Strategic use of environmental DNA measurement technology for infectious disease control among the poor through integration with other academic fields

通过与其他学术领域的结合，战略性地利用环境DNA测量技术来控制穷人的传染病

• 批准号: 21K19656
• 负责人: 金子 聰
• 金额: $ 4.08万
• 依托单位: Nagasaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19656/
• 关键词: 顧みられない熱帯病; 環境DNA; 疫学; 環境中病原体; 疫学情報; 統合

本研究は、環境中から直接、感染する「顧みられない熱帯病（NTDs）」であるメコン住血吸虫と真菌菌腫（マイセトーマ）を疾病対象とし、環境DNA網羅的解析、環境の化学的性状、疫学情報、土地利用情報を組み合わせ、新しい研究領域を模索することを目的とする。調査対象国は、前者をラオス人民民主共和国南部地域（メコン住血吸虫）、後者をスーダン共和国（真菌菌腫）としているが、新型コロナウイルス感染症パンデミックの影響から、その活動開始は大幅に遅れている。令和4年度の研究活動としては、新型コロナウイルス感染症パンデミックの影響からの脱却をめざした調査実施に向けた打ち合わせと関係各所の再調整を行った。具体的には、1. ラオス、スーダンにおける疫学調査体制の構築に向けての検討の継続、2. 生物多様性条約に基づく試料の対象国からの持ち出しに関する調整の継続、3. フィールド調査の協力体制の確立、4. 環境・生態データ取得の予備実験の継続と現地活動に対する準備を継続した。1.と2.に関しては、ラオス熱帯公衆衛生研究所ならびにスーダンのハルツーム大学マイセトーマ研究センターとの倫理委員会承認、ならびに研究計画承認のための書類準備を継続した。3.については、ラオス・スーダンの現地コーディネーターや研究者と適宜連絡を取りながら、現地での調査体制づくりを継続した。4.に関しては、調査に必要な実験機器・試薬の購入、輸出の準備を継続した。本研究で用いる試薬の多くは現地購入が困難であることから、日本国内での購入、非該当証明書の手配、輸出準備を行い、調査に向けての準備を行った。調査実施が遅れているものの、今後、調査実施の遅延を取り戻すべく、調査体制の再構築を図っている状況である。

这项研究针对湄公河血吸虫和足菌肿这两种直接从环境传播的“被忽视的热带病（NTD）”，旨在通过结合流行病学信息和土地利用信息来探索新的研究领域。此次调查的目标国家为老挝人民民主共和国南部地区（湄公河血吸虫）和苏丹共和国（足菌肿），但由于新冠病毒大流行的影响，活动的开始时间大幅推迟。 有。 2020财年的研究活动包括相关各方之间的会议和调整，以开展旨在摆脱新型冠状病毒大流行影响的研究。具体而言，1. 继续讨论在老挝和苏丹建立流行病学研究系统； 2. 继续根据《生物多样性公约》协调从目标国家移走样本； 3. 建立实地研究合作。系统，4.继续进行初步实验以获得环境和生态数据，并为实地活动做准备。关于1.和2.，我们继续与老挝人民民主共和国热带公共卫生研究所和苏丹喀土穆大学菌肿研究中心一起准备伦理委员会批准和研究计划批准的文件。 3.我们继续建立现场研究体系，同时与老挝和苏丹当地协调员和研究人员保持联系。四、继续采购调查所需的实验设备和试剂，做好出口准备。由于本研究中使用的许多试剂在当地很难购买，我们在日本购买了这些试剂，并办理了不适用证明，并做好了出口准备。尽管调查的实施有所延迟，但正在努力重建调查系统以弥补延迟。

项目成果

Detection of a group of pathogenic fungi in soils of mycetoma endemic region in the arid area of the Republic of Sudan

苏丹共和国干旱区足菌肿流行区土壤中一组病原真菌的检测

• 发表时间: 2021
• 作者: Hiroki Hashizume;Suguru Taga;Masayuki K Sakata;Mahmoud Hussein Mohamed Taha;Emmanuel Edwar Siddig;Toshifumi Minamoto;Ahmed Hassan Fahal;Satoshi Kaneko
• 通讯作者: Satoshi Kaneko

ハルツーム大学マイセトーマ研究所(スーダン)

喀土穆大学足菌肿研究所（苏丹）

ラオス熱帯公衆衛生研究所(ラオス)

老挝热带公共卫生研究所（老挝）