Functional genomics and development of clinical genome editing strategies

功能基因组学和临床基因组编辑策略的开发

基本信息

批准号：
MC_UU_00029/4
负责人：
James Davies
金额：
$ 170.62万
依托单位：
University of Oxford
依托单位国家：
英国
项目类别：
Intramural
财政年份：
2022
资助国家：
英国
起止时间：
2022 至无数据
项目状态：
未结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=MC_UU_00029%2F4
关键词：
Functional genomics development clinical genome

项目摘要

The Davies laboratory aims to understand how the genome is read by the cells of the blood and bone marrow and how the sequence can be edited to treat human disease. This is important because genetic variation in bloodcells alters the susceptibility to many different human diseases including infection, autoimmune disease and malignancy. Genome editing of these cells has the potential to cure many diseases but this technology can only be safely used if we understand the effects of altering the genome sequence. Over 90% of all DNA sequences that are associated with human disease alter how genes are controlled rather than in the protein produced by the gene. The laboratory has world class expertise in developing new techniques for determining the physical structure of DNA within cells, which is key to understanding how the genome functions. We will use this technology to investigate the fundamental principles that control genes. We will also use it to map the key DNA sequences that control genes in important blood and bone marrow cell types. We aim to translate this by developing new and safer ways of editing the genome of bone marrow stem cells which can be transplanted to treat human disease.

戴维斯实验室的目标是了解血液和骨髓细胞如何读取基因组，以及如何编辑序列来治疗人类疾病。这很重要，因为血细胞的遗传变异会改变对许多不同人类疾病的易感性，包括感染、自身免疫性疾病和恶性肿瘤。这些细胞的基因组编辑有可能治愈许多疾病，但只有当我们了解改变基因组序列的影响时，这项技术才能安全使用。与人类疾病相关的所有 DNA 序列中 90% 以上改变了基因的控制方式，而不是改变了基因产生的蛋白质。该实验室在开发确定细胞内 DNA 物理结构的新技术方面拥有世界一流的专业知识，这是了解基因组功能的关键。我们将利用这项技术来研究控制基因的基本原理。我们还将用它来绘制控制重要血液和骨髓细胞类型基因的关键 DNA 序列。我们的目标是通过开发新的、更安全的方法来编辑可移植来治疗人类疾病的骨髓干细胞基因组，从而实现这一目标。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Author Correction: Capture-C: a modular and flexible approach for high-resolution chromosome conformation capture.

作者更正：Capture-C：一种用于高分辨率染色体构象捕获的模块化且灵活的方法。

DOI：
http://dx.10.1038/s41596-023-00860-5
发表时间：
2023
期刊：
Nature protocols
影响因子：
14.8
作者：
Downes DJ
通讯作者：
Downes DJ

Ancient genomic linkage couples metabolism with erythroid development.

古老的基因组连锁将新陈代谢与红细胞发育结合起来。

DOI：
http://dx.10.1101/2023.09.25.558944
发表时间：
2023
期刊：
the preprint server for biology
影响因子：
0
作者：
Preston AE
通讯作者：
Preston AE

Direct correction of haemoglobin E ß-thalassaemia using base editors.

使用碱基编辑器直接校正血红蛋白 E - 地中海贫血。

DOI：
http://dx.10.1038/s41467-023-37604-8
发表时间：
2023
期刊：
Nature communications
影响因子：
16.6
作者：
Badat M
通讯作者：
Badat M

Determining chromatin architecture with Micro Capture-C.

使用 Micro Capture-C 确定染色质结构。

DOI：
http://dx.10.1038/s41596-023-00817-8
发表时间：
2023
期刊：
Nature protocols
影响因子：
14.8
作者：
Hamley JC
通讯作者：
Hamley JC

Pioneer activity distinguishes activating from non-activating SOX2 binding sites.

先锋活性区分激活和非激活 SOX2 结合位点。

DOI：
http://dx.10.15252/embj.2022113150
发表时间：
2023
期刊：
The EMBO journal
影响因子：
0
作者：
Maresca M
通讯作者：
Maresca M

DOI：
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作者：
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James Davies其他文献

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DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
James Davies
通讯作者：
James Davies

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DOI：
10.1097/mco.0000000000000902
发表时间：
2009
期刊：
Current Opinion in Clinical Nutrition and Metabolic Care
影响因子：
3.1
作者：
A. Raby;E. L. Bouder;C. Colmont;James Davies;P. Richards;B. Coles;C. H. George;Simon A. Jones;P. Brennan;N. Topley;M. Labéta
通讯作者：
M. Labéta

Bio-SHARPE: Bioinspired Soft and High Aspect Ratio Pumping Element for Robotic and Medical Applications.

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DOI：
10.1089/soro.2021.0154
发表时间：
2023-05-02
期刊：
Soft robotics
影响因子：
7.9
作者：
James Davies;M. Thai;Harrison Low;P. T. Phan;T. Hoang;N. Lovell;Thanh Nho Do
通讯作者：
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DOI：
发表时间：
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影响因子：
0
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通讯作者：
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DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hana Elasifer;E. Wang;Virginie Prod’homme;James Davies;Simone K. Forbes;Richard J. Stanton;Mihil Patel;Ceri A Fielding;Dawn Roberts;J. Traherne;Nicole Gruber;J. Bugert;Rebecca J. Aicheler;G. W. Wilkinson
通讯作者：
G. W. Wilkinson