A protein-transcriptome atlas of haematopoiesis across the human life span

人类生命周期造血的蛋白质转录组图谱

基本信息

批准号：
MR/S036113/1
负责人：
Berthold Gottgens
金额：
$ 66.11万
依托单位：
University of Cambridge
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2018
资助国家：
英国
起止时间：
2018 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MR%2FS036113%2F1
关键词：
protein transcriptome atlas haematopoiesis across

项目摘要

The cell represents a fundamental unit of biology, as all of our organs are composed of cells, where cells with different specialized functions combine to provide overall functionality. Specialization of cells is perhaps best understood in the blood system, where red blood cells for example are dedicated to carrying oxygen round the body, while a myriad of specialized immune cells help to fight infections. A better understanding of the molecular features that characterize individual cells is not only essential for us to gain a better understanding of how the human body functions normally, but also to be able to design better drugs that can reverse the abnormal behaviour of cells, which causes many diseases including blood cancers and immune disorders.Recent technological innovations have made it possible to map very comprehensively the activity of all genes within single cells, at a scale of thousands of cells at the same time. We propose to utilize one of the latest protocols in this field to map both messenger RNA as well as protein levels, and thus obtain especially detailed insights into the molecular make up of over 550,000 individual blood and immune cells across the human lifespan. Through integration with the wider Human Cell Atlas Initiative, our datasets will deliver an important reference, that will serve as a platform for future studies aiming to reveal the molecular alterations that cause the misbehaviour of blood cells in a broad range of disorders including blood cancers and immune diseases.

该细胞代表生物学的基本单位，因为我们所有的器官均由细胞组成，其中具有不同专业功能的细胞结合在一起以提供整体功能。细胞的专业化可能是在血液系统中最好理解的，例如，红细胞专用于在体内携带氧气，而无数的专门免疫细胞有助于抵抗感染。更好地理解表征单个细胞的分子特征，不仅对我们更好地了解人体的功能，而且还必须能够设计出可以扭转细胞异常行为的更好的药物，这会导致许多疾病引起许多疾病，包括血液癌和免疫创新，使其在整体上均具有相同的细胞，而在千上均具有一定的范围。我们建议利用该领域中的最新方案之一来绘制信使RNA和蛋白质水平，从而特别详细的见解，包括超过550,000个人类寿命中的550,000多个单独的血液和免疫细胞。通过与更广泛的人类细胞地图集的整合，我们的数据集将提供一个重要的参考，该参考将成为未来研究的平台，旨在揭示在包括血液癌和免疫疾病在内的广泛疾病中导致血细胞不良的分子改变。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Additional file 1 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation

基因表达动力学协调变化的附加文件 1 是小鼠和人类红系成熟的基础

DOI：
10.6084/m9.figshare.14913219
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Barile M
通讯作者：
Barile M

Additional file 7 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation

基因表达动力学协调变化的附加文件 7 是小鼠和人类红系成熟的基础

DOI：
10.6084/m9.figshare.14913240
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Barile M
通讯作者：
Barile M

Additional file 5 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation

基因表达动力学协调变化的附加文件 5 是小鼠和人类红系成熟的基础

DOI：
10.6084/m9.figshare.14913231
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Barile M
通讯作者：
Barile M

Coordinated Changes in Gene Expression Kinetics Underlie both Mouse and Human Erythroid Maturation

基因表达动力学的协调变化是小鼠和人类红细胞成熟的基础

DOI：
10.1101/2020.12.21.423773
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Barile M
通讯作者：
Barile M

Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation.

基因表达动力学的协调变化是小鼠和人类红细胞成熟的基础。

DOI：
10.1186/s13059-021-02414-y
发表时间：
2021-07-05
期刊：
Genome biology
影响因子：
12.3
作者：
Barile M;Imaz-Rosshandler I;Inzani I;Ghazanfar S;Nichols J;Marioni JC;Guibentif C;Göttgens B
通讯作者：
Göttgens B

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

Berthold Gottgens其他文献

Edinburgh Research Explorer A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM3 promoter in megakaryocytes near a MEIS1 binding site

爱丁堡研究探索者血小板体积的 GWAS 序列变体标记了 MEIS1 结合位点附近巨核细胞中的替代 DNM3 启动子

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
通讯作者：
Willem H. Ouwehand

GATA transcription in a small rhodamine 123(low)CD34(+) subpopulation of a peripheral blood-derived CD34(-)CD105(+) mesenchymal cell line.

外周血来源的 CD34(-)CD105( ) 间充质细胞系的小罗丹明 123(low)CD34( ) 亚群中的 GATA 转录。

DOI：
发表时间：
2002
期刊：
Experimental Hematology
影响因子：
2.6
作者：
C. Conrad;Berthold Gottgens;S. Kinston;J. Ellwart;R. Huss
通讯作者：
R. Huss

Systematic integration of GATA transcription factors and epigenomes via IDEAS paints the regulatory landscape of mouse hematopoietic cells

通过 IDEAS 系统整合 GATA 转录因子和表观基因组描绘了小鼠造血细胞的调控景观

DOI：
10.1101/730358
发表时间：
2019
期刊：
bioRxiv
影响因子：
0
作者：
R. Hardison;Yu Zhang;C. Keller;Guanjue Xiang;Elisabeth F. Heuston;Lin An;J. Lichtenberg;B. Giardine;D. Bodine;Shaun Mahony;Qunhua Li;Feng Yue;M. Weiss;G. Blobel;James Taylor;J. Hughes;D. Higgs;Berthold Gottgens
通讯作者：
Berthold Gottgens

Explorer A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM 3 promoter in megakaryocytes near a MEIS 1 binding site

Explorer 血小板体积的 GWAS 序列变体标记 MEIS 1 结合位点附近巨核细胞中的替代 DNM 3 启动子

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
通讯作者：
Willem H. Ouwehand

JAK/ stat signalling during normal and pathological myelopoiesis with focus on erythropoiesis and megakaryopoiesis

DOI：
10.1016/j.exphem.2013.05.275
发表时间：
2013-08-01
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Winnie Lau;Caia Dominicus;Rebecca Hannah;Amy Jones;Anthony Green;Berthold Gottgens
通讯作者：
Berthold Gottgens