The Jackson Laboratory Senescence Tissue Mapping Center (JAX-Sen TMC)

杰克逊实验室衰老组织绘图中心 (JAX-Sen TMC)

基本信息

  • 批准号:
    10552965
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 248.61万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2022-08-15 至 2026-07-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

PROJECT SUMMARY/ABSTRACT OVERALL The Jackson Laboratory (JAX) Cellular Senescence Network Mouse Tissue Mapping Center (JAX-Sen) represents a multi-modal interdisciplinary effort that draws upon existing, longstanding aging research programs at JAX, our role as a consortium site of KAPP-Sen, a funded SenNet human Tissue Mapping Center, and JAX’s close collaboration with UConn Health. JAX-Sen is organized around three cores nested in the well-resourced environment for aging research and multi-omics profiling at JAX. JAX-Sen will profile senescent cells in kidney, adipose tissue, placenta, pancreas, heart, and hypothalamus, selected for their clinical relevance to chronic diseases of aging, the domain expertise of the JAX-Sen leadership team in the biology of these tissues, and the overlap of four of the tissues with KAPP-Sen. We will leverage cutting-edge mouse resources including the Diversity Outbred, which offers unparalleled genetic diversity for modelling a range of molecular senescence phenotypes, and new inbred (C57BL/6J) transgenic mice that express p16 and p21 driven fluorescent tags to allow visualization enrichment for specific senescent cell subsets. The Biological Analysis Core will apply a multitude of analytical modalities to selected tissues (bulk and single cell and single nucleus RNAseq, Visium spatial transcriptomics, multiplexed antibody-based imaging, multiplexFISH, imaging mass spectrometry including lipidomics, metabolomics, proteomics, 3D tissue reconstruction from serial sections), and will re- evaluate these technologies throughout the project period to ensure our approaches align with those of other centers and that we maximally benefit from the technology development efforts in SenNet. These profiling activities will yield subcellular resolution of biomolecular content in senescent cells not possible with human samples, along with an expanded set of senescent cell biomarkers. The Data Analysis Core will combine robust computational capability with scalable and reproducible scientific workflows to develop and implement Network- wide open data and metadata standards. The Data Analysis Core will benefit from JAX’s unique mouse research resources to establish the diversity of senescence by integrating with expression quantitative trait locus and protein quantitative trait locus data in DO mice and JAX bioinformatics resources, e.g., Mouse Genome Informatics, Mouse Phenome Database, Monarch Initiative. The integrative mining of JAX-Sen data will lead to novel methods for multi-modal 3D map reconstruction from imaging data and will yield an important resource for SenNet interpretation and enrichment of human senescent cell data. Finally, the Administrative Core will provide strong oversight of project progress and nurture a culture of collaborative, dynamic scientific exchange within JAX-Sen. It will also maximize JAX-Sen’s engagement in the consortium through collaborative activities that will help optimize data generation activities and create new research synergies. In so doing, JAX-Sen will help achieve the goal of SenNet to generate a unprecedented atlas of mouse senescent cells and new biomarkers of senescence for human analysis and therapeutic application.
项目摘要/摘要总体 杰克逊实验室(JAX)蜂窝sensence网络小鼠组织映射中心(JAX-SEN) 代表了多模式的跨学科工作,它借鉴了现有的长期衰老研究计划 在Jax,我们作为Kapp-Sen的财团站点,资助的Sennet人体组织映射中心和Jax的角色 与UConn Health密切合作。 Jax-sen围绕着三个核心筑巢的核心 JAX的衰老研究和多派分析环境。 JAX-SEN将介绍肾脏中的感觉细胞, 脂肪组织,胎盘,胰腺,心脏和下丘脑与慢性有关 衰老疾病,JAX-SEN领导团队的领域专业知识在这些组织的生物学方面以及 四个组织与Kapp-Sen重叠。我们将利用尖端的鼠标资源,包括 多样性杂种,它提供了无与伦比的遗传多样性,用于建模一系列分子感应 表型和新的近交(C57BL/6J)转基因小鼠,将P16和P21驱动的荧光标签表达为 允许可视化富集特定的感觉细胞子集。生物分析核心将应用 对选定组织的多种分析模态(散装和单细胞和单核RNASEQ,visium 空间转录组学,基于多重抗体的成像,多重鱼类,成像质谱法 包括脂质组学,代谢组学,蛋白质组学,串行切片的3D组织重建),并将重新构建 在整个项目期间评估这些技术,以确保我们的方法与其他技术保持一致 中心,我们从Sennet的技术开发工作中受益最大。这些分析 活性将产生人类不可能的感觉细胞中生物分子含量的亚细胞分辨率 样品,以及一组膨胀的感觉细胞生物标志物。数据分析核心将结合强大的 具有可扩展和可重现的科学工作流的计算能力,以开发和实施网络 - 广泛的开放数据和元数据标准。数据分析核心将受益于JAX独特的鼠标研究 通过与表达定量性状基因座和 DO小鼠和JAX生物信息学资源中的蛋白质定量性状基因座数据,例如小鼠基因组 信息学,鼠标现象数据库,君主倡议。 JAX-SEN数据的集成采矿将导致 来自成像数据的多模式3D地图重建的新方法,将产生重要的资源 人类感觉细胞数据的塞内特解释和富集。最后,行政核心将提供 对项目进步的强烈监督,并为内部的协作,动态科学交流提供护理 Jax-sen。它还将通过合作活动最大化Jax-Sen在财团中的参与 帮助优化数据生成活动并创建新的研究协同作用。这样做,jax-sen会有所帮助 实现Sennet的目标,以产生一个前所未有的小鼠感觉细胞的地图集和新的生物标志物 人类分析和治疗应用的衰老。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Ronny Korstanje其他文献

