The cellular immune response to B.1.1.7 variant COVID-19 deciphered by single cell multi-omics

单细胞多组学破译对 B.1.1.7 变体 COVID-19 的细胞免疫反应

基本信息

  • 批准号:
    MR/W014556/1
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    英国
  • 项目类别:
    Research Grant
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    英国
  • 起止时间:
    2021 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Regardless of rapid vaccination programs, the coronavirus SARS-CoV2 is likely to remain a concern for the foreseeable future, because viral pathogens evolve, and acquire mutations that may alter severity of the disease or render current vaccines ineffective. During the 1st wave of coronavirus, we have analysed over 800,000 blood and immune cells from more than 100 patients treated in Cambridge, Newcastle and London. This work provides the largest reference dataset available anywhere to interrogate how blood and immune cells are affected by the infection, and may contribute to fighting it. Given the recent emergence of a more aggressive strain (the so-called UK or Kent variant), there is an urgent need to investigate whether this new variant causes the same changes in blood and immune cells as the original strain. Such information is vital to know whether current therapies need to be amended, and whether there are opportunities to develop new treatments. We propose to answer these important questions by studying 30 patients of the current wave, where the majority are infected with the new variant. Because of time sensitivity, our results will be made available to the wider scientific community as soon as is practicable.
不管快速疫苗接种计划如何,冠状病毒SARS-COV2可能仍然是可预见的未来的关注点,因为病毒病原体会发展并获得可能改变疾病严重程度或使当前疫苗无效的突变。在第一波冠状病毒中,我们分析了在剑桥,纽卡斯尔和伦敦接受100多名患者的800,000多名血液和免疫细胞。这项工作为任何地方提供了最大的参考数据集,以询问血液和免疫细胞如何受感染的影响,并可能有助于对抗它。鉴于最近出现了更具侵略性的菌株(所谓的英国或肯特变体),因此迫切需要研究这种新变体是否会导致血液和免疫细胞与原始菌株相同的变化。这样的信息对于知道是否需要修改当前的疗法以及是否有开发新疗法的机会至关重要。我们建议通过研究30名当前波的患者来回答这些重要问题,其中大多数人都感染了新变体。由于时间的敏感性,我们的结果将在可行的情况下立即提供给更广泛的科学界。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Unique molecular and functional features of extramedullary hematopoietic stem and progenitor cell reservoirs in humans.
  • DOI:
    10.1182/blood.2021013450
  • 发表时间:
    2022-06-09
  • 期刊:
  • 影响因子:
    20.3
  • 作者:
    Mende N;Bastos HP;Santoro A;Mahbubani KT;Ciaurro V;Calderbank EF;Quiroga Londoño M;Sham K;Mantica G;Morishima T;Mitchell E;Lidonnici MR;Meier-Abt F;Hayler D;Jardine L;Curd A;Haniffa M;Ferrari G;Takizawa H;Wilson NK;Göttgens B;Saeb-Parsy K;Frontini M;Laurenti E
  • 通讯作者:
    Laurenti E
Blood and immune development in human fetal bone marrow and Down syndrome.
人类胎儿骨髓和唐氏综合症的血液和免疫发育。
  • DOI:
    10.17863/cam.76568
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Jardine L
  • 通讯作者:
    Jardine L
The impact of hypoxia on B cells in COVID-19.
  • DOI:
    10.1016/j.ebiom.2022.103878
  • 发表时间:
    2022-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Kotagiri P;Mescia F;Hanson AL;Turner L;Bergamaschi L;Peñalver A;Richoz N;Moore SD;Ortmann BM;Dunmore BJ;Morgan MD;Tuong ZK;Cambridge Institute of Therapeutic Immunology and Infectious Disease-National Institute of Health Research (CITIID-NIHR) COVID BioResource Collaboration;Göttgens B;Toshner M;Hess C;Maxwell PH;Clatworthy MR;Nathan JA;Bradley JR;Lyons PA;Burrows N;Smith KGC
  • 通讯作者:
    Smith KGC
Local and systemic responses to SARS-CoV-2 infection in children and adults
儿童和成人对 SARS-CoV-2 感染的局部和全身反应
  • DOI:
    10.17863/cam.89258
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Gottgens B
  • 通讯作者:
    Gottgens B
Single-Cell Protein Analysis - Methods and Protocols
单细胞蛋白质分析 - 方法和实验方案
  • DOI:
    10.1007/978-1-0716-1771-7_13
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mende N
  • 通讯作者:
    Mende N
共 5 条
  • 1
前往

