シスト・ネコブ・ネモグリの寄生環を支える線虫共生コアマイクロバイオームの実態解明

阐明支持包囊、nekobu 和线虫寄生周期的线虫共生核心微生物组的实际状态

基本信息

批准号：
22K19193
负责人：
黒田恭平
金额：
$ 4.16万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19193/
关键词：
植物寄生性線虫共生マイクロバイオーム生物防除

项目摘要

本研究では、植物寄生性線虫と共生するコアマイクロバイオームを同定しその機能を微生物培養・線虫操作・遺伝子レベルで解明することで、生物農薬及び土壌微生物機能を活用した植物寄生性線虫防除技術開発の新たな礎を築くことを目的とする。令和４年度は、サツマイモネコブセンチュウおよびレンコンネモグリセンチュウを対象として、滅菌水洗浄処理の有無などの前処理を施した後に、個々の植物寄生性線虫についてDNAを抽出した。レンコンネモグリセンチュウについては、MiSeq (Illumina) を用いた16S rRNA遺伝子解析を実施し、StaphylococcusやCutibacteriumに感染している個体が存在すること、RickettsiellaやCandidatus Paenicardiniumなどに近縁な最近が共生している可能性があること、などの情報を得た。加えて、PacBio Sequel lleを用いたロングリードシークエンス解析により、レンコンネモグリセンチュウおよびその共生微生物の長いコンティグを得ることに成功した。レンコンネモグリセンチュウについては、寒天上での運動性試験も実施し、運動性の違いが見られた個体を採取し、DNA抽出に成功した。さらに、異なる防除処理に暴露された植物寄生性線虫を採取するため、バチルス属細菌を含む生物農薬や化学農薬オンコル、天然資材などを添加したレンコン栽培試験を実施し、共生マイクロバイオーム同定のための試験区も作製し試験している。このように植物寄生性線虫の共生コアマイクロバイオームの同定に向けた準備を着実に進めることができている。

这项研究旨在通过鉴定与植物寄生虫线虫共存并阐明其在微生物培养物，黑生虫的操纵和基因级，来利用生物农药和土壤微生物功能的发展植物寄生虫控制技术的新基础。在2022财年中，从单个植物寄生线虫中提取DNA，包括对红薯猫线虫的预处理和莲莲根线虫，包括它们是否被无菌水洗涤。关于Lotus root线虫，使用Miseq（Illumina）进行了16S rRNA基因分析，以获取信息，例如感染了葡萄球菌和cutibacterium的个体，以及最近的亲戚（例如Rickettsiella and Candidatus paenicarcinium）可能正在同时存在。此外，使用PACBIO续集LLE的长读序列分析已成功获得了莲根线虫及其共生微生物的长关键。对于莲根线虫，还对琼脂进行了运动测试，并收集了运动性差异并成功提取DNA的个体。此外，为了收集暴露于不同控制治疗的植物寄生线虫，使用生物农药，化学农药Oncol，天然材料等进行了莲根培养测试，以收集分别生物的微生物。这样，可以稳步进步来鉴定植物寄生线虫的共生核心微生物组的准备。