海洋保護区設置にむけた宝石サンゴ類の重要海域および再生産機構の解明

阐明建立海洋保护区的珍贵珊瑚的重要区域和繁殖机制

基本信息

批准号：
22KJ1108
负责人：
高田健司
金额：
$ 2.18万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

初年度は、宝石サンゴの生息域・生物量・生息環境を推定するために、宝石サンゴの飼育水槽から環境DNAを検出する実験と新たな海域での野外海水・環境データ(化学・物理データ)収集、生物データを取得するためのメタゲノム解析の設備準備や知識習得を行った。まずは、飼育実験下で採水した海水から宝石サンゴ由来の環境DNAを検出できるか検証するため、設計した宝石サンゴ特異的なプライマーとプローブを用いたデジタルPCRによる絶対定量を行った。その結果、宝石サンゴ由来の環境DNAを検出できただけでなく、サンゴの群体数が増えれば、環境DNAの量も比例して増えることを確認した。また、昨年度に引き続き、日本国内の宝石サンゴの生息域と思われる海域でROV調査およびCTDによる海水採取を行い、今年度は奄美諸島から九州西部にかけて、40地点から生物統計モデルに必要な環境データ(化学・物理データ)を、11地点から野外の海水サンプルを入手した。採取した海水はフィルターでろ過し、昨年度と来年度の調査サンプルと次年度に合わせて解析するため、長期保存できるように固定した。環境データのうち生物データに関しては、次年度に行う18S領域を用いたメタゲノム解析に向けて、実験試薬・備品の整備や解析パイプラインの学習をおこなった。設備準備や知識習得を踏まえて、次年度に向けた実験計画の見直しを行った。初年度における研究活動中の研究成果公表ついては、第一著者として国際学会で口頭発表を1つ行った。

第一年，为了估算宝石珊瑚的栖息地、生物量和栖息地，我们将进行实验，检测宝石珊瑚繁殖池的环境DNA，以及新海域的实地海水和环境数据（化学和物理数据）我们准备了宏基因组分析的设备和知识，以收集和获取生物数据。首先，为了验证是否可以从繁殖实验中收集的海水中检测到源自宝石珊瑚的环境 DNA，我们使用设计的宝石珊瑚特异性引物和探针，使用数字 PCR 进行绝对定量。结果，他们不仅检测到了源自宝石珊瑚的环境DNA，而且还证实，随着珊瑚群落数量的增加，环境DNA的数量也成比例增加。此外，继去年之后，我们在日本被认为是宝石珊瑚栖息地的海域进行了ROV调查和使用CTD的海水采样。今年，我们从奄美群岛的40个地点收集了生物统计模型所需的环境数据。九州西部（化学和物理数据）是从 11 个地点的现场海水样本中获得的。收集到的海水经过过滤和固定后长期储存，以便与去年和明年的调查样本结合进行分析。对于环境数据中的生物数据，我们准备了实验试剂和设备，学习了分析流程，为明年利用18S区域进行宏基因组分析做准备。在设备准备和知识获取的基础上，审定了明年的实验计划。关于第一年研究活动中研究成果的发表，我作为第一作者在国际会议上做了口头报告。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Population genetic analysis for deep-sea corals and reef-building corals in Japan using genome-wide SNP data

使用全基因组 SNP 数据对日本深海珊瑚和造礁珊瑚进行种群遗传分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yuta Fujisawa;Pier-luc Champagne;Yoshimitsu Itoh;Takuzo Aida;Kenji Takata
通讯作者：
Kenji Takata

Hidden linegaes and potential deep to shallow connectivity of the brooding coral, Seriatopora hystrix

孵化珊瑚（Seriatopora hystrix）的隐藏线系和潜在的深浅连接

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yuta Fujisawa;Yiling Nan;Atsushi Asano;Yu Yanagisawa;Keiichi Yano;Yoshimitsu Itoh;Takuzo Aida;Kenji Takata
通讯作者：
Kenji Takata