Berthold Gottgens其他文献

Edinburgh Research Explorer A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM3 promoter in megakaryocytes near a MEIS1 binding site
爱丁堡研究探索者血小板体积的 GWAS 序列变体标记了 MEIS1 结合位点附近巨核细胞中的替代 DNM3 启动子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
    Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
  • 通讯作者:
    Willem H. Ouwehand
    Willem H. Ouwehand
GATA transcription in a small rhodamine 123(low)CD34(+) subpopulation of a peripheral blood-derived CD34(-)CD105(+) mesenchymal cell line.
外周血来源的 CD34(-)CD105( ) 间充质细胞系的小罗丹明 123(low)CD34( ) 亚群中的 GATA 转录。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2002
    2002
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    C. Conrad;Berthold Gottgens;S. Kinston;J. Ellwart;R. Huss
    C. Conrad;Berthold Gottgens;S. Kinston;J. Ellwart;R. Huss
  • 通讯作者:
    R. Huss
    R. Huss
Systematic integration of GATA transcription factors and epigenomes via IDEAS paints the regulatory landscape of mouse hematopoietic cells
通过 IDEAS 系统整合 GATA 转录因子和表观基因组描绘了小鼠造血细胞的调控景观
  • DOI:
    10.1101/730358
    10.1101/730358
  • 发表时间:
    2019
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    R. Hardison;Yu Zhang;C. Keller;Guanjue Xiang;Elisabeth F. Heuston;Lin An;J. Lichtenberg;B. Giardine;D. Bodine;Shaun Mahony;Qunhua Li;Feng Yue;M. Weiss;G. Blobel;James Taylor;J. Hughes;D. Higgs;Berthold Gottgens
    R. Hardison;Yu Zhang;C. Keller;Guanjue Xiang;Elisabeth F. Heuston;Lin An;J. Lichtenberg;B. Giardine;D. Bodine;Shaun Mahony;Qunhua Li;Feng Yue;M. Weiss;G. Blobel;James Taylor;J. Hughes;D. Higgs;Berthold Gottgens
  • 通讯作者:
    Berthold Gottgens
    Berthold Gottgens
Explorer A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM 3 promoter in megakaryocytes near a MEIS 1 binding site
Explorer 血小板体积的 GWAS 序列变体标记 MEIS 1 结合位点附近巨核细胞中的替代 DNM 3 启动子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
    Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
  • 通讯作者:
    Willem H. Ouwehand
    Willem H. Ouwehand
JAK/ stat signalling during normal and pathological myelopoiesis with focus on erythropoiesis and megakaryopoiesis
  • DOI:
    10.1016/j.exphem.2013.05.275
    10.1016/j.exphem.2013.05.275
  • 发表时间:
    2013-08-01
    2013-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Winnie Lau;Caia Dominicus;Rebecca Hannah;Amy Jones;Anthony Green;Berthold Gottgens
    Winnie Lau;Caia Dominicus;Rebecca Hannah;Amy Jones;Anthony Green;Berthold Gottgens
  • 通讯作者:
    Berthold Gottgens
    Berthold Gottgens
共 29 条
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
前往

Berthold Gottgens的其他基金

Haematopoiesis in a Dish: From Tissue Dynamics to Molecular Mechanisms
培养皿中的造血作用:从组织动力学到分子机制
  • 批准号:
    MR/W031663/1
    MR/W031663/1
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Research Grant
    Research Grant
A protein-transcriptome atlas of haematopoiesis across the human life span
人类生命周期造血的蛋白质转录组图谱
  • 批准号:
    MR/S036113/1
    MR/S036113/1
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Research Grant
    Research Grant
Joint Wellcome and MRC Centre, ‘Wellcome Trust – Medical Research Council Cambridge Stem Cell Institute’
Wellcome 和 MRC 联合中心、Wellcome Trust 医学研究委员会剑桥干细胞研究所
  • 批准号:
    MC_PC_17230
    MC_PC_17230
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Intramural
    Intramural
Establishment of the haemopoietic transcriptional programme: From systems approaches to molecular mechanisms
造血转录程序的建立:从系统方法到分子机制
  • 批准号:
    BB/I00050X/1
    BB/I00050X/1
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Research Grant
    Research Grant
Transgenic ES Cell Differentiation Systems to replace Transgenic Mouse Analysis of Tissue Specific Regulatory Elements
转基因 ES 细胞分化系统替代转基因小鼠组织特异性调控元件分析
  • 批准号:
    G0900729/1
    G0900729/1
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Research Grant
    Research Grant
Genome-wide analysis of combinatorial cis-regulatory control of early blood progenitor cells
早期血液祖细胞顺式调控组合控制的全基因组分析
  • 批准号:
    G0900951/1
    G0900951/1
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
    Research Grant
    Research Grant

相似国自然基金

基于FCER1G基因介导免疫反应探讨迟发性聋与认知障碍相关性的机制研究
  • 批准号:
    82371141
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
不同类型WASP基因突变对湿疹、血小板减少伴免疫缺陷综合征造血干细胞体内生长的影响
  • 批准号:
    81202365
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
控制肠道病毒71型感染的先天性免疫保护机制及其应用
  • 批准号:
    31270951
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    80.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
WASP基因回复突变对湿疹、血小板减少伴免疫缺陷综合征预后的影响及其细胞学基础
  • 批准号:
    81172878
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    65.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
干扰素刺激基因2',3'环核苷酸磷酸二酯酶(CNP)抗病毒特性的研究
  • 批准号:
    31170853
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Role of Frizzled 5 in NK cell development and antiviral host immunity
Frizzled 5 在 NK 细胞发育和抗病毒宿主免疫中的作用
  • 批准号:
    10748776
    10748776
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
Gain-of-function toxicity in alpha-1 antitrypsin deficient type 2 alveolar epithelial cells
α-1 抗胰蛋白酶缺陷型 2 型肺泡上皮细胞的功能获得毒性
  • 批准号:
    10751760
    10751760
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
Bioorthogonal probe development for highly parallel in vivo imaging
用于高度并行体内成像的生物正交探针开发
  • 批准号:
    10596786
    10596786
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
MAIT cells in lupus skin disease and photosensitivity
MAIT 细胞在狼疮皮肤病和光敏性中的作用
  • 批准号:
    10556664
    10556664
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别:
Microscopy and Image Analysis Core
显微镜和图像分析核心
  • 批准号:
    10557025
    10557025
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.75万
    $ 4.75万
  • 项目类别: