DNA甲基化和去甲基化在神经干细胞向星形胶质细胞分化过程中的作用机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31271371
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    100.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Neural stem/progenitor cells(NPCs) can differentiate into neurons and glia. The principle of NPC differentiation follows "neuron fist, glia second"role. Previous studies from our lab has revealed that a de nove DNA methyltransferase, Dnmt3a, is involved in epigenetic regulation of the sequential lineage differentiation of neurons and glia. It remains a challenge, however, to reveal detailed underlying molecular mechanisms by which DNA methylation and demethylation regulate astrogliogenesis in a coordinated manner. In this research project, we propose to study the function of Dnmt3a and Tet family members in regulating astroglial differentiation, via gain and lose function analyses, both in vitro and in vivo. In addition, using whole genome oppupancy analyses through chromatin immunoprecipitation coupled with next-generation seguencing (ChIP-seq) as well as MeDIP-seq and 5OHMeDIP-seq to reveal the genome-wide DNA methylation/demethylation network that ochestrates the gliogenesis process. Lastly, we will study a potential upstream regulator, olig2, for tet family proteins, which are tightly regulated during NPC differentiation along the astroglial lineage. This proposed study will reveal the coordination between the two opposing DNA methylation/demethylation epigenetic forces in regulating cell fate specification of NPCs along the astroglial lineage.
神经干细胞具有分化为神经元和神经胶质细胞的潜能,其分化遵循神经元分化在先,神经胶质分化在后的原则。本课题组前期研究发现DNA从头(de novo)甲基化酶Dnmt3a参与调控这一分化过程。为了深入研究DNA甲基化和去甲基化对星形胶质细胞分化的影响,本项目拟采运用功能获得和缺失实验,在Dnmt3a基因敲除小鼠和ShRNA-tet转染的神经干细胞模型中,探究甲基化酶Dnmt3a与去甲基化酶Tet在神经干细胞向星形胶质细胞分化过程中的功能及分子机制;采用全基因组Dnmt3a和Tet占位分析以及MedIP-seq,50H-MedIP-seq和组蛋白修饰的ChIP-chip技术,揭示其在星形胶质细胞分化关键基因上的作用方式。最后,我们将研究上游潜在调控元件Olig2在神经干细胞向星形胶质细胞分化中对Tet的作用。本项目的实施将揭示神经干细胞分化过程中DNA甲基化和去甲基化酶协同调控的表观遗传机制。

结项摘要

神经干细胞具有分化为神经元和神经胶质细胞的潜能,在神经发育过程中其分化遵循神经元分化在先,神经胶质分化在后的原则。本课题组前期研究发现DNA de novo甲基化酶 Dnmt3a参与调控这一分化过程。为了深入研究 DNA 甲基化和去甲基化对星形胶质细胞分化的影响,本项目运用功能获得和缺失实验,在Dnmt3a基因敲除小鼠和ShRNA-tet 转染的神经干细胞模型中,研究了甲基化酶Dnmt3a与去甲基化酶 Tet 在神经干细胞向星形胶质细胞分化过程中的功能及分子机制;采用全基因组Dnmt3a 和Tet占位分析以及MedIP-seq,50H-MedIP-seq和组蛋白修饰的ChIP-chip技术,发现Dnmt3a与组蛋白甲基转移酶G9a互作,可抑制NPC向星形胶质细胞分化;并发现Olig2直接靶向Tet基因的启动子区调控其表达,Tet 2可降低星形胶质发生相关基因TSS区的甲基化水平,促进NPC向星形胶质细胞分化。本项目的完成解析了Dnmt3a甲基化抑制NPC向星形胶质细胞分化和Tet去甲基化促进NPC向星形胶质细胞分化的分子机制;并构建出NPC向星形胶质细胞分化过程中的DNA甲基化和去甲基化的表观遗传调控网络。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Coupled electrophysiological recording and single cell transcriptome analyses revealed molecular mechanisms underlying neuronal maturation.
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    Protein & cell
  • 影响因子:
    21.1
  • 作者:
    Chen X;Zhang K;Zhou L;Gao X;Wang J;Yao Y;He F;Luo Y;Yu Y;Li S;Cheng L;Sun YE
  • 通讯作者:
    Sun YE

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  • 作者:
    孙毅
  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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