Ronny Korstanje的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Ronny Korstanje', 18)}}的其他基金

Identification of Kidney Disease Modifier Genes in Mouse and Human Alport Syndrome
小鼠和人类 Alport 综合征中肾脏疾病修饰基因的鉴定
  • 批准号:
    10341489
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
The Jackson Laboratory Senescence Tissue Mapping Center (JAX-Sen TMC)
杰克逊实验室衰老组织绘图中心 (JAX-Sen TMC)
  • 批准号:
    10683385
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Identification of Kidney Disease Modifier Genes in Mouse and Human Alport Syndrome
小鼠和人类 Alport 综合征中肾脏疾病修饰基因的鉴定
  • 批准号:
    10543159
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
PROJECT C
项目C
  • 批准号:
    8277486
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Research Development Core
研究开发核心
  • 批准号:
    10425455
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Research Development Core
研究开发核心
  • 批准号:
    10642721
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Image Analysis Core
图像分析核心
  • 批准号:
    10425459
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Image Analysis Core
图像分析核心
  • 批准号:
    10045029
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Research Development Core
研究开发核心
  • 批准号:
    10261437
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Image Analysis Core
图像分析核心
  • 批准号:
    10261441
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:

相似国自然基金

时空序列驱动的神经形态视觉目标识别算法研究
  • 批准号:
    61906126
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
本体驱动的地址数据空间语义建模与地址匹配方法
  • 批准号:
    41901325
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    22.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
大容量固态硬盘地址映射表优化设计与访存优化研究
  • 批准号:
    61802133
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
IP地址驱动的多径路由及流量传输控制研究
  • 批准号:
    61872252
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    64.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
针对内存攻击对象的内存安全防御技术研究
  • 批准号:
    61802432
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

Opportunistic Atherosclerotic Cardiovascular Disease Risk Estimation at Abdominal CTs with Robust and Unbiased Deep Learning
通过稳健且公正的深度学习进行腹部 CT 机会性动脉粥样硬化性心血管疾病风险评估
  • 批准号:
    10636536
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Improving in vitro preantral follicle development using novel bioengineered culture systems and pre-theca-like cells as a strategy for assisted reproduction
使用新型生物工程培养系统和卵泡膜前样细胞作为辅助生殖策略改善体外窦前卵泡发育
  • 批准号:
    10749434
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Investigating metabolic responses to high sugar diets and the onset of diabetic phenotypes
研究对高糖饮食的代谢反应和糖尿病表型的发生
  • 批准号:
    10719544
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Extracellular Vesicle Delivery System for Treatment of Abdominal Aortic Aneurysm
细胞外囊泡递送系统治疗腹主动脉瘤
  • 批准号:
    10751123
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
Ubiquitin D as a potential therapeutic target for NASH, HCC and chronic kidney diseases
泛素 D 作为 NASH、HCC 和慢性肾脏疾病的潜在治疗靶点
  • 批准号:
    10666292
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 248.61万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了