広域集団ゲノム解析によるアオサンゴの異時的な種分化起源と分子機構の解明

通过广域种群基因组分析阐明蓝珊瑚异时物种形成的起源和分子机制

• 批准号: 19J21342
• 负责人: 谷中 絢貴
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J21342/
• 关键词: アオサンゴ; 八放サンゴ; MIG-seq; 系統地理; 系統解析; 集団遺伝解析; インド太平洋; サンゴ礁生態系; 種分化; インド太平洋系統地理解析; 生殖時期の異時性; 生物時計

前年度までにMIG-seq法に基づく集団遺伝学的・系統学的解析によって明らかにしたインド太平洋広域のアオサンゴ属の系統地理パターンについて、第一著者として査読付き国際学術誌（Frontiers in Marine Science）へ公表するとともに、前年度から延期されていた国際学会（ICRS2021）で口頭発表を行った。また本研究過程で、サンゴ礁に生息する同一のアオサンゴ集団内で生じる配偶子・幼生分散距離推定を目的に、MIG-seq解析およびマイクロサテライト解析による空間自己相関分析を行った結果、アオサンゴは同一個体群内でも狭い空間範囲で強い遺伝構造を有し、配偶子・幼生の分散範囲は先行研究の野外実測データとほぼ一致する約４００m以内に限られることを遺伝学的にも裏付けた。この結果は、底生性海洋生物種の野外における幼生分散実測値と空間遺伝構造学的推定値を検証した初の研究例であり、共同第一著者として査読付き国際学術誌（Frontiers in Marine Science）へ公表した。生物時計遺伝子に関連するアオサンゴ種分化の分子機構解明研究については、初年度に実施した予備実験以降、収束しないコロナ感染拡大や現地の研究協力機関の受け入れ制限や判断を受け、前年度に引き続き、最終年度である今年度内も沖縄県での現地フィールド調査および飼育実験が実施できなかった。その結果、網羅的な発現遺伝解析に必要十分量のサンプルが確保できず、本研究の目的達成の鍵となるアオサンゴの生物時計遺伝子群の同定および発現動態解明にまで至らなかった。最終年度の研究成果の公表については、上記の第一著者としての査読付き国際学術誌２報に加え、共著者として査読付き国際学術誌３報を公表し、計５報の論文をリリースした。学会発表は、上記の第一著者としての国際学会発表１つに加え、共著者として国内学会発表１つを行った。

印度太平洋地区的蓝珊瑚物种的植物地理学模式通过基于上一年的Mig-Seq方法的种群遗传和系统发育分析揭示，在同行评审的国际杂志（海洋科学领域）中发表在《海洋科学》中，并在国际科学学会（ICRS202222）进行了口头介绍。此外，在这项研究的过程中，我们使用Mig-Seq和Microsatellite分析进行了空间自相关分析，以估计在同一蓝色的珊瑚礁中发生的配子和幼虫差异差异，并且居住在珊瑚礁中，并且在遗传上，蓝色珊瑚在狭窄的空间中甚至在同一范围内具有强大的遗传结构，并且该范围限制了该范围的范围，并且该范围限制了该范围，并且该范围限制了该范围，并且该范围限制了该范围，并且该范围是GameTe of Gameets of Gameeth and age nive sege of Game的范围。大致与先前研究的现场数据一致。该结果是第一个研究该领域底栖海种的实际幼虫方差和空间遗传结构估计值的研究，并发表在同行评审的海洋科学领域国际边境杂志上，是第一位合着者。关于在第一年进行初步实验之后，对与生物钟基因相关的蓝珊瑚物种的分子机制进行研究，此前COVID-19感染的蔓延无关，以及对当地研究合作伙伴机构接受的限制，研究人员无法在Okinawa Prefact上进行现场调查和繁殖实验，这是一年的最终成绩。结果，我们无法获得足够数量的全面表达遗传分析所需的样本，并且我们无法识别和阐明蓝色珊瑚生物钟基因的表达动力学，这对于实现这项研究的目标是关键。关于最后一年的研究结果的发表，除了上述第二次同行评审的国际学术期刊外，他还作为共同作者出版了三本同行评审的国际学术期刊，并发表了五篇论文。除了在国际会议上作为第一作者的上述演讲外，该会议还在国内会议上担任合着者。

项目成果

Limited fine-scale larval dispersal of the threatened brooding corals Heliopora spp. as evidenced by population genetics and numerical simulation

受威胁的孵卵珊瑚 Heliopora spp. 的幼虫小规模扩散有限。

• DOI: 10.1007/s10592-019-01228-7
• 发表时间: 2019
• 期刊: Conservation Genetics
• 影响因子: 2.2
• 作者: Taninaka H.;Bernardo L.;Saito Y.;Nagai S.;Ueno M.;Kitano Y.;Nakamura T.;Yasuda N.
• 通讯作者: Yasuda N.

Phylogeography of Blue Corals (Genus Heliopora) Across the Indo-West Pacific

印度-西太平洋蓝珊瑚（Heliopora 属）的系统发育地理学

• DOI: 10.3389/fmars.2021.714662
• 发表时间: 2021
• 期刊: Frontiers in Marine Science
• 影响因子: 3.7
• 作者: Taninaka Hiroki;Maggioni Davide;Seveso Davide;Huang Danwei;Townsend Abram;Richards Zoe T.;Tang Sen-Lin;Wada Naohisa;Kikuchi Taisei;Yuasa Hideaki;Kanai Megumi;De Palmas Stephane;Phongsuwan Niphon;Yasuda Nina
• 通讯作者: Yasuda Nina

Comparison of the genetic diversity and connectivity of the commercially important precious corals Corallium Japonicum and Pleurocorallium Konojoi using high-throughput sequencing and the implications for conservation

使用高通量测序比较具有商业价值的珍贵珊瑚 Corallium Japonicum 和 Pleurocorallium Konojoi 的遗传多样性和连通性及其对保护的影响

• 发表时间: 2019
• 期刊: Proceedings of 2019 International Conference on CLIMATE CHANGE, DISASTER MANAGEMENT and ENVIRONMENTAL SUSTAINABILITY organized by CWMD, Kumamoto University
• 作者: Kenji Takata;Hiroki Taninaka;Masanori Nonaka;Fumihito Iwase;Taisei Kikuchi;Yoshihisa Suyama;Satoshi Nagai;Nina Yasuda
• 通讯作者: Nina Yasuda

An integrated approach revealed on-going speciation in the living fossil coral (Heliopora coerulea) in Japan

综合方法揭示了日本活化石珊瑚（Heliopora coerulea）中正在进行的物种形成

• 发表时间: 2019
• 作者: Kenji Takata;Hiroki Taninaka;Masanori Nonaka;Fumihito Iwase;Taisei Kikuchi;Yoshihisa Suyama;Satoshi Nagai;Nina Yasuda;Hiroki Taninaka
• 通讯作者: Hiroki Taninaka

Multiplexed ISSR genotyping by sequencing distinguishes two precious coral species (Anthozoa: Octocorallia: Coralliidae) that share a mitochondrial haplotype

通过测序进行多重 ISSR 基因分型区分了共享线粒体单倍型的两种珍贵珊瑚物种（Anthozoa：Octocorallia：Coralliidae）

• DOI: 10.7717/peerj.7769
• 发表时间: 2019
• 期刊: PeerJ
• 影响因子: 2.7
• 作者: Takata K.;Taninaka H.;Nonaka M.;Iwase F.;Kikuchi T.;Suyama Y.;Nagai S.;Yasuda N
• 通讯作者: Yasuda N