CNS. In this application, we plan to use a transdifferentiation strategy, using a set of key factors to, in vitro and in vivo, direct convert reactive astrocytes into functional new neurons that can form new synaptic network. More importantly, we would like to reveal the epigenetic and transcriptome changes during this process, with a focus on delineating the participating lncRNAs. Using a newly invented RICH-PET technology, we aim to uncover the lncRNAs acting on neural lineage gene-associated chromatins. From this pool of lncRNAs, we will perform gain and loss of function experiments to define the candidate lncRNAs, which can facilitate the trans-differentiation process in vitro and in vivo. Our work will provide solid basis for future usage of the trans-differentiation strategy to treat neural trauma.
在脑和脊髓损伤区域,伴随着神经元的死亡和功能退化,星形胶质细胞会活化、增生形成胶质疤痕。如何保留胶质疤痕在损伤区域抗炎的良性作用,同时消除其后期对神经系统功能重建的不利影响,乃科学研究及临床上急需解决的难题。我们计划通过将损伤区星形胶质细胞在体内转分化为神经元来减弱疤痕形成,同时获得具有修复功能的神经元,从而在最大程度上重塑神经系统功能。首先,我们将结合大量前期工作,通过细胞培养在体外确定从星形胶质到神经元转分化途径的决定性调控因子。重点揭示在此转分化过程中发生的表观遗传及基因表达谱变化,并突出阐明参与此过程的lncRNA的变化与作用。然后通过全新的RICH-PET技术研究并发现调控神经元相关基因所在染色质的lincRNAs并进行功能获得及缺失实验来鉴定在体内及体外进一步提高转分化效率的具体lncRNAs, 此工作将为转分化策略最终应用于人类神经系统损伤的治疗提供理论依据和临床前实验。

结项摘要

在脑和脊髓损伤区域,伴随着神经元的死亡和功能退化,星形胶质细胞会活化、增生形成胶质疤痕。如何保留胶质疤痕在损伤区域抗炎的良性作用,同时消除其后期对神经系统功能重建的不利影响,乃科学研究及临床上急需解决的难题。我们发现了转录因子Ngn1和Tet1蛋白在星形胶质发生中的作用,确定了在星形胶质细胞向神经元转分化过程中起决定性作用的调控因子。采用最优转分化体系,我们对星形胶质细胞,转分化前期、中期的细胞进行了转录组分析和RICH-PET分析,找到了6条与神经元直接相关基因的染色质关联的候选lncRNAs,并通过功能获得及缺失实验在体内和体外鉴定了转分化效率高的lncRNAs。此外,我们采用钳夹法、挫伤法和全横断法构建了用于分析脊髓损伤瘢痕形成病理过程,评价转分化对脊髓损伤小鼠运动功能修复的作用的脊髓损伤的小鼠模型。我们的工作为转分化策略最终应用于人类神经系统损伤的治疗提供依据。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
NT3-chitosan elicits robust endogenous neurogenesis to enable functional recovery after spinal cord injury
NT3-壳聚糖引发强大的内源性神经发生,使脊髓损伤后功能恢复
  • DOI:
    10.1073/pnas.1510194112
  • 发表时间:
    2015-10-27
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Yang, Zhaoyang;Zhang, Aifeng;Li, Xiaoguang
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoguang
Coupled electrophysiological recording and single cell transcriptome analyses revealed molecular mechanisms underlying neuronal maturation.
耦合电生理记录和单细胞转录组分析揭示了神经元成熟的分子机制
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    Protein & cell
  • 影响因子:
    21.1
  • 作者:
    Chen X;Zhang K;Zhou L;Gao X;Wang J;Yao Y;He F;Luo Y;Yu Y;Li S;Cheng L;Sun YE
  • 通讯作者:
    Sun YE

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  • 作者:
    孙毅
  • 通讯作者:
    孙毅

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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