Catalytic promiscuity in a protein superfamily

蛋白质超家族中的催化混杂

基本信息

批准号：
BB/I004327/1
负责人：
Florian Hollfelder
金额：
$ 58.55万
依托单位：
University of Cambridge
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2011
资助国家：
英国
起止时间：
2011 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FI004327%2F1
关键词：
Catalytic promiscuity protein superfamily

项目摘要

Understanding of enzyme catalysis remains a daunting challenge, despite intense research efforts in basic and applied research. Our understanding certainly fails the most severe test - that of making catalysts that meet the efficiency of natural enzymes. This proposal addresses the determinants of catalytic efficiency in hydrolytic enzymes, using as a test bed a superfamily of catalysts that are connected by structural homology as members of the alkaline phosphatase superfamily as well as often reciprocal and crosswise catalytic promiscuity. Starting from our recent identification of one remarkable example for multiple promiscuity and high efficiency (Proc. Natl. Acad. Sci - in press, doi/10.1073/pnas.0903951107), we propose to address the factors that determine selectivity and efficiency, by structural and kinetic analysis and by directed evolution.

尽管在基础和应用研究方面付出了巨大的努力，但对酶催化的理解仍然是一项艰巨的挑战。我们的理解肯定没有通过最严格的考验——制造满足天然酶效率的催化剂。该提案解决了水解酶催化效率的决定因素，使用催化剂超家族作为试验台，这些催化剂超家族通过结构同源性作为碱性磷酸酶超家族的成员以及通常相互和交叉的催化混杂而连接。从我们最近发现的一个多重混杂和高效率的显着例子开始（Proc. Natl. Acad. Sci - 出版中，doi/10.1073/pnas.0903951107），我们建议通过结构性的方法来解决决定选择性和效率的因素。和动力学分析以及定向进化。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Reverse evolution leads to genotypic incompatibility despite functional and active site convergence.

尽管功能和活性位点趋同，逆向进化仍会导致基因型不相容。

DOI：
http://dx.10.17863/cam.63718
发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kaltenbach M
通讯作者：
Kaltenbach M

Ultrahigh-throughput discovery of promiscuous enzymes by picodroplet functional metagenomics.

通过皮液滴功能宏基因组学超高通量发现混杂酶。

DOI：
http://dx.10.1038/ncomms10008
发表时间：
2015
期刊：
Nature communications
影响因子：
16.6
作者：
Colin PY
通讯作者：
Colin PY

Evolutionary repurposing of a sulfatase: A new Michaelis complex leads to efficient transition state charge offset.

硫酸酯酶的进化再利用：一种新的米氏复合物导致有效的过渡态电荷抵消。

DOI：
http://dx.10.1073/pnas.1607817115
发表时间：
2018
期刊：
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子：
11.1
作者：
Miton CM
通讯作者：
Miton CM

Specificity Effects of Amino Acid Substitutions in Promiscuous Hydrolases: Context-Dependence of Catalytic Residue Contributions to Local Fitness Landscapes in Nearby Sequence Space

混杂水解酶中氨基酸取代的特异性效应：催化残基对附近序列空间局部适应度景观贡献的上下文依赖性

DOI：
http://dx.10.17863/cam.9842
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bayer C
通讯作者：
Bayer C

Examining the promiscuous phosphatase activity of Pseudomonas aeruginosa arylsulfatase: a comparison to analogous phosphatases.

检查铜绿假单胞菌芳基硫酸酯酶的混杂磷酸酶活性：与类似磷酸酶的比较。

DOI：
http://dx.10.1002/prot.24020
发表时间：
2012
期刊：
Proteins
影响因子：
2.9
作者：
Luo J
通讯作者：
Luo J

DOI：
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作者：
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