构建生物体内检测 GTP:GDP比值的基因编码的荧光探针

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21907001
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0701.生物体系分子探针
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

GTP and GDP are important nucleotides that are ubiquitous in cells, the intracellular GTP:GDP ratio is an important indicator of cellular metabolism and signal transduction state. However, currently there are no methods available for the real-time detection of GTP:GDP ratio in live cells. Applying the genetically encoded fluorescent sensor techniques, we picked out the first fluorescent sensor for the specific detection of GTP:GDP ratio. The sensor comprises of two modules: a protein which is able to bind both GTP and GDP, triggering divergent conformational changes, and cpYFP, a fluorescent protein that is sensitive to protein conformational changes. The results of previous in vitro experiments indicated that the sensor could respond to the GTP:GDP ratio. we expressed our sensor in 293T cells. After treatment with inhibitors of glycolysis, we observed a dramatic decrease in the intracellular GTP:GDP ratio. We will continue to examine the probe's response to the GTP:GDP ratio in other tumor cells and nerve cells, also further applied to the brains of fruit flies to develop a new method to detect GTP:GDP ratio in vivo.
GTP和GDP是广泛存在于细胞中的重要核苷酸分子,细胞内GTP:GDP比值是细胞代谢和信号转导状态的重要指标,但目前尚未有能够实时检测活细胞内的GTP:GDP比值的方法。应用基因编码的荧光探针技术,我们筛选出了首个能特异性检测GTP:GDP比值的荧光探针。该探针由两部分组成:能够与GTP和GDP结合并产生不同构象变化的蛋白,以及对蛋白构象变化敏感的荧光蛋白cpYFP。前期体外实验结果表明,该探针可以对GTP:GDP比值产生荧光信号响应。我们在293T细胞中表达了该探针蛋白,用糖酵解抑制剂处理细胞后,观察到了细胞内GTP:GDP比值的显著下降,我们将继续在其它肿瘤细胞以及神经细胞中检测该探针对GTP:GDP比值的响应,并进一步应用到果蝇的脑中,开发可检测生物体内GTP:GDP比值的新方法。

结项摘要

众所周知,三磷酸鸟苷 (GTP) 和二磷酸鸟苷 (GDP) 的相互转化是多种生物细胞活动不可或缺的组成部分,但迄今为止,还没有可用于直接检测细胞内 GTP 与 GDP 比率的分析方法。 在此,我们报告了 GRISerHR,一种基因编码的荧光生物传感器,用于监测代谢扰动下多种细胞类型和各种细胞器中的 GTP:GDP 比率。 此外,我们描述了由三羧酸 (TCA) 循环酶(琥珀酰辅酶 A 合成酶;SCS-ATP 和 SCS-GTP)和磷酸烯醇丙酮酸 (PEP) 循环酶的两种亚型的基因调节引起的差异线粒体 GTP:GDP 比率 (PEPCK-M)。 因此,我们的 GRISerHR 传感器实现了对活细胞内源性 GTP:GDP 比率动态变化的时空精确检测,有助于加深我们对鸟苷核苷酸在生物学中的能量代谢贡献的理解。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Monitoring the Dynamic Regulation of the Mitochondrial GTP-to-GDP Ratio with a Genetically Encoded Fluorescent Biosensor
使用基因编码荧光生物传感器监测线粒体 GTP 与 GDP 比率的动态调节
  • DOI:
    10.1002/anie.202201266
  • 发表时间:
    2022-07-08
  • 期刊:
    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Zhang,Meiqi;Yang,Bo;Wang,Jing
  • 通讯作者:
    Wang,Jing

